MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment c

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167352	A	7	7	118	124	100 %	0 %	0 %	0 %	294679246
2	NT_167352	A	6	6	205	210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_167352	T	7	7	371	377	0 %	100 %	0 %	0 %	294679247
4	NT_167352	T	6	6	492	497	0 %	100 %	0 %	0 %	294679247
5	NT_167352	A	6	6	843	848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_167352	T	6	6	868	873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167352	A	7	7	1017	1023	100 %	0 %	0 %	0 %	294679248
8	NT_167352	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167352	T	7	7	1368	1374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_167352	A	6	6	1649	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	294679249
11	NT_167352	T	7	7	1813	1819	0 %	100 %	0 %	0 %	294679249
12	NT_167352	T	8	8	1843	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167352	A	6	6	1863	1868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167352	T	7	7	2037	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167352	T	7	7	2052	2058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167352	T	7	7	2094	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167352	T	6	6	2132	2137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_167352	T	9	9	2146	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167352	T	6	6	2180	2185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167352	A	6	6	2186	2191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167352	A	6	6	2398	2403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167352	A	6	6	2547	2552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167352	A	6	6	2604	2609	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
24	NT_167352	T	6	6	2656	2661	0 %	100 %	0 %	0 %	294679250
25	NT_167352	A	6	6	2868	2873	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
26	NT_167352	A	7	7	2942	2948	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
27	NT_167352	A	6	6	3015	3020	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
28	NT_167352	A	6	6	3029	3034	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
29	NT_167352	A	6	6	3039	3044	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
30	NT_167352	A	6	6	3326	3331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_167352	A	7	7	3437	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_167352	T	6	6	3520	3525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_167352	T	6	6	3595	3600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_167352	A	6	6	3624	3629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_167352	C	10	10	3653	3662	0 %	0 %	0 %	100 %	294679251
36	NT_167352	T	9	9	3692	3700	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
37	NT_167352	T	6	6	3734	3739	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
38	NT_167352	T	8	8	3758	3765	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
39	NT_167352	T	7	7	3769	3775	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
40	NT_167352	T	7	7	3899	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_167352	T	6	6	3929	3934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_167352	A	8	8	4015	4022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_167352	T	7	7	4167	4173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_167352	T	8	8	4182	4189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_167352	T	6	6	4501	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_167352	T	6	6	4944	4949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_167352	T	6	6	4977	4982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_167352	T	7	7	5104	5110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_167352	A	8	8	5336	5343	100 %	0 %	0 %	0 %	294679253
50	NT_167352	A	7	7	5365	5371	100 %	0 %	0 %	0 %	294679253
51	NT_167352	A	6	6	5382	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	294679253
52	NT_167352	A	7	7	5410	5416	100 %	0 %	0 %	0 %	294679253
53	NT_167352	A	6	6	5463	5468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_167352	T	6	6	5622	5627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_167352	A	6	6	5668	5673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_167352	T	7	7	5795	5801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_167352	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_167352	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_167352	A	6	6	5949	5954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_167352	A	6	6	6024	6029	100 %	0 %	0 %	0 %	294679255
61	NT_167352	T	6	6	6095	6100	0 %	100 %	0 %	0 %	294679255
62	NT_167352	A	6	6	6110	6115	100 %	0 %	0 %	0 %	294679255
63	NT_167352	T	6	6	6144	6149	0 %	100 %	0 %	0 %	294679255
64	NT_167352	T	7	7	6557	6563	0 %	100 %	0 %	0 %	294679255
65	NT_167352	A	7	7	6582	6588	100 %	0 %	0 %	0 %	294679255
66	NT_167352	A	6	6	6608	6613	100 %	0 %	0 %	0 %	294679255
67	NT_167352	T	9	9	6713	6721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.