MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	CTTTG	2	10	383	392	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NT_167351	TTTAT	2	10	898	907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_167351	AACAT	2	10	1143	1152	60 %	20 %	0 %	20 %	294679223
4	NT_167351	AAGAA	2	10	2005	2014	80 %	0 %	20 %	0 %	294679224
5	NT_167351	ATCAA	2	10	2373	2382	60 %	20 %	0 %	20 %	294679224
6	NT_167351	TATAT	2	10	2889	2898	40 %	60 %	0 %	0 %	294679225
7	NT_167351	TTAAA	2	10	3114	3123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_167351	TTTTA	2	10	3168	3177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167351	CCACA	2	10	3484	3493	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NT_167351	AAATA	2	10	3649	3658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167351	ACATA	2	10	3800	3809	60 %	20 %	0 %	20 %	294679227
12	NT_167351	ATTAA	2	10	5267	5276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167351	TTTAA	2	10	6240	6249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167351	TATAT	2	10	6372	6381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167351	ACAAA	2	10	8620	8629	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NT_167351	CTAAC	2	10	9386	9395	40 %	20 %	0 %	40 %	294679237
17	NT_167351	ATTAA	2	10	9445	9454	60 %	40 %	0 %	0 %	294679237
18	NT_167351	AAAAT	2	10	9571	9580	80 %	20 %	0 %	0 %	294679237
19	NT_167351	AAACT	2	10	9851	9860	60 %	20 %	0 %	20 %	294679238
20	NT_167351	CAATT	2	10	11398	11407	40 %	40 %	0 %	20 %	294679240
21	NT_167351	TATAA	2	10	13554	13563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167351	ATATT	2	10	15113	15122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167351	AAAGA	2	10	15387	15396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.