MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	TAAT	2	8	3667	3674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_167351	AAAG	2	8	3980	3987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NT_167351	TAAT	2	8	4057	4064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_167351	TATT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_167351	AGAT	2	8	4923	4930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NT_167351	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167351	ACAT	2	8	5066	5073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NT_167351	TAAA	3	12	5114	5125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167351	ATCA	2	8	5136	5143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NT_167351	TGTT	2	8	5331	5338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167351	TTAA	2	8	6133	6140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167351	TAAA	3	12	6211	6222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167351	AATA	2	8	6630	6637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167351	CATA	2	8	6726	6733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NT_167351	ATTA	2	8	6770	6777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167351	CGAA	2	8	8717	8724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NT_167351	TTAG	2	8	9129	9136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NT_167351	AATT	2	8	9205	9212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167351	TTTA	2	8	12475	12482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167351	TTAT	2	8	13431	13438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167351	CTAT	2	8	14307	14314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NT_167351	TAAA	2	8	14598	14605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167351	ATAA	2	8	14621	14628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167351	AAGT	2	8	14863	14870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.