MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	TAA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_167351	TCT	2	6	472	477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_167351	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_167351	GTA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NT_167351	TAA	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_167351	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167351	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_167351	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167351	TAT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_167351	TAA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167351	ATT	2	6	1019	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167351	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_167351	ATT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167351	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167351	TTC	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_167351	TAA	2	6	1319	1324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167351	TAT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_167351	AGG	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167351	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167351	ATT	2	6	3151	3156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167351	TAT	2	6	3230	3235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167351	TTG	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167351	TAA	2	6	3439	3444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167351	TTG	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_167351	AGA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_167351	AAG	2	6	3585	3590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_167351	AAT	2	6	3599	3604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_167351	CTT	2	6	3605	3610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_167351	TAA	2	6	3837	3842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_167351	AAG	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NT_167351	TAA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_167351	TAT	2	6	4153	4158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_167351	TAA	2	6	4229	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_167351	ATC	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_167351	ATT	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_167351	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_167351	ATA	3	9	5083	5091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_167351	TAA	2	6	5099	5104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_167351	ATT	3	9	5207	5215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_167351	AAG	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_167351	TGA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_167351	AGA	2	6	5567	5572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_167351	ATA	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_167351	CAG	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_167351	TAT	2	6	5800	5805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_167351	ATT	2	6	6275	6280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_167351	ATT	4	12	6355	6366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_167351	TAA	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_167351	ATT	2	6	6622	6627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_167351	ATA	2	6	6647	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_167351	AAT	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_167351	AAT	2	6	6878	6883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_167351	CTA	2	6	6974	6979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_167351	ATT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_167351	ATT	2	6	7659	7664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_167351	AGC	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_167351	CAA	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_167351	TAA	2	6	8010	8015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_167351	CTT	2	6	8031	8036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_167351	GAA	2	6	8518	8523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NT_167351	GAA	2	6	8580	8585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_167351	TAG	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_167351	ATT	2	6	9027	9032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_167351	AGA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_167351	AAT	2	6	9081	9086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_167351	TAA	3	9	12511	12519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_167351	AGT	2	6	12599	12604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_167351	ATT	2	6	12623	12628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_167351	GAA	2	6	12979	12984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_167351	AGA	2	6	13031	13036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NT_167351	TAA	2	6	13201	13206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_167351	AGT	2	6	13323	13328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_167351	TTA	2	6	13383	13388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_167351	TAT	3	9	13436	13444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_167351	CTT	2	6	13469	13474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_167351	GAA	2	6	13498	13503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NT_167351	TCT	2	6	14274	14279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_167351	AGC	2	6	14398	14403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_167351	TGA	2	6	14404	14409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_167351	ATC	2	6	14422	14427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_167351	TTC	2	6	14428	14433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_167351	TAA	2	6	14566	14571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_167351	ATT	2	6	14629	14634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_167351	TAA	2	6	14638	14643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_167351	TAA	2	6	14686	14691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_167351	ATA	2	6	14700	14705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_167351	TAT	2	6	14826	14831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_167351	TAA	2	6	14950	14955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_167351	TAA	2	6	15039	15044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_167351	ATA	2	6	15106	15111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.