MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	A	6	6	41	46	100 %	0 %	0 %	0 %	294679221
2	NT_167351	A	6	6	69	74	100 %	0 %	0 %	0 %	294679221
3	NT_167351	T	8	8	194	201	0 %	100 %	0 %	0 %	294679222
4	NT_167351	A	6	6	343	348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_167351	T	9	9	529	537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_167351	T	7	7	603	609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167351	T	6	6	611	616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_167351	A	7	7	617	623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167351	T	7	7	824	830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_167351	A	6	6	831	836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167351	T	6	6	885	890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167351	T	6	6	1075	1080	0 %	100 %	0 %	0 %	294679223
13	NT_167351	A	9	9	1544	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
14	NT_167351	A	6	6	1654	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
15	NT_167351	A	6	6	1742	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
16	NT_167351	A	7	7	1784	1790	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
17	NT_167351	A	7	7	1939	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
18	NT_167351	A	7	7	1951	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
19	NT_167351	A	6	6	2110	2115	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
20	NT_167351	A	6	6	2297	2302	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
21	NT_167351	A	8	8	2427	2434	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
22	NT_167351	A	7	7	2444	2450	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
23	NT_167351	A	9	9	2570	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
24	NT_167351	A	6	6	2618	2623	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
25	NT_167351	A	8	8	2699	2706	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
26	NT_167351	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
27	NT_167351	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
28	NT_167351	A	6	6	2967	2972	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
29	NT_167351	A	6	6	2978	2983	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
30	NT_167351	A	6	6	3087	3092	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
31	NT_167351	T	7	7	3155	3161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_167351	T	6	6	3235	3240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_167351	A	6	6	3252	3257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_167351	T	6	6	3295	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_167351	A	6	6	3384	3389	100 %	0 %	0 %	0 %	294679226
36	NT_167351	A	6	6	3511	3516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_167351	A	6	6	3541	3546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_167351	A	6	6	3572	3577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_167351	A	6	6	3624	3629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_167351	A	7	7	3697	3703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_167351	G	8	8	3718	3725	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NT_167351	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	294679227
43	NT_167351	A	8	8	3952	3959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_167351	A	7	7	4068	4074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_167351	A	6	6	4112	4117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_167351	T	6	6	4299	4304	0 %	100 %	0 %	0 %	294679228
47	NT_167351	T	6	6	4474	4479	0 %	100 %	0 %	0 %	294679228
48	NT_167351	T	6	6	4621	4626	0 %	100 %	0 %	0 %	294679228
49	NT_167351	A	7	7	4737	4743	100 %	0 %	0 %	0 %	294679228
50	NT_167351	A	7	7	5425	5431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_167351	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_167351	A	6	6	5559	5564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_167351	A	7	7	6036	6042	100 %	0 %	0 %	0 %	294679229
54	NT_167351	T	7	7	6410	6416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_167351	T	6	6	6602	6607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_167351	A	7	7	6913	6919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_167351	A	9	9	7008	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_167351	T	7	7	7129	7135	0 %	100 %	0 %	0 %	294679230
59	NT_167351	T	6	6	7172	7177	0 %	100 %	0 %	0 %	294679230
60	NT_167351	T	7	7	7389	7395	0 %	100 %	0 %	0 %	294679231
61	NT_167351	A	6	6	7682	7687	100 %	0 %	0 %	0 %	294679233
62	NT_167351	T	6	6	7977	7982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_167351	A	6	6	8069	8074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_167351	A	6	6	8200	8205	100 %	0 %	0 %	0 %	294679235
65	NT_167351	A	7	7	8259	8265	100 %	0 %	0 %	0 %	294679235
66	NT_167351	A	7	7	8386	8392	100 %	0 %	0 %	0 %	294679235
67	NT_167351	A	8	8	8396	8403	100 %	0 %	0 %	0 %	294679235
68	NT_167351	A	6	6	8530	8535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_167351	A	6	6	8590	8595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_167351	A	6	6	8671	8676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_167351	A	6	6	9055	9060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_167351	A	7	7	9149	9155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_167351	T	6	6	9285	9290	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
74	NT_167351	T	7	7	9307	9313	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
75	NT_167351	T	6	6	9432	9437	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
76	NT_167351	T	6	6	9697	9702	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
77	NT_167351	T	6	6	9717	9722	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
78	NT_167351	T	6	6	9800	9805	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
79	NT_167351	A	7	7	9818	9824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_167351	T	7	7	9840	9846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_167351	T	6	6	10595	10600	0 %	100 %	0 %	0 %	294679238
82	NT_167351	T	7	7	10607	10613	0 %	100 %	0 %	0 %	294679238
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84	NT_167351	T	7	7	10735	10741	0 %	100 %	0 %	0 %	294679239
85	NT_167351	A	6	6	10770	10775	100 %	0 %	0 %	0 %	294679239
86	NT_167351	T	6	6	10783	10788	0 %	100 %	0 %	0 %	294679239
87	NT_167351	T	6	6	10879	10884	0 %	100 %	0 %	0 %	294679239
88	NT_167351	T	8	8	10994	11001	0 %	100 %	0 %	0 %	294679239
89	NT_167351	T	6	6	11092	11097	0 %	100 %	0 %	0 %	294679239
90	NT_167351	T	6	6	11201	11206	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
91	NT_167351	T	6	6	11318	11323	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
92	NT_167351	T	6	6	11392	11397	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
93	NT_167351	T	6	6	11499	11504	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
94	NT_167351	T	8	8	11539	11546	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
95	NT_167351	T	6	6	11554	11559	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
96	NT_167351	T	7	7	11682	11688	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
97	NT_167351	T	7	7	11761	11767	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
98	NT_167351	T	7	7	11806	11812	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
99	NT_167351	T	8	8	11917	11924	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
100	NT_167351	T	7	7	11959	11965	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
101	NT_167351	T	6	6	12245	12250	0 %	100 %	0 %	0 %	294679240
102	NT_167351	T	7	7	12309	12315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_167351	A	6	6	12445	12450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_167351	T	7	7	12677	12683	0 %	100 %	0 %	0 %	294679241
105	NT_167351	T	6	6	12882	12887	0 %	100 %	0 %	0 %	294679241
106	NT_167351	A	6	6	12922	12927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NT_167351	A	8	8	12983	12990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_167351	T	6	6	12996	13001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_167351	A	6	6	13014	13019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_167351	A	9	9	13050	13058	100 %	0 %	0 %	0 %	294679242
112	NT_167351	T	7	7	13105	13111	0 %	100 %	0 %	0 %	294679242
113	NT_167351	T	7	7	13176	13182	0 %	100 %	0 %	0 %	294679242
114	NT_167351	A	7	7	13815	13821	100 %	0 %	0 %	0 %	294679243
115	NT_167351	T	6	6	13980	13985	0 %	100 %	0 %	0 %	294679243
116	NT_167351	T	6	6	14019	14024	0 %	100 %	0 %	0 %	294679243
117	NT_167351	A	6	6	14036	14041	100 %	0 %	0 %	0 %	294679243
118	NT_167351	A	6	6	14192	14197	100 %	0 %	0 %	0 %	294679243
119	NT_167351	T	6	6	14281	14286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_167351	A	9	9	14295	14303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_167351	T	6	6	14612	14617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_167351	A	8	8	14752	14759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_167351	A	6	6	14817	14822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_167351	A	6	6	14833	14838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_167351	T	6	6	14956	14961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_167351	A	6	6	15047	15052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_167351	T	6	6	15215	15220	0 %	100 %	0 %	0 %	294679244
128	NT_167351	A	6	6	15266	15271	100 %	0 %	0 %	0 %	294679244
129	NT_167351	A	6	6	15308	15313	100 %	0 %	0 %	0 %	294679244

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.