MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment a

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167350	CTTA	2	8	135	142	25 %	50 %	0 %	25 %	294679206
2	NT_167350	AAAC	2	8	558	565	75 %	0 %	0 %	25 %	294679207
3	NT_167350	AATA	2	8	609	616	75 %	25 %	0 %	0 %	294679207
4	NT_167350	TTTC	2	8	930	937	0 %	75 %	0 %	25 %	294679207
5	NT_167350	TTTG	2	8	1087	1094	0 %	75 %	25 %	0 %	294679207
6	NT_167350	AAAG	2	8	1184	1191	75 %	0 %	25 %	0 %	294679208
7	NT_167350	CTTT	2	8	1198	1205	0 %	75 %	0 %	25 %	294679208
8	NT_167350	CAAA	2	8	1390	1397	75 %	0 %	0 %	25 %	294679208
9	NT_167350	AAAT	2	8	1913	1920	75 %	25 %	0 %	0 %	294679209
10	NT_167350	CTCC	2	8	2211	2218	0 %	25 %	0 %	75 %	294679210
11	NT_167350	TAAT	2	8	2299	2306	50 %	50 %	0 %	0 %	294679210
12	NT_167350	AATA	2	8	2828	2835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167350	ATAA	2	8	3806	3813	75 %	25 %	0 %	0 %	294679211
14	NT_167350	TTAA	2	8	4005	4012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167350	TTAA	2	8	4034	4041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167350	TCTT	2	8	4622	4629	0 %	75 %	0 %	25 %	294679212
17	NT_167350	ATGA	2	8	4639	4646	50 %	25 %	25 %	0 %	294679212
18	NT_167350	TTCT	2	8	4959	4966	0 %	75 %	0 %	25 %	294679213
19	NT_167350	GTTT	2	8	4997	5004	0 %	75 %	25 %	0 %	294679213
20	NT_167350	ATCA	2	8	5177	5184	50 %	25 %	0 %	25 %	294679213
21	NT_167350	TTTA	2	8	5252	5259	25 %	75 %	0 %	0 %	294679213
22	NT_167350	GTTT	2	8	6150	6157	0 %	75 %	25 %	0 %	294679216
23	NT_167350	TAAA	2	8	6201	6208	75 %	25 %	0 %	0 %	294679216
24	NT_167350	TCCT	2	8	6499	6506	0 %	50 %	0 %	50 %	294679216
25	NT_167350	TCTT	2	8	6569	6576	0 %	75 %	0 %	25 %	294679216
26	NT_167350	TTTG	2	8	6728	6735	0 %	75 %	25 %	0 %	294679216
27	NT_167350	TTTC	2	8	6759	6766	0 %	75 %	0 %	25 %	294679216
28	NT_167350	AATT	2	8	7258	7265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_167350	ATAA	2	8	7294	7301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.