MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment a

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167350	CTA	2	6	74	79	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679206
2	NT_167350	ATT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679206
3	NT_167350	AAT	2	6	290	295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679206
4	NT_167350	ACT	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679206
5	NT_167350	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679206
6	NT_167350	ACT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679206
7	NT_167350	ATC	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679206
8	NT_167350	AAT	2	6	494	499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679207
9	NT_167350	TCT	2	6	506	511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679207
10	NT_167350	ATT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679207
11	NT_167350	TTC	2	6	583	588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679207
12	NT_167350	AAT	2	6	661	666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679207
13	NT_167350	TCC	2	6	718	723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679207
14	NT_167350	TAA	2	6	835	840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679207
15	NT_167350	AGT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679207
16	NT_167350	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679207
17	NT_167350	TTA	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679207
18	NT_167350	CTT	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679208
19	NT_167350	ATA	2	6	1379	1384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679208
20	NT_167350	ATA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679209
21	NT_167350	GAA	2	6	1536	1541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679209
22	NT_167350	TTA	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679209
23	NT_167350	AAT	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679209
24	NT_167350	TTA	2	6	1650	1655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679209
25	NT_167350	CAT	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679209
26	NT_167350	AAT	2	6	1732	1737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679209
27	NT_167350	ACT	2	6	1748	1753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679209
28	NT_167350	AGA	2	6	1796	1801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679209
29	NT_167350	AAT	3	9	1849	1857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679209
30	NT_167350	CAT	3	9	1897	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679209
31	NT_167350	CAA	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679209
32	NT_167350	ATT	2	6	2012	2017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679210
33	NT_167350	GAA	2	6	2439	2444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679210
34	NT_167350	TTA	3	9	2664	2672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679210
35	NT_167350	AAT	2	6	2680	2685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679210
36	NT_167350	ATT	2	6	2699	2704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679210
37	NT_167350	CAT	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679211
38	NT_167350	ATC	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679211
39	NT_167350	ATT	2	6	3178	3183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679211
40	NT_167350	AAT	2	6	3196	3201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679211
41	NT_167350	AAC	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679211
42	NT_167350	CTC	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679211
43	NT_167350	TCA	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679211
44	NT_167350	AAT	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679211
45	NT_167350	TTA	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679211
46	NT_167350	TTC	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679211
47	NT_167350	ATT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679211
48	NT_167350	ATT	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679211
49	NT_167350	TAA	2	6	3627	3632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679211
50	NT_167350	ATT	2	6	3638	3643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679211
51	NT_167350	CTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679211
52	NT_167350	TTC	2	6	3706	3711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679211
53	NT_167350	TCT	2	6	3749	3754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679211
54	NT_167350	ATT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679211
55	NT_167350	ATT	2	6	3814	3819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679211
56	NT_167350	TTC	2	6	4175	4180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679212
57	NT_167350	ATC	2	6	4631	4636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679212
58	NT_167350	ATT	2	6	4652	4657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679212
59	NT_167350	ATT	2	6	4971	4976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679213
60	NT_167350	AAT	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679213
61	NT_167350	ACT	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679213
62	NT_167350	ATT	2	6	5318	5323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679213
63	NT_167350	ATT	2	6	5402	5407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679214
64	NT_167350	TAG	2	6	5435	5440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679214
65	NT_167350	TAA	2	6	5466	5471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679214
66	NT_167350	CCT	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679214
67	NT_167350	TTA	2	6	5555	5560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679214
68	NT_167350	AAT	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679215
69	NT_167350	ATA	2	6	6125	6130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679216
70	NT_167350	ATA	3	9	6184	6192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679216
71	NT_167350	ATT	2	6	6251	6256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679216
72	NT_167350	CTT	2	6	6267	6272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679216
73	NT_167350	AAT	2	6	6305	6310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679216
74	NT_167350	TAT	2	6	6321	6326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679216
75	NT_167350	GTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679216
76	NT_167350	TAT	2	6	6388	6393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679216
77	NT_167350	ATC	2	6	6403	6408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679216
78	NT_167350	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679216
79	NT_167350	TAT	6	18	6771	6788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679216
80	NT_167350	TAA	2	6	6974	6979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679216
81	NT_167350	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679216
82	NT_167350	ATA	2	6	7081	7086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679216
83	NT_167350	TGT	2	6	7163	7168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679216
84	NT_167350	AAT	2	6	7395	7400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679217
85	NT_167350	CCT	2	6	7401	7406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679217
86	NT_167350	GCA	2	6	7454	7459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679217
87	NT_167350	CTT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679217
88	NT_167350	ATC	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679218
89	NT_167350	CGC	2	6	7492	7497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679218
90	NT_167350	ATC	2	6	7504	7509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679218
91	NT_167350	AGC	3	9	7551	7559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679218
92	NT_167350	CCT	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679218
93	NT_167350	GCC	2	6	7588	7593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679218
94	NT_167350	CAA	2	6	7595	7600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679218
95	NT_167350	GCC	2	6	7645	7650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679218
96	NT_167350	CAG	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679218
97	NT_167350	AAC	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679218
98	NT_167350	ATC	2	6	7725	7730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679218
99	NT_167350	CAG	3	9	7733	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679218
100	NT_167350	CTT	3	9	7742	7750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679218
101	NT_167350	AGC	2	6	7789	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679218
102	NT_167350	CAA	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679218
103	NT_167350	TCA	2	6	7841	7846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679219
104	NT_167350	ATT	2	6	7858	7863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679219
105	NT_167350	AGC	2	6	7864	7869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
106	NT_167350	TCA	2	6	7886	7891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679219
107	NT_167350	CCA	2	6	7892	7897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679219
108	NT_167350	ACC	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679219
109	NT_167350	AGC	2	6	7912	7917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
110	NT_167350	CAG	2	6	7923	7928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
111	NT_167350	ATC	2	6	7934	7939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679219
112	NT_167350	TCA	2	6	7961	7966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679219
113	NT_167350	TTA	2	6	8000	8005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679219
114	NT_167350	AGC	3	9	8011	8019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
115	NT_167350	GCA	2	6	8060	8065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
116	NT_167350	CTT	2	6	8077	8082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679219
117	NT_167350	CAG	2	6	8160	8165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
118	NT_167350	CCT	2	6	8172	8177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679219
119	NT_167350	CAG	2	6	8190	8195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
120	NT_167350	CAA	2	6	8199	8204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679219
121	NT_167350	CAG	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
122	NT_167350	CAG	2	6	8271	8276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
123	NT_167350	AAC	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679219
124	NT_167350	CAG	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
125	NT_167350	CTT	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679219
126	NT_167350	CCT	2	6	8361	8366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679219
127	NT_167350	CAG	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
128	NT_167350	CAA	2	6	8391	8396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679219
129	NT_167350	AGC	2	6	8458	8463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
130	NT_167350	ACC	3	9	8488	8496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679219
131	NT_167350	AGC	2	6	8503	8508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
132	NT_167350	AGC	2	6	8515	8520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679219
133	NT_167350	ATC	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679219

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.