MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Cloacamonas acidaminovorans

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NS_000195	AGAAA	2	10	1662	1671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NS_000195	AAGGG	2	10	16439	16448	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NS_000195	ATTTA	2	10	16505	16514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NS_000195	TAACA	2	10	30614	30623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NS_000195	CAATA	2	10	33552	33561	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NS_000195	ATTGC	2	10	33626	33635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NS_000195	AGGAA	2	10	36742	36751	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NS_000195	TAAAA	2	10	58609	58618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NS_000195	GGAAA	2	10	65891	65900	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NS_000195	AAGTT	2	10	73468	73477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NS_000195	AAAAG	2	10	78872	78881	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NS_000195	TATTT	2	10	81675	81684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NS_000195	TGAAA	2	10	82104	82113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NS_000195	AATAA	2	10	100756	100765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NS_000195	GTTAT	2	10	101520	101529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NS_000195	ATTAT	2	10	103067	103076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NS_000195	TTAAA	2	10	121212	121221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NS_000195	TTAAA	2	10	123421	123430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NS_000195	AGGCA	2	10	123605	123614	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NS_000195	GAAAC	2	10	137568	137577	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NS_000195	TTAAG	2	10	142378	142387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NS_000195	TTTAT	2	10	145168	145177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NS_000195	TTAAT	2	10	152171	152180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NS_000195	AAACC	2	10	159273	159282	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NS_000195	CAAAA	2	10	159403	159412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NS_000195	TTTCC	2	10	169963	169972	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NS_000195	ATAAG	2	10	189212	189221	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NS_000195	TCCCT	2	10	203058	203067	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NS_000195	TTCTT	2	10	213797	213806	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NS_000195	TTCTT	2	10	213885	213894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NS_000195	TTCTT	2	10	213972	213981	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NS_000195	TTTCT	2	10	214059	214068	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NS_000195	TTTAC	2	10	231630	231639	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NS_000195	AAACC	2	10	266265	266274	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NS_000195	TGAAC	2	10	295698	295707	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NS_000195	GCAAT	2	10	307645	307654	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NS_000195	TTTTG	2	10	320897	320906	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NS_000195	ATATG	2	10	320953	320962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NS_000195	TTTTG	2	10	324315	324324	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NS_000195	TGATT	2	10	334469	334478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NS_000195	AGAAA	2	10	334493	334502	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NS_000195	TGTTT	2	10	334529	334538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NS_000195	AGAAA	2	10	335046	335055	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NS_000195	TATTT	2	10	340397	340406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NS_000195	TATAA	2	10	348587	348596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NS_000195	TTATG	2	10	386035	386044	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NS_000195	AAGGA	2	10	390895	390904	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NS_000195	TCAAG	2	10	393418	393427	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NS_000195	TCTTT	2	10	424921	424930	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NS_000195	AATAT	2	10	425701	425710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NS_000195	TGCTA	2	10	434109	434118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NS_000195	AAACA	2	10	444366	444375	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NS_000195	TTATT	2	10	448065	448074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NS_000195	AGGAA	2	10	448724	448733	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NS_000195	TTTTA	2	10	472437	472446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NS_000195	ATATT	2	10	487745	487754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NS_000195	AAATA	2	10	504618	504627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NS_000195	TTTAA	2	10	511930	511939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NS_000195	CTTTT	2	10	526856	526865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NS_000195	TGGAG	2	10	528057	528066	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NS_000195	CTCGC	2	10	565256	565265	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NS_000195	CCTAA	2	10	566308	566317	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NS_000195	TAAAA	2	10	582634	582643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NS_000195	ATGAT	2	10	582715	582724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NS_000195	AGCAA	2	10	582883	582892	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NS_000195	TCCAA	2	10	592996	593005	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NS_000195	CAAAA	2	10	593198	593207	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NS_000195	TTGTT	2	10	598043	598052	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NS_000195	GAAAG	2	10	598088	598097	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NS_000195	GAAAA	2	10	610246	610255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NS_000195	CCTAA	2	10	614938	614947	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NS_000195	TCCAA	2	10	626468	626477	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NS_000195	TCCAA	2	10	626835	626844	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NS_000195	TCCAA	2	10	627285	627294	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NS_000195	CAAAA	2	10	628840	628849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NS_000195	AGGTA	2	10	642283	642292	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NS_000195	GAAAA	2	10	658271	658280	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NS_000195	CCACC	2	10	669682	669691	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
79	NS_000195	AAAAG	2	10	670529	670538	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NS_000195	TAAGA	2	10	674267	674276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NS_000195	TAATC	2	10	674859	674868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NS_000195	CTTTT	2	10	689149	689158	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NS_000195	ATTAT	2	10	699823	699832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NS_000195	TGGCT	2	10	704288	704297	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NS_000195	TTTAT	2	10	712880	712889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NS_000195	TAAAA	2	10	728666	728675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NS_000195	TAAAA	2	10	728864	728873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NS_000195	TTTGT	2	10	743665	743674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NS_000195	ATTAT	2	10	766536	766545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NS_000195	TTCTT	2	10	805103	805112	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NS_000195	ATAAA	2	10	805249	805258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NS_000195	ATTAT	2	10	810005	810014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NS_000195	CATAT	2	10	811317	811326	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NS_000195	GGCAG	2	10	829459	829468	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NS_000195	GAAAA	2	10	835430	835439	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NS_000195	TTTTC	2	10	835765	835774	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NS_000195	CTCTT	2	10	835926	835935	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NS_000195	AATTC	2	10	836335	836344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NS_000195	ATGAA	2	10	855705	855714	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NS_000195	GGTTG	2	10	874740	874749	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NS_000195	CAAAA	2	10	887507	887516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NS_000195	TATTT	2	10	904853	904862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NS_000195	AGATT	2	10	916149	916158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NS_000195	AGATT	2	10	916253	916262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NS_000195	ATTTT	2	10	920315	920324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NS_000195	ATTTT	2	10	920371	920380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NS_000195	AAATC	2	10	920655	920664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NS_000195	ATTTT	2	10	922109	922118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NS_000195	AAAAT	2	10	927690	927699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NS_000195	TATTT	2	10	931227	931236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NS_000195	TATAA	2	10	944047	944056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NS_000195	ATTTT	2	10	970921	970930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NS_000195	CTTAT	2	10	970980	970989	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NS_000195	AAAAT	2	10	971989	971998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NS_000195	TTATT	2	10	985263	985272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NS_000195	GTTTT	2	10	993346	993355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NS_000195	TTGAA	2	10	994893	994902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NS_000195	TTGAA	2	10	995121	995130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NS_000195	TAAGA	2	10	999028	999037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NS_000195	TAAAT	2	10	999394	999403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NS_000195	AAAAT	2	10	999650	999659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NS_000195	ATTTT	2	10	1006204	1006213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NS_000195	TTCCT	2	10	1007237	1007246	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NS_000195	GAAAA	2	10	1007304	1007313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NS_000195	AAAAT	2	10	1010746	1010755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NS_000195	CTATT	2	10	1010766	1010775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NS_000195	ATTTT	2	10	1025687	1025696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NS_000195	GAAAG	2	10	1042672	1042681	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NS_000195	ATATT	2	10	1060877	1060886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NS_000195	AAATA	2	10	1094646	1094655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NS_000195	AGATA	2	10	1094673	1094682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NS_000195	ATAGG	2	10	1097332	1097341	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NS_000195	AAAAG	2	10	1113797	1113806	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NS_000195	TAAAA	2	10	1155928	1155937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NS_000195	TTCCG	2	10	1165627	1165636	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NS_000195	GATTT	2	10	1168299	1168308	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NS_000195	ATTAT	2	10	1177074	1177083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NS_000195	TTTCT	2	10	1177085	1177094	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NS_000195	AAAAT	2	10	1186844	1186853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NS_000195	TAAAA	2	10	1195398	1195407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NS_000195	GGTTG	2	10	1215335	1215344	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NS_000195	AATAA	2	10	1215365	1215374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NS_000195	TATTT	2	10	1217598	1217607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NS_000195	AAAGA	2	10	1235943	1235952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NS_000195	CAAAA	2	10	1243674	1243683	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NS_000195	CTTTA	2	10	1265235	1265244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NS_000195	TAAAA	2	10	1265648	1265657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.