MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NS_000191	AGACAA	2	12	949	960	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NS_000191	TAAAAA	2	12	2950	2961	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NS_000191	GATAAT	2	12	3001	3012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NS_000191	AAGATA	2	12	6723	6734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NS_000191	TTCAAC	2	12	6960	6971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NS_000191	TAAAAG	2	12	12640	12651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NS_000191	TGTTGA	2	12	18719	18730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NS_000191	CAATAC	2	12	23812	23823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NS_000191	TAGAAA	2	12	27158	27169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NS_000191	ATGGGT	2	12	27330	27341	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NS_000191	CTATAC	2	12	36558	36569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NS_000191	TGTTTT	2	12	36633	36644	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NS_000191	AACTAT	2	12	36874	36885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NS_000191	TATTTT	2	12	38122	38133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NS_000191	TTAATG	2	12	38830	38841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NS_000191	ATTTTA	2	12	40668	40679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NS_000191	AAATAA	2	12	47822	47833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NS_000191	GATAAA	2	12	53491	53502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NS_000191	TATATG	2	12	54350	54361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NS_000191	ATAAAT	2	12	64044	64055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NS_000191	GCGTTA	2	12	64464	64475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NS_000191	GATAAA	2	12	64750	64761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NS_000191	ATGAAA	2	12	65553	65564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NS_000191	ACTTTA	2	12	66024	66035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NS_000191	TTTCAG	2	12	66678	66689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NS_000191	TGAAAT	2	12	67095	67106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NS_000191	TTTTCT	2	12	79028	79039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NS_000191	TCTACT	2	12	87094	87105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NS_000191	TAAAAC	2	12	90105	90116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NS_000191	AAGAAT	2	12	112021	112032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NS_000191	AAAACA	2	12	112579	112590	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NS_000191	TAAAAA	2	12	113019	113030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NS_000191	ATTTTT	2	12	118474	118485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NS_000191	CTTTTT	2	12	118816	118827	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NS_000191	ATTTTT	2	12	126466	126477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NS_000191	TTATGT	2	12	128031	128042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NS_000191	GGGAGA	2	12	128909	128920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NS_000191	TAGAAG	2	12	130428	130439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NS_000191	TGGAAG	2	12	133306	133317	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NS_000191	TTATAC	2	12	133792	133803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NS_000191	AATTCT	2	12	173919	173930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NS_000191	ACAAAA	2	12	189104	189115	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NS_000191	TAATAT	2	12	195776	195787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NS_000191	ATTTTT	2	12	198049	198060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NS_000191	TTGATA	2	12	213391	213402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NS_000191	GAAGAG	2	12	226525	226536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NS_000191	GGCTTT	2	12	236662	236673	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NS_000191	AAAAGA	2	12	238690	238701	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NS_000191	CCAAAA	2	12	239407	239418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NS_000191	TAGCAT	2	12	244933	244944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NS_000191	TAAAAC	2	12	248330	248341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NS_000191	TAGAAA	2	12	271813	271824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NS_000191	AAAGAT	2	12	283397	283408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NS_000191	TTTTAC	2	12	290166	290177	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NS_000191	ATTGAA	2	12	295787	295798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NS_000191	TATACT	2	12	306300	306311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NS_000191	CAGTAG	2	12	337275	337286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NS_000191	AATTGA	2	12	337772	337783	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NS_000191	ATAGTT	2	12	344480	344491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NS_000191	TGAAAG	2	12	351003	351014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NS_000191	TATGAA	2	12	356324	356335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NS_000191	ATTGTG	2	12	369783	369794	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NS_000191	AAAATA	2	12	374762	374773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NS_000191	ATTTGT	2	12	377016	377027	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NS_000191	GGAAAA	2	12	377308	377319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NS_000191	CAGGTA	2	12	377869	377880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NS_000191	CAGGTA	2	12	391621	391632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NS_000191	TAAAAA	2	12	403821	403832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NS_000191	TTAATC	2	12	409451	409462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NS_000191	AAAAAT	2	12	412003	412014	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NS_000191	AAAAAT	2	12	412780	412791	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NS_000191	ATTCAA	2	12	413490	413501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NS_000191	AAAGCA	2	12	413612	413623	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NS_000191	TATTGA	2	12	414980	414991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NS_000191	GAAGGC	2	12	418433	418444	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NS_000191	GTATAG	2	12	421691	421702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NS_000191	AAAACA	2	12	426332	426343	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NS_000191	CGTTTA	2	12	428037	428048	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NS_000191	AAAAGT	2	12	428245	428256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NS_000191	TTTACG	2	12	428593	428604	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NS_000191	TGTTTT	2	12	428796	428807	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NS_000191	AGATAA	2	12	432194	432205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NS_000191	GAAAAA	2	12	432360	432371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NS_000191	GATACT	2	12	436363	436374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NS_000191	TGGTTT	2	12	438259	438270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NS_000191	TGGACT	2	12	441857	441868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NS_000191	ATTTAA	2	12	448216	448227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NS_000191	TATTTT	2	12	454195	454206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NS_000191	CGATAA	2	12	454235	454246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NS_000191	TTCGGC	2	12	454939	454950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NS_000191	AAGTGT	2	12	458001	458012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NS_000191	AGAAAA	2	12	458094	458105	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NS_000191	TGCTGG	2	12	458304	458315	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NS_000191	TCTTTC	2	12	460309	460320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NS_000191	AGCTTA	2	12	467582	467593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NS_000191	AAAATA	2	12	467686	467697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NS_000191	GATAAA	2	12	468304	468315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NS_000191	AAAATA	2	12	469964	469975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NS_000191	TAGTAT	2	12	478572	478583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NS_000191	ATTGAC	2	12	479683	479694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NS_000191	CAGACT	2	12	484105	484116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NS_000191	AATAAA	2	12	486817	486828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NS_000191	AGAATA	2	12	499441	499452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NS_000191	ACGAGT	2	12	503932	503943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NS_000191	AATAAA	2	12	510042	510053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NS_000191	CAAATA	2	12	512703	512714	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NS_000191	AATTTT	2	12	517422	517433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NS_000191	CTTATG	2	12	518072	518083	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NS_000191	ATGAAT	2	12	523694	523705	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NS_000191	AAAGTC	2	12	528832	528843	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NS_000191	AGAAAC	2	12	530171	530182	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NS_000191	CAGACA	2	12	535732	535743	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NS_000191	TTCTAT	2	12	538851	538862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NS_000191	GATTTC	2	12	547838	547849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NS_000191	TGAAAG	2	12	557898	557909	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NS_000191	ATAGAA	2	12	574559	574570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NS_000191	TTAACT	2	12	584800	584811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NS_000191	GATATA	2	12	588510	588521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NS_000191	AAATGC	2	12	588692	588703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NS_000191	TTATGA	2	12	589980	589991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NS_000191	TTATAT	2	12	593826	593837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NS_000191	ATACAA	2	12	608716	608727	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NS_000191	ATTTTA	2	12	609035	609046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NS_000191	ATAAAA	2	12	624120	624131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NS_000191	GTGCCT	2	12	625487	625498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NS_000191	AAAAGG	2	12	626467	626478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NS_000191	TAAAAT	2	12	646975	646986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NS_000191	TGAAAT	2	12	647367	647378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NS_000191	TATTGC	2	12	651347	651358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NS_000191	TTTTAA	2	12	653230	653241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.