MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NS_000191	ATAAAA	2	12	1339	1350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485004
2	NS_000191	ACGACA	2	12	6487	6498	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485006
3	NS_000191	GGCGTA	2	12	10041	10052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189485008
4	NS_000191	AAAAGA	2	12	10424	10435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485008
5	NS_000191	TTTCAG	2	12	13565	13576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485009
6	NS_000191	CAAAAG	2	12	16451	16462	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485010
7	NS_000191	TTTGTA	2	12	21151	21162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485011
8	NS_000191	CTTTAA	2	12	22164	22175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485011
9	NS_000191	TTTTAA	2	12	22396	22407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485011
10	NS_000191	GTTTTT	2	12	28390	28401	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	189485015
11	NS_000191	GAAAAA	2	12	33931	33942	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485019
12	NS_000191	TTTTAA	2	12	42834	42845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485020
13	NS_000191	GCTTAT	2	12	54918	54929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485030
14	NS_000191	ATAAAA	2	12	55383	55394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485030
15	NS_000191	TTTAAA	2	12	61187	61198	50 %	50 %	0 %	0 %	189485036
16	NS_000191	GAAGCA	2	12	61984	61995	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189485037
17	NS_000191	AAAATA	2	12	70328	70339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485039
18	NS_000191	AAGACA	2	12	74175	74186	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485040
19	NS_000191	GAAGCT	2	12	75245	75256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189485041
20	NS_000191	GTTCCT	2	12	75452	75463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189485041
21	NS_000191	AAAAGC	2	12	77358	77369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485042
22	NS_000191	CTTGTT	2	12	79787	79798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189485043
23	NS_000191	CATAAG	2	12	81389	81400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485044
24	NS_000191	TTATAT	2	12	82115	82126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485044
25	NS_000191	TGCCGC	2	12	82247	82258	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189485044
26	NS_000191	CCCAAG	2	12	86457	86468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	189485045
27	NS_000191	AATTTT	2	12	90124	90135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485047
28	NS_000191	TTTAAA	2	12	90959	90970	50 %	50 %	0 %	0 %	189485047
29	NS_000191	TTAGAG	2	12	98025	98036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485055
30	NS_000191	ATATTG	2	12	99517	99528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485057
31	NS_000191	AAATAA	2	12	102532	102543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485059
32	NS_000191	AGACAT	2	12	104677	104688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485059
33	NS_000191	TAAAAA	2	12	106024	106035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485060
34	NS_000191	ATATTG	2	12	107154	107165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485062
35	NS_000191	AGGCAT	2	12	108074	108085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189485063
36	NS_000191	GTTTTA	2	12	108663	108674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485063
37	NS_000191	TATGAA	2	12	109423	109434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485064
38	NS_000191	TCAATA	2	12	115345	115356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485066
39	NS_000191	TTTTAT	2	12	122120	122131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485071
40	NS_000191	GGGGCT	2	12	135095	135106	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189485076
41	NS_000191	GCAAAA	2	12	138072	138083	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485077
42	NS_000191	GAAAAA	2	12	138195	138206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485077
43	NS_000191	GCTAAA	2	12	138543	138554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485077
44	NS_000191	TATTTC	2	12	141646	141657	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189485078
45	NS_000191	CAAAAA	2	12	141708	141719	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485078
46	NS_000191	TTAAAG	2	12	143403	143414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485078
47	NS_000191	CCGGTT	2	12	146676	146687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485082
48	NS_000191	GAGAGT	2	12	148282	148293	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189485083
49	NS_000191	AAGCAA	2	12	152782	152793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485090
50	NS_000191	AGTAAA	2	12	154759	154770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485094
51	NS_000191	AAATTG	2	12	156853	156864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485099
52	NS_000191	GTTTTA	2	12	160261	160272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485104
53	NS_000191	AGATAT	2	12	161698	161709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485106
54	NS_000191	GACCCG	2	12	164079	164090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189485110
55	NS_000191	GAAAAA	2	12	164332	164343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485111
56	NS_000191	TTTAAA	2	12	165202	165213	50 %	50 %	0 %	0 %	189485112
57	NS_000191	AAAATA	2	12	178993	179004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485123
58	NS_000191	TGCGAC	2	12	180092	180103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189485124
59	NS_000191	CAAAAA	2	12	184052	184063	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485127
60	NS_000191	AAAAAT	2	12	185139	185150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485128
61	NS_000191	TTTTAA	2	12	190559	190570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485130
62	NS_000191	TAAAAA	2	12	191950	191961	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485130
63	NS_000191	TCCCTA	2	12	192329	192340	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485130
64	NS_000191	CTTTTT	2	12	197679	197690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485133
65	NS_000191	TTACGT	2	12	199112	199123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485134
66	NS_000191	CTTTTT	2	12	201953	201964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485136
67	NS_000191	TTTTTC	2	12	203191	203202	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485137
68	NS_000191	AATTTC	2	12	207664	207675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485138
69	NS_000191	TATTTT	2	12	209061	209072	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485139
70	NS_000191	TCAAAT	2	12	210794	210805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485139
71	NS_000191	AAAGAT	2	12	211656	211667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485139
72	NS_000191	GTTTTC	2	12	211975	211986	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189485140
73	NS_000191	TAATTT	2	12	215826	215837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485142
74	NS_000191	TAAATT	2	12	217268	217279	50 %	50 %	0 %	0 %	189485143
75	NS_000191	TGCTAT	2	12	217807	217818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485144
76	NS_000191	TGCAGC	2	12	219479	219490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189485146
77	NS_000191	TTAACA	2	12	221072	221083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485147
78	NS_000191	ATTAGG	2	12	229404	229415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485153
79	NS_000191	GTTTTG	2	12	230014	230025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485154
80	NS_000191	TAGATT	2	12	230282	230293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485154
81	NS_000191	AGAAAA	2	12	231349	231360	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485155
82	NS_000191	AAAAAC	2	12	234058	234069	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485157
83	NS_000191	TGAAAC	2	12	237765	237776	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485160
84	NS_000191	ATGAAG	2	12	242808	242819	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189485163
85	NS_000191	CAAAAA	2	12	246005	246016	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485166
86	NS_000191	AGTTAT	2	12	250149	250160	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485168
87	NS_000191	AAATGA	2	12	251214	251225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485168
88	NS_000191	GATTTG	2	12	254387	254398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189485170
89	NS_000191	CAAAAA	2	12	254538	254549	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485170
90	NS_000191	TGAAGC	2	12	254596	254607	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189485170
91	NS_000191	AGTTAA	2	12	255871	255882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485170
92	NS_000191	AATTGA	2	12	255886	255897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485170
93	NS_000191	TAAAAA	2	12	256701	256712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485172
94	NS_000191	TTTTTA	2	12	262522	262533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485175
95	NS_000191	CGACAA	2	12	263944	263955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485176
96	NS_000191	ATTCGT	2	12	267251	267262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485180
97	NS_000191	TTTTGT	2	12	273100	273111	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	189485182
98	NS_000191	TCGGAT	2	12	274328	274339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189485183
99	NS_000191	AGATTA	2	12	276161	276172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485185
100	NS_000191	AAATTG	2	12	277827	277838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485187
101	NS_000191	CTGAAA	2	12	279181	279192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485188
102	NS_000191	TTAAAA	2	12	282180	282191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485189
103	NS_000191	TGACTT	2	12	286250	286261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485191
104	NS_000191	CTTCAA	2	12	286742	286753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485192
105	NS_000191	TCCATA	2	12	286822	286833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485192
106	NS_000191	AAGTTG	2	12	286834	286845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485192
107	NS_000191	TTCAAC	2	12	287737	287748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485193
108	NS_000191	TTCAAC	2	12	288858	288869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485195
109	NS_000191	TCCCAT	2	12	293681	293692	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485198
110	NS_000191	ACAAAA	2	12	294388	294399	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485198
111	NS_000191	TATTGA	2	12	297210	297221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485199
112	NS_000191	AGTTTT	2	12	307503	307514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485206
113	NS_000191	ATGTTT	2	12	310368	310379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485207
114	NS_000191	TAAATT	2	12	317404	317415	50 %	50 %	0 %	0 %	189485213
115	NS_000191	ACAAAA	2	12	317830	317841	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485213
116	NS_000191	GTCGGT	2	12	319905	319916	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189485215
117	NS_000191	TTAAAC	2	12	320209	320220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485215
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.