MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Exiguobacterium sp. MH3

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022794	TCGTG	2	10	1364	1373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022794	ATGGG	2	10	2141	2150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022794	GCGCC	2	10	3162	3171	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_022794	TTCGA	2	10	12195	12204	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022794	AACAA	2	10	19174	19183	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022794	ACGAC	2	10	46497	46506	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_022794	TCGTG	2	10	47712	47721	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022794	ATGGG	2	10	48488	48497	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022794	GCGCC	2	10	49509	49518	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_022794	TCGTG	2	10	53313	53322	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022794	ATGGG	2	10	54089	54098	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022794	GCGCC	2	10	55110	55119	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_022794	ATGGA	2	10	66938	66947	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022794	GGAGA	2	10	69892	69901	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022794	GAAGA	2	10	74672	74681	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022794	TGTTT	2	10	75654	75663	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022794	ACTAA	2	10	87802	87811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022794	AAGGA	2	10	92549	92558	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022794	CTTTC	2	10	102196	102205	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022794	TTGAT	2	10	106518	106527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022794	CATTT	2	10	109786	109795	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022794	TCAAG	2	10	110849	110858	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022794	TTACT	2	10	113857	113866	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022794	TCGTG	2	10	115103	115112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022794	ATGGG	2	10	115879	115888	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022794	GCGCC	2	10	116900	116909	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_022794	ATTTA	2	10	118817	118826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022794	GTTGA	2	10	119566	119575	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022794	AAAGT	2	10	125634	125643	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022794	TCCTT	2	10	129985	129994	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_022794	AGGAG	2	10	135582	135591	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022794	AACGA	2	10	152994	153003	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022794	AAAAG	2	10	171703	171712	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022794	GAAAA	2	10	191266	191275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022794	TTTTG	2	10	230745	230754	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022794	AACTA	2	10	239548	239557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022794	ATTTT	2	10	239648	239657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022794	ATGTA	2	10	243367	243376	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022794	TTCGC	2	10	245416	245425	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_022794	GATAA	2	10	250955	250964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022794	AATGA	2	10	268283	268292	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022794	ACAAT	2	10	289691	289700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022794	CTTTG	2	10	298427	298436	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022794	GCAAA	2	10	308087	308096	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022794	AAGGC	2	10	320651	320660	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022794	TAATT	2	10	325710	325719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022794	AATAA	2	10	349582	349591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022794	AATTT	2	10	360635	360644	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022794	AACAA	2	10	380834	380843	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022794	TTCTC	2	10	407307	407316	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_022794	CGTTT	2	10	424458	424467	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022794	TCAAA	2	10	432451	432460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022794	CGAGA	2	10	432603	432612	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022794	TCGTG	2	10	444898	444907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022794	ATGGG	2	10	445674	445683	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022794	GCGCC	2	10	446695	446704	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_022794	CTTGT	2	10	515416	515425	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022794	TCTAA	2	10	528333	528342	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022794	TTTAC	2	10	539446	539455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022794	TCTCT	2	10	559048	559057	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_022794	GACAT	2	10	568489	568498	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022794	TTCAT	2	10	570816	570825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022794	TATGT	2	10	583013	583022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022794	TCAAT	2	10	589028	589037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022794	GGAGA	2	10	603563	603572	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022794	GAATC	2	10	610730	610739	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022794	ATGAA	2	10	613700	613709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022794	CTAAA	2	10	627014	627023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022794	AGTAT	2	10	627146	627155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022794	ATCAA	2	10	636662	636671	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022794	GAAAT	2	10	645453	645462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022794	AGGAA	2	10	645592	645601	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022794	TCGTA	2	10	649666	649675	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022794	GATAA	2	10	655744	655753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022794	TTCAT	2	10	659047	659056	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022794	ACGAC	2	10	672256	672265	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_022794	TCGTG	2	10	673470	673479	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022794	ATGGG	2	10	674246	674255	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022794	GCGCC	2	10	675267	675276	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_022794	CCAGC	2	10	678127	678136	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_022794	TATCA	2	10	704704	704713	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022794	GGATT	2	10	721149	721158	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022794	TCGTT	2	10	728040	728049	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022794	TCTTT	2	10	758197	758206	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022794	GTATA	2	10	776082	776091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022794	AAAAC	2	10	795169	795178	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022794	TAAGG	2	10	795234	795243	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022794	ATGAA	2	10	802190	802199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022794	TTTCA	2	10	806444	806453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022794	TGAAA	2	10	814148	814157	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022794	GGCTT	2	10	816890	816899	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022794	AGCCA	2	10	825991	826000	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_022794	TTTTG	2	10	839610	839619	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022794	GTAAA	2	10	858039	858048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022794	AAGGA	2	10	861950	861959	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022794	TGAAA	2	10	863343	863352	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022794	CTTTT	2	10	872834	872843	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_022794	GAGAC	2	10	889056	889065	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022794	TTCCT	2	10	892787	892796	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_022794	TTTTA	2	10	895690	895699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022794	AGAGA	2	10	907747	907756	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022794	AGCGA	2	10	925815	925824	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022794	CTGGA	2	10	926098	926107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_022794	GTCGA	2	10	930359	930368	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022794	CGAAA	2	10	944584	944593	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022794	AATAA	2	10	954245	954254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022794	GGACG	2	10	961764	961773	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022794	CTTCA	2	10	1004364	1004373	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_022794	CAATC	2	10	1021438	1021447	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_022794	AACTC	2	10	1023900	1023909	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_022794	TTCAG	2	10	1037491	1037500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022794	ATGAA	2	10	1039323	1039332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022794	TACTT	2	10	1078853	1078862	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022794	AGTTA	2	10	1082740	1082749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022794	AAGTG	2	10	1087344	1087353	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022794	TATAG	2	10	1117896	1117905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022794	GACGT	2	10	1154055	1154064	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022794	TGTAC	2	10	1164689	1164698	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022794	GAAAA	2	10	1178238	1178247	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022794	AGTGA	2	10	1190445	1190454	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022794	GAGAG	2	10	1229146	1229155	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022794	TACTA	2	10	1233714	1233723	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022794	GTTTT	2	10	1245073	1245082	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022794	TTTCG	2	10	1247000	1247009	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022794	TAAAT	2	10	1256478	1256487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022794	AATCC	2	10	1262657	1262666	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022794	GAACA	2	10	1265464	1265473	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022794	TAAAA	2	10	1279676	1279685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022794	AAATT	2	10	1279851	1279860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022794	GTGAG	2	10	1284998	1285007	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022794	GAAAC	2	10	1293146	1293155	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022794	TATAA	2	10	1309972	1309981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022794	ATGAT	2	10	1310000	1310009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022794	AATTT	2	10	1317018	1317027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022794	AGAGA	2	10	1319435	1319444	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022794	TTAGA	2	10	1343223	1343232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022794	TCATC	2	10	1345551	1345560	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_022794	ATAGA	2	10	1361584	1361593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022794	ATGGA	2	10	1361596	1361605	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022794	CAATT	2	10	1365087	1365096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022794	TCTTT	2	10	1366029	1366038	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022794	CGATT	2	10	1371243	1371252	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022794	TTAAT	2	10	1379241	1379250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022794	AAAGG	2	10	1381677	1381686	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022794	GACTA	2	10	1384514	1384523	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022794	AAGCG	2	10	1391123	1391132	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022794	GCATC	2	10	1391984	1391993	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_022794	GATTT	2	10	1392061	1392070	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022794	TTCCT	2	10	1418890	1418899	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_022794	ATGAA	2	10	1423400	1423409	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022794	TAGTT	2	10	1426316	1426325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022794	TACCA	2	10	1450329	1450338	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_022794	ATGAA	2	10	1471593	1471602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022794	AGGAA	2	10	1476084	1476093	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022794	TGTCT	2	10	1481439	1481448	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_022794	ATTTG	2	10	1483365	1483374	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022794	CTTTA	2	10	1483389	1483398	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_022794	CATCA	2	10	1486260	1486269	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_022794	GAAGG	2	10	1497638	1497647	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022794	CATCC	2	10	1498160	1498169	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_022794	TAAAA	2	10	1499405	1499414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022794	TTATA	2	10	1503000	1503009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022794	ATCAT	2	10	1510747	1510756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_022794	GTTTC	2	10	1511544	1511553	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_022794	TTTGA	2	10	1514143	1514152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022794	TTTTA	2	10	1522390	1522399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022794	CTTTC	2	10	1523382	1523391	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
170	NC_022794	TCAAT	2	10	1525340	1525349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_022794	ACGTC	2	10	1530240	1530249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
174	NC_022794	TTCCT	2	10	1540602	1540611	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
175	NC_022794	TTCCT	2	10	1545252	1545261	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_022794	TCGTT	2	10	1560054	1560063	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
180	NC_022794	TGGTA	2	10	1560064	1560073	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022794	ATTTT	2	10	1561155	1561164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_022794	TTCTA	2	10	1570412	1570421	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_022794	AACCA	2	10	1572113	1572122	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
184	NC_022794	TGATA	2	10	1575296	1575305	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022794	ATTTG	2	10	1582356	1582365	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022794	TAACA	2	10	1582511	1582520	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_022794	ATCGA	2	10	1688639	1688648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
192	NC_022794	CTTAC	2	10	1694832	1694841	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_022794	AAGAA	2	10	1716679	1716688	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_022794	TACGA	2	10	1718601	1718610	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_022794	CCTCA	3	15	2405363	2405377	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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285	NC_022794	TTTAG	2	10	2666827	2666836	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_022794	AATCT	2	10	2697544	2697553	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_022794	TGCTT	2	10	2698893	2698902	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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331	NC_022794	CCTTT	2	10	3001679	3001688	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
332	NC_022794	TTATT	2	10	3015039	3015048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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335	NC_022794	TGTCC	2	10	3048390	3048399	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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337	NC_022794	AATTG	2	10	3098365	3098374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
338	NC_022794	ATTTT	2	10	3100074	3100083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NC_022794	CGATT	2	10	3118191	3118200	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
340	NC_022794	CACCT	2	10	3123114	3123123	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
341	NC_022794	ATCAT	2	10	3128695	3128704	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
342	NC_022794	AATAA	2	10	3138581	3138590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_022794	TCGTG	2	10	3141088	3141097	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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347	NC_022794	CAGGT	2	10	3155564	3155573	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
348	NC_022794	TCGTG	2	10	3160060	3160069	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
349	NC_022794	ATGGG	2	10	3160836	3160845	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
350	NC_022794	GCGCC	2	10	3161857	3161866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.