MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022793	ATTAAT	2	12	14211	14222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022793	TAATTT	2	12	14380	14391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022793	CTTTTA	2	12	16379	16390	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022793	CATATA	2	12	17776	17787	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022793	TATAAA	2	12	27243	27254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022793	CAAAAC	2	12	37068	37079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022793	TAAAAA	2	12	40169	40180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022793	TATAAA	2	12	40255	40266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022793	ATAAAT	2	12	40288	40299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022793	TAAAAA	2	12	44810	44821	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022793	AAATGA	2	12	57524	57535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022793	AAAATA	2	12	66250	66261	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022793	ATTTTT	2	12	76944	76955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022793	TATAAA	2	12	86405	86416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022793	ATTTAT	2	12	89679	89690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022793	TAAAAA	2	12	90754	90765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022793	ATTATA	2	12	90909	90920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022793	GCAAAT	2	12	106756	106767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022793	ATCTAT	2	12	107037	107048	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022793	AAATAC	2	12	152496	152507	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022793	AAAAAT	2	12	154686	154697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022793	ATTGAA	2	12	169819	169830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022793	AATATA	2	12	169923	169934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022793	CTGTTT	2	12	173326	173337	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022793	ATTAAT	2	12	239038	239049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022793	GGAATC	2	12	239234	239245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022793	GATATT	2	12	243472	243483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022793	CTTTTT	2	12	248756	248767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022793	TAATTT	2	12	256593	256604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022793	TCATAT	2	12	268213	268224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022793	TTTATA	2	12	284598	284609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022793	ATATTT	2	12	286332	286343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022793	TTGGTT	2	12	288744	288755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022793	TTATTT	2	12	305194	305205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022793	TATTAA	2	12	305237	305248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022793	ATTATA	2	12	313862	313873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022793	TTTATA	2	12	323532	323543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022793	ATTTAT	2	12	348335	348346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022793	AATATA	2	12	354196	354207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022793	TATCTA	2	12	357941	357952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022793	ATATTT	2	12	358004	358015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022793	TTTATA	2	12	417147	417158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022793	TTATAT	2	12	417175	417186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022793	AATATA	2	12	445697	445708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022793	TATTAA	2	12	470036	470047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022793	ATTTGT	2	12	470077	470088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022793	AAAAAT	2	12	470648	470659	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022793	TTGTAT	2	12	470864	470875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022793	ATCTAA	2	12	473403	473414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022793	AGTAAT	2	12	473457	473468	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022793	CATATA	2	12	474307	474318	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022793	TGATTT	2	12	477209	477220	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022793	GTATAA	2	12	494078	494089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022793	CATAAA	2	12	494165	494176	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022793	ATAACT	2	12	496409	496420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022793	CTGCAT	2	12	508766	508777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022793	ATAATG	2	12	508900	508911	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022793	ATTTAT	2	12	509950	509961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022793	TGATTT	2	12	530597	530608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022793	TTATAT	2	12	545359	545370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022793	TTATTT	2	12	550228	550239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022793	AAAATA	2	12	552370	552381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022793	TATAAC	2	12	560755	560766	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022793	TTATAT	2	12	561649	561660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022793	ATAGTC	2	12	561834	561845	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022793	GTTATT	2	12	561998	562009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022793	ATATTT	2	12	574498	574509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022793	TATTAA	2	12	578137	578148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022793	AAATAT	2	12	578200	578211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022793	TATTTA	2	12	578245	578256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022793	TTTTTA	2	12	578329	578340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022793	TTTTTA	2	12	583076	583087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022793	GTATTT	2	12	585420	585431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022793	TAATGA	2	12	591545	591556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022793	TTTTAG	2	12	594236	594247	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022793	TATTTT	2	12	595304	595315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022793	TATAAA	2	12	597269	597280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022793	ATATTT	2	12	600121	600132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022793	ATGAAT	2	12	600243	600254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022793	TATTTT	2	12	614967	614978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022793	TATTGG	2	12	619408	619419	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022793	TGATTA	2	12	619765	619776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022793	TATACG	2	12	636713	636724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022793	GACTTT	2	12	665825	665836	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022793	TCTTTT	2	12	673804	673815	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022793	TAAATT	2	12	673940	673951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022793	ATTGAA	2	12	689474	689485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022793	CTAAAC	2	12	697943	697954	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022793	GGTTTT	2	12	701284	701295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022793	TGAAAG	2	12	715027	715038	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022793	CATTAT	2	12	721746	721757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022793	TTTAAT	2	12	723799	723810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022793	TGATGG	2	12	724422	724433	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022793	AAGACA	2	12	730661	730672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022793	TGATTT	2	12	736266	736277	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022793	ATTGGT	2	12	739351	739362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022793	TATACA	2	12	741450	741461	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022793	ATAATT	2	12	745910	745921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022793	ATTTAT	2	12	811782	811793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022793	ATTCTC	2	12	825331	825342	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022793	AATATA	2	12	825440	825451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022793	ATTTAT	2	12	841334	841345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022793	AAACGT	2	12	849492	849503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022793	ATAATT	2	12	849515	849526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022793	TAGATA	2	12	854241	854252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022793	TATAAT	2	12	856107	856118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022793	ATAGGA	2	12	858153	858164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022793	AACTAA	2	12	906350	906361	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022793	TAAAAA	2	12	909153	909164	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022793	CTAAAA	2	12	920240	920251	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022793	ATTATA	2	12	921766	921777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022793	TTAATA	2	12	935190	935201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022793	ATTATA	2	12	941077	941088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022793	ATAAAT	2	12	946124	946135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022793	AGAAAA	2	12	946587	946598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022793	TTTAAT	2	12	954539	954550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022793	ATTTTA	2	12	962027	962038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022793	TTAAAA	2	12	962882	962893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022793	CTATTA	2	12	986183	986194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022793	TTATAC	2	12	986561	986572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022793	AAATAC	2	12	995301	995312	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022793	TAAAAA	2	12	1012507	1012518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022793	TATAAA	2	12	1012554	1012565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022793	TTAATT	2	12	1033778	1033789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022793	TTTATA	2	12	1034887	1034898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022793	ATTAAA	2	12	1046190	1046201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022793	TAAATC	2	12	1057022	1057033	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022793	TACAAT	2	12	1085247	1085258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022793	ATTATC	2	12	1089365	1089376	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022793	CAAAAT	2	12	1091231	1091242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_022793	ATAGTT	2	12	1092307	1092318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022793	TAAAGC	2	12	1092668	1092679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_022793	AAAATA	2	12	1096935	1096946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022793	TATAAA	2	12	1104150	1104161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022793	GAAAAG	2	12	1114575	1114586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022793	ATTATA	2	12	1121876	1121887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022793	ACGCAT	2	12	1125817	1125828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022793	CACAAA	2	12	1126627	1126638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_022793	TAAAAT	2	12	1131308	1131319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022793	CTGATA	2	12	1140765	1140776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_022793	TGAAAT	2	12	1188365	1188376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.