MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo

Total Repeats: 1270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022793	ATTAT	2	10	1623	1632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022793	ATATT	2	10	1778	1787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022793	TCTCA	2	10	2052	2061	20 %	40 %	0 %	40 %	557822172
4	NC_022793	TGCGA	2	10	2253	2262	20 %	20 %	40 %	20 %	557822172
5	NC_022793	TTCTT	2	10	3252	3261	0 %	80 %	0 %	20 %	557822173
6	NC_022793	CTTAT	2	10	3753	3762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022793	AATGA	2	10	4600	4609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022793	TATAA	2	10	5296	5305	60 %	40 %	0 %	0 %	557822175
9	NC_022793	GGAAT	2	10	5974	5983	40 %	20 %	40 %	0 %	557822176
10	NC_022793	ATAAA	2	10	7189	7198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022793	TGAAT	2	10	7610	7619	40 %	40 %	20 %	0 %	557822177
12	NC_022793	ACGTA	2	10	8459	8468	40 %	20 %	20 %	20 %	557822177
13	NC_022793	TAAAA	2	10	8767	8776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022793	CCAAG	2	10	9880	9889	40 %	0 %	20 %	40 %	557822178
15	NC_022793	ATTAA	2	10	10128	10137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022793	GAAAA	2	10	12541	12550	80 %	0 %	20 %	0 %	557822179
17	NC_022793	AATTA	2	10	15145	15154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022793	TTAAA	2	10	15808	15817	60 %	40 %	0 %	0 %	557822183
19	NC_022793	AAAGC	2	10	15888	15897	60 %	0 %	20 %	20 %	557822183
20	NC_022793	AAAAG	2	10	16340	16349	80 %	0 %	20 %	0 %	557822183
21	NC_022793	ATATT	2	10	16765	16774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022793	AAGCA	2	10	17033	17042	60 %	0 %	20 %	20 %	557822184
23	NC_022793	CATTC	2	10	18232	18241	20 %	40 %	0 %	40 %	557822185
24	NC_022793	AACTT	2	10	18907	18916	40 %	40 %	0 %	20 %	557822186
25	NC_022793	ATTAA	2	10	19656	19665	60 %	40 %	0 %	0 %	557822186
26	NC_022793	AAAGG	2	10	22677	22686	60 %	0 %	40 %	0 %	557822189
27	NC_022793	CCAAT	2	10	23416	23425	40 %	20 %	0 %	40 %	557822189
28	NC_022793	AAGCA	2	10	23563	23572	60 %	0 %	20 %	20 %	557822189
29	NC_022793	AAAAC	2	10	24056	24065	80 %	0 %	0 %	20 %	557822189
30	NC_022793	AAAAC	2	10	24326	24335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022793	TAGAA	2	10	24618	24627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022793	TATTT	2	10	27057	27066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022793	GAAAA	2	10	27496	27505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022793	AATTT	2	10	27877	27886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022793	ATTCA	2	10	28602	28611	40 %	40 %	0 %	20 %	557822193
36	NC_022793	AATCT	2	10	30162	30171	40 %	40 %	0 %	20 %	557822194
37	NC_022793	GCTAT	2	10	31590	31599	20 %	40 %	20 %	20 %	557822194
38	NC_022793	CCTAA	2	10	31764	31773	40 %	20 %	0 %	40 %	557822194
39	NC_022793	ATCTC	2	10	31776	31785	20 %	40 %	0 %	40 %	557822194
40	NC_022793	ATTAA	2	10	32109	32118	60 %	40 %	0 %	0 %	557822194
41	NC_022793	TCCCT	2	10	32715	32724	0 %	40 %	0 %	60 %	557822194
42	NC_022793	ACCAT	2	10	37372	37381	40 %	20 %	0 %	40 %	557822197
43	NC_022793	AGCTG	2	10	37675	37684	20 %	20 %	40 %	20 %	557822197
44	NC_022793	TTTAT	2	10	39006	39015	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022793	TCTTT	2	10	41511	41520	0 %	80 %	0 %	20 %	557822201
46	NC_022793	TTTGT	2	10	42176	42185	0 %	80 %	20 %	0 %	557822201
47	NC_022793	AGATA	2	10	42255	42264	60 %	20 %	20 %	0 %	557822201
48	NC_022793	ATTTT	2	10	42472	42481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022793	ATAAA	2	10	43551	43560	80 %	20 %	0 %	0 %	557822203
50	NC_022793	GTACG	2	10	45534	45543	20 %	20 %	40 %	20 %	557822205
51	NC_022793	CATTC	2	10	46589	46598	20 %	40 %	0 %	40 %	557822205
52	NC_022793	ATGGA	2	10	46600	46609	40 %	20 %	40 %	0 %	557822205
53	NC_022793	GCAAT	2	10	46736	46745	40 %	20 %	20 %	20 %	557822205
54	NC_022793	AAGAA	2	10	47692	47701	80 %	0 %	20 %	0 %	557822205
55	NC_022793	ATAAA	2	10	49812	49821	80 %	20 %	0 %	0 %	557822207
56	NC_022793	AGATT	2	10	51159	51168	40 %	40 %	20 %	0 %	557822207
57	NC_022793	ATAAA	2	10	51323	51332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022793	AGAAA	2	10	52080	52089	80 %	0 %	20 %	0 %	557822208
59	NC_022793	AAATA	2	10	53688	53697	80 %	20 %	0 %	0 %	557822210
60	NC_022793	CTATC	2	10	54221	54230	20 %	40 %	0 %	40 %	557822211
61	NC_022793	CATTC	2	10	54521	54530	20 %	40 %	0 %	40 %	557822211
62	NC_022793	ATAAA	2	10	55984	55993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022793	ATTAT	2	10	57502	57511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022793	CCAAT	2	10	60470	60479	40 %	20 %	0 %	40 %	557822215
65	NC_022793	TCTAA	2	10	60648	60657	40 %	40 %	0 %	20 %	557822215
66	NC_022793	ATTTA	2	10	62838	62847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022793	CATCT	2	10	63117	63126	20 %	40 %	0 %	40 %	557822217
68	NC_022793	CTAAT	2	10	63739	63748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022793	ATTTA	2	10	64181	64190	40 %	60 %	0 %	0 %	557822218
70	NC_022793	CAAAA	2	10	64714	64723	80 %	0 %	0 %	20 %	557822218
71	NC_022793	TGGCA	2	10	64787	64796	20 %	20 %	40 %	20 %	557822218
72	NC_022793	AATAA	2	10	65051	65060	80 %	20 %	0 %	0 %	557822218
73	NC_022793	TTTCT	2	10	65662	65671	0 %	80 %	0 %	20 %	557822219
74	NC_022793	TTATT	2	10	66356	66365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022793	TGCAT	2	10	67067	67076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022793	ACATA	2	10	68463	68472	60 %	20 %	0 %	20 %	557822221
77	NC_022793	AGGAT	2	10	68826	68835	40 %	20 %	40 %	0 %	557822222
78	NC_022793	AAAAC	2	10	68870	68879	80 %	0 %	0 %	20 %	557822222
79	NC_022793	TTTTA	2	10	69469	69478	20 %	80 %	0 %	0 %	557822223
80	NC_022793	CAAAT	2	10	72140	72149	60 %	20 %	0 %	20 %	557822226
81	NC_022793	TCTAT	2	10	72931	72940	20 %	60 %	0 %	20 %	557822226
82	NC_022793	GAAAA	2	10	75225	75234	80 %	0 %	20 %	0 %	557822228
83	NC_022793	ATGAC	2	10	75378	75387	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022793	TTCCT	2	10	77253	77262	0 %	60 %	0 %	40 %	557822231
85	NC_022793	AGATT	2	10	77772	77781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022793	TAATA	2	10	77845	77854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022793	TAAAA	2	10	77900	77909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022793	TCAAA	2	10	79714	79723	60 %	20 %	0 %	20 %	557822232
89	NC_022793	GAATT	2	10	80058	80067	40 %	40 %	20 %	0 %	557822232
90	NC_022793	TACTA	2	10	81542	81551	40 %	40 %	0 %	20 %	557822232
91	NC_022793	ATATA	2	10	82607	82616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022793	CAATC	2	10	83855	83864	40 %	20 %	0 %	40 %	557822234
93	NC_022793	CCAAT	2	10	84596	84605	40 %	20 %	0 %	40 %	557822235
94	NC_022793	ACATA	2	10	85078	85087	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022793	TAATT	2	10	86305	86314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022793	GAAAA	2	10	89088	89097	80 %	0 %	20 %	0 %	557822237
97	NC_022793	TATAT	2	10	89704	89713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022793	TAATA	2	10	94028	94037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022793	AAAAG	2	10	95418	95427	80 %	0 %	20 %	0 %	557822241
100	NC_022793	CTGAT	2	10	95762	95771	20 %	40 %	20 %	20 %	557822241
101	NC_022793	AATCA	2	10	97211	97220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022793	ATCTT	2	10	102071	102080	20 %	60 %	0 %	20 %	557822243
103	NC_022793	TAAAT	2	10	102116	102125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022793	TAAAT	2	10	103240	103249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022793	TCATC	2	10	103458	103467	20 %	40 %	0 %	40 %	557822245
106	NC_022793	TTTTA	2	10	104356	104365	20 %	80 %	0 %	0 %	557822245
107	NC_022793	ATTTA	2	10	104582	104591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022793	ATATT	2	10	104624	104633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022793	TTTTA	2	10	109603	109612	20 %	80 %	0 %	0 %	557822249
110	NC_022793	ATTGG	2	10	110459	110468	20 %	40 %	40 %	0 %	557822249
111	NC_022793	ATTAT	2	10	111656	111665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022793	GCATG	2	10	111750	111759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022793	TAATT	2	10	112035	112044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022793	GAATA	2	10	112594	112603	60 %	20 %	20 %	0 %	557822251
115	NC_022793	TAATG	2	10	114465	114474	40 %	40 %	20 %	0 %	557822253
116	NC_022793	TTTTC	2	10	114984	114993	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022793	GTATA	2	10	115023	115032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022793	TAGAA	2	10	115110	115119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022793	TAATA	2	10	115238	115247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022793	TCAGA	2	10	115650	115659	40 %	20 %	20 %	20 %	557822254
121	NC_022793	AAAAT	2	10	115905	115914	80 %	20 %	0 %	0 %	557822254
122	NC_022793	TACAA	2	10	117239	117248	60 %	20 %	0 %	20 %	557822254
123	NC_022793	ATTTA	2	10	120530	120539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022793	TATCG	2	10	120950	120959	20 %	40 %	20 %	20 %	557822257
125	NC_022793	GCAAA	2	10	121453	121462	60 %	0 %	20 %	20 %	557822257
126	NC_022793	ATAGA	2	10	122901	122910	60 %	20 %	20 %	0 %	557822259
127	NC_022793	CTAAT	2	10	123771	123780	40 %	40 %	0 %	20 %	557822260
128	NC_022793	TTCTT	2	10	124397	124406	0 %	80 %	0 %	20 %	557822260
129	NC_022793	TCATA	2	10	127030	127039	40 %	40 %	0 %	20 %	557822261
130	NC_022793	TAGTT	2	10	131552	131561	20 %	60 %	20 %	0 %	557822265
131	NC_022793	TGATA	2	10	133399	133408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022793	AAAAT	2	10	135085	135094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022793	TAAAA	2	10	135152	135161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022793	TATCA	2	10	135250	135259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022793	ATGAT	2	10	136257	136266	40 %	40 %	20 %	0 %	557822270
136	NC_022793	AGCAA	2	10	136985	136994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022793	TTTTA	2	10	138702	138711	20 %	80 %	0 %	0 %	557822273
138	NC_022793	AAAAC	2	10	140010	140019	80 %	0 %	0 %	20 %	557822274
139	NC_022793	AGTAA	2	10	141982	141991	60 %	20 %	20 %	0 %	557822276
140	NC_022793	ATCTT	2	10	144313	144322	20 %	60 %	0 %	20 %	557822279
141	NC_022793	ATTCC	2	10	144731	144740	20 %	40 %	0 %	40 %	557822279
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271	NC_022793	ATTTT	2	10	277013	277022	20 %	80 %	0 %	0 %	557822386
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441	NC_022793	TTTAT	2	10	419096	419105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_022793	TCTAT	2	10	421032	421041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
443	NC_022793	ATGAT	2	10	424477	424486	40 %	40 %	20 %	0 %	557822519
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445	NC_022793	ATATA	2	10	424899	424908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_022793	TATAA	2	10	424910	424919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_022793	TTTTA	2	10	427644	427653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_022793	ATTAA	2	10	478117	478126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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