MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo

Total Repeats: 494

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022793	ATTAT	2	10	1623	1632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022793	ATATT	2	10	1778	1787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022793	CTTAT	2	10	3753	3762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022793	AATGA	2	10	4600	4609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022793	ATAAA	2	10	7189	7198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022793	TAAAA	2	10	8767	8776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022793	ATTAA	2	10	10128	10137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022793	AATTA	2	10	15145	15154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022793	ATATT	2	10	16765	16774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022793	AAAAC	2	10	24326	24335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022793	TAGAA	2	10	24618	24627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022793	TATTT	2	10	27057	27066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022793	GAAAA	2	10	27496	27505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022793	AATTT	2	10	27877	27886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022793	TTTAT	2	10	39006	39015	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022793	ATTTT	2	10	42472	42481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022793	ATAAA	2	10	51323	51332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022793	ATAAA	2	10	55984	55993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022793	ATTAT	2	10	57502	57511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022793	ATTTA	2	10	62838	62847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022793	CTAAT	2	10	63739	63748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022793	TTATT	2	10	66356	66365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022793	TGCAT	2	10	67067	67076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022793	ATGAC	2	10	75378	75387	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022793	AGATT	2	10	77772	77781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022793	TAATA	2	10	77845	77854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022793	TAAAA	2	10	77900	77909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022793	ATATA	2	10	82607	82616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022793	ACATA	2	10	85078	85087	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022793	TAATT	2	10	86305	86314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022793	TATAT	2	10	89704	89713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022793	TAATA	2	10	94028	94037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022793	AATCA	2	10	97211	97220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022793	TAAAT	2	10	102116	102125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022793	TAAAT	2	10	103240	103249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022793	ATTTA	2	10	104582	104591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022793	ATATT	2	10	104624	104633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022793	ATTAT	2	10	111656	111665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022793	GCATG	2	10	111750	111759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022793	TAATT	2	10	112035	112044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022793	TTTTC	2	10	114984	114993	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022793	GTATA	2	10	115023	115032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022793	TAGAA	2	10	115110	115119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022793	TAATA	2	10	115238	115247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022793	ATTTA	2	10	120530	120539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022793	TGATA	2	10	133399	133408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022793	AAAAT	2	10	135085	135094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022793	TAAAA	2	10	135152	135161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022793	TATCA	2	10	135250	135259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022793	AGCAA	2	10	136985	136994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022793	ATAAA	2	10	147225	147234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022793	AGCCC	2	10	151112	151121	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_022793	CACGA	2	10	151256	151265	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_022793	GAAAA	2	10	151304	151313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022793	ATTAT	2	10	156961	156970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022793	ATATA	2	10	157081	157090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022793	AATGA	2	10	169939	169948	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022793	AAAAT	2	10	173257	173266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022793	TAATA	2	10	173381	173390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022793	AATTA	2	10	176066	176075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022793	TTGTT	2	10	177962	177971	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022793	TAGGA	2	10	193412	193421	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022793	ATTTT	2	10	195069	195078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022793	ACATA	2	10	196899	196908	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022793	TTGTT	2	10	197002	197011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022793	ATTTT	2	10	218231	218240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022793	CAAGT	2	10	218353	218362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022793	ATTTG	2	10	218417	218426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022793	TTTGG	2	10	221664	221673	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022793	GGACA	2	10	223281	223290	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022793	TAATT	2	10	227675	227684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022793	GATTT	2	10	232526	232535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022793	AATAT	2	10	233782	233791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022793	TCTGT	2	10	233942	233951	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022793	AATTT	2	10	237427	237436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022793	TATCT	2	10	237754	237763	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022793	TTTTA	2	10	238332	238341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022793	AAGTA	2	10	238403	238412	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022793	ATTTT	2	10	238948	238957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022793	AAAAT	2	10	239080	239089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022793	ATTAT	2	10	241461	241470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022793	GATAG	2	10	242434	242443	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022793	TATTT	3	15	243948	243962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022793	AATAA	2	10	255012	255021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022793	TATTT	2	10	255085	255094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022793	TCTAT	2	10	257386	257395	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022793	TAAAT	2	10	259936	259945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022793	ATATT	2	10	264509	264518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022793	ATATT	2	10	266518	266527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022793	ATTAT	2	10	266659	266668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022793	TTTAT	2	10	267164	267173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022793	CTTTT	2	10	267523	267532	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022793	ATTAT	2	10	267739	267748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022793	ATTAT	2	10	276895	276904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022793	ATTAA	2	10	277564	277573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022793	TTTAA	2	10	284481	284490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022793	ATTAA	2	10	284620	284629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022793	GAAAT	2	10	286370	286379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022793	ATTGT	5	25	287368	287392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022793	ATATA	2	10	293498	293507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022793	TGAAA	2	10	296326	296335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022793	CATTA	2	10	296360	296369	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022793	TAAAT	2	10	300372	300381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022793	ATTAA	2	10	300500	300509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022793	TATCA	2	10	301825	301834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022793	TTGTT	3	15	305139	305153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022793	TAAGA	2	10	317451	317460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022793	TAATA	2	10	320217	320226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022793	TTTTA	2	10	323243	323252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022793	AATTA	2	10	323565	323574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022793	ATTTT	2	10	327421	327430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022793	ATTAG	2	10	330501	330510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022793	TTGAT	2	10	330519	330528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022793	ATATA	2	10	332493	332502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022793	AATTT	2	10	337200	337209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022793	TAATT	2	10	338112	338121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022793	TATTT	2	10	351521	351530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022793	AATTG	2	10	352533	352542	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022793	TTAAA	2	10	354111	354120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022793	ATTAT	2	10	354226	354235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022793	ATTTT	2	10	355229	355238	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022793	AATCA	2	10	361312	361321	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022793	ATTTT	2	10	363239	363248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022793	AATAT	2	10	364991	365000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022793	AGTTA	2	10	369371	369380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022793	TATAT	2	10	370862	370871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022793	AAATT	2	10	370978	370987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022793	ATTTG	2	10	373196	373205	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022793	ATTTG	2	10	377605	377614	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022793	TTATT	2	10	377629	377638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022793	TATAT	2	10	377727	377736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022793	TTTCC	2	10	378781	378790	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_022793	GAATA	2	10	379012	379021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022793	ATTTG	2	10	379877	379886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022793	TAATA	2	10	379959	379968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022793	AAATT	2	10	384577	384586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022793	CAATT	2	10	387930	387939	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022793	ATTCT	2	10	388214	388223	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_022793	AATAT	2	10	388270	388279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022793	AATTG	2	10	389309	389318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022793	ATAAA	2	10	393837	393846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022793	TTTTA	2	10	394427	394436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022793	AAAAC	2	10	399446	399455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_022793	TAATA	2	10	400503	400512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022793	ATAAA	2	10	403829	403838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022793	ATTTT	2	10	405152	405161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022793	AGTAA	2	10	406356	406365	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022793	ATTTT	2	10	406915	406924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022793	TATAT	2	10	411722	411731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_022793	TGATT	2	10	474709	474718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_022793	TTTAC	2	10	495028	495037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_022793	TTTCT	2	10	499634	499643	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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291	NC_022793	CGATA	2	10	697149	697158	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.