MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo

Total Repeats: 18680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022793	ATA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022793	ACA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822171
3	NC_022793	AGA	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822171
4	NC_022793	ATT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822171
5	NC_022793	TCT	2	6	457	462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557822171
6	NC_022793	TAC	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822171
7	NC_022793	ACC	2	6	486	491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557822171
8	NC_022793	TAA	2	6	494	499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822171
9	NC_022793	AGC	2	6	621	626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822171
10	NC_022793	AGA	2	6	642	647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822171
11	NC_022793	TGC	2	6	741	746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822171
12	NC_022793	AAT	2	6	760	765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822171
13	NC_022793	AGT	2	6	771	776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822171
14	NC_022793	CTG	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822171
15	NC_022793	TGA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822171
16	NC_022793	TTA	2	6	934	939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822171
17	NC_022793	GCA	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822171
18	NC_022793	CCT	2	6	988	993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822171
19	NC_022793	AGG	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557822171
20	NC_022793	AGA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822171
21	NC_022793	AAC	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822171
22	NC_022793	TAA	2	6	1550	1555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822171
23	NC_022793	ATC	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022793	ATT	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022793	AAT	2	6	1736	1741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022793	TAA	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022793	ATT	2	6	1801	1806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022793	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022793	TAA	2	6	1839	1844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022793	TGA	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022793	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022793	TTA	2	6	1901	1906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022793	GTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022793	CAT	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822172
35	NC_022793	TCA	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822172
36	NC_022793	TTG	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557822172
37	NC_022793	ATA	2	6	2188	2193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822172
38	NC_022793	ATC	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822172
39	NC_022793	CAC	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557822172
40	NC_022793	AAT	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822172
41	NC_022793	GAT	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822172
42	NC_022793	TCA	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822172
43	NC_022793	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822172
44	NC_022793	CGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822172
45	NC_022793	GAA	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022793	ACA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822173
47	NC_022793	CAT	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822173
48	NC_022793	TCC	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822173
49	NC_022793	TAG	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822173
50	NC_022793	CAA	2	6	3466	3471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822173
51	NC_022793	CAA	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822173
52	NC_022793	TCT	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557822173
53	NC_022793	AGA	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822173
54	NC_022793	ATA	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822173
55	NC_022793	ATC	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822174
56	NC_022793	CAT	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822174
57	NC_022793	CTG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822174
58	NC_022793	CAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822174
59	NC_022793	TCA	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822174
60	NC_022793	AGA	2	6	4034	4039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822174
61	NC_022793	ATT	2	6	4074	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822174
62	NC_022793	TAC	3	9	4096	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822174
63	NC_022793	TGC	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822174
64	NC_022793	TCC	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822174
65	NC_022793	AAC	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822174
66	NC_022793	CCT	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822174
67	NC_022793	AAT	2	6	4304	4309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822174
68	NC_022793	GTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557822174
69	NC_022793	TAA	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822174
70	NC_022793	CTC	2	6	4486	4491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822174
71	NC_022793	TAT	2	6	4544	4549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822174
72	NC_022793	TCC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822174
73	NC_022793	ATT	2	6	4557	4562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822174
74	NC_022793	TGA	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022793	CAG	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822175
76	NC_022793	ATC	2	6	4945	4950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822175
77	NC_022793	CAT	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822175
78	NC_022793	TCC	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822175
79	NC_022793	ATA	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822175
80	NC_022793	CCA	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557822175
81	NC_022793	CAA	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822175
82	NC_022793	ACC	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557822175
83	NC_022793	CAT	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822175
84	NC_022793	AAT	2	6	5458	5463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822175
85	NC_022793	ACT	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822175
86	NC_022793	TAC	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022793	ATG	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022793	ATT	2	6	5704	5709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022793	CAG	2	6	5760	5765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822176
90	NC_022793	AAT	2	6	5789	5794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822176
91	NC_022793	TAA	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822176
92	NC_022793	GAT	3	9	5930	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822176
93	NC_022793	GAA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822176
94	NC_022793	CTC	3	9	6030	6038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822176
95	NC_022793	CAT	2	6	6060	6065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822176
96	NC_022793	GTC	2	6	6072	6077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822176
97	NC_022793	TCC	2	6	6193	6198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822176
98	NC_022793	ATT	2	6	6241	6246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822176
99	NC_022793	TCA	2	6	6433	6438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822176
100	NC_022793	ATA	2	6	6582	6587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822176
101	NC_022793	ACA	2	6	6597	6602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822176
102	NC_022793	ACA	2	6	6638	6643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822176
103	NC_022793	GAA	2	6	6740	6745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822176
104	NC_022793	GAT	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822176
105	NC_022793	TTA	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822176
106	NC_022793	TGT	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557822176
107	NC_022793	CAT	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822176
108	NC_022793	ATA	2	6	7024	7029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822176
109	NC_022793	TAA	2	6	7050	7055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022793	AAT	2	6	7086	7091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022793	AAT	2	6	7304	7309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822177
112	NC_022793	TAT	3	9	7343	7351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822177
113	NC_022793	AGC	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822177
114	NC_022793	ACA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822177
115	NC_022793	GAT	2	6	7527	7532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822177
116	NC_022793	CAA	2	6	7569	7574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822177
117	NC_022793	TTA	2	6	7591	7596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822177
118	NC_022793	TGA	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822177
119	NC_022793	ATA	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822177
120	NC_022793	CTT	2	6	7857	7862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557822177
121	NC_022793	GGA	2	6	7941	7946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557822177
122	NC_022793	AAC	2	6	8042	8047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822177
123	NC_022793	TGA	2	6	8056	8061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822177
124	NC_022793	TGA	2	6	8086	8091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822177
125	NC_022793	ATA	2	6	8194	8199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822177
126	NC_022793	ATA	2	6	8218	8223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822177
127	NC_022793	GCG	2	6	8284	8289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557822177
128	NC_022793	AAT	2	6	8313	8318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822177
129	NC_022793	ACA	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822177
130	NC_022793	GAT	2	6	8472	8477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822177
131	NC_022793	AAG	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822177
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133	NC_022793	ATT	2	6	8627	8632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_022793	ATA	2	6	17176	17181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822184
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