MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo

Total Repeats: 4353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022793	ATA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022793	ATC	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022793	ATT	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022793	AAT	2	6	1736	1741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022793	TAA	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022793	ATT	2	6	1801	1806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022793	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022793	TAA	2	6	1839	1844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022793	TGA	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022793	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022793	TTA	2	6	1901	1906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022793	GTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022793	GAA	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022793	TGA	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022793	TAC	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022793	ATG	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022793	ATT	2	6	5704	5709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022793	TAA	2	6	7050	7055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022793	AAT	2	6	7086	7091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022793	TAA	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022793	ATT	2	6	8627	8632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022793	ATT	2	6	8796	8801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022793	ATT	2	6	8803	8808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022793	GCC	2	6	8886	8891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_022793	AAT	2	6	8928	8933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022793	ATT	2	6	8966	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022793	ATA	2	6	9024	9029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022793	GTA	2	6	9117	9122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022793	ATT	2	6	9125	9130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022793	ATA	2	6	9145	9150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022793	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022793	TAT	2	6	9219	9224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022793	ATA	2	6	9274	9279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022793	TAA	3	9	9288	9296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022793	CTT	2	6	9992	9997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022793	TAG	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022793	ATC	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022793	ATA	2	6	10171	10176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022793	ATT	2	6	10282	10287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022793	CAT	2	6	10288	10293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022793	ATT	2	6	10349	10354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022793	AAT	2	6	10358	10363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022793	TTA	2	6	10417	10422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022793	CTT	2	6	10479	10484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022793	TAT	2	6	10512	10517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022793	TAT	2	6	10551	10556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022793	TAA	2	6	12566	12571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022793	AGA	2	6	12588	12593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022793	CAA	2	6	12609	12614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022793	ATT	2	6	12625	12630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022793	AGT	2	6	13845	13850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022793	ATT	2	6	13941	13946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022793	ATA	2	6	14030	14035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022793	ATA	2	6	14088	14093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022793	GGA	2	6	14105	14110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022793	AAG	2	6	14234	14239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022793	TAT	2	6	14240	14245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022793	CAT	2	6	14250	14255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022793	CTA	2	6	14289	14294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022793	ATA	2	6	14295	14300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022793	CTA	2	6	14312	14317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022793	ATT	2	6	14338	14343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022793	TTA	2	6	14424	14429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022793	AGA	2	6	14766	14771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022793	GAA	2	6	14795	14800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022793	ATA	2	6	15264	15269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022793	AAT	2	6	16579	16584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022793	ATT	2	6	16640	16645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022793	AGC	2	6	16671	16676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022793	ATG	2	6	17478	17483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022793	TAA	2	6	17488	17493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022793	ATA	2	6	17526	17531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022793	ATA	2	6	17619	17624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022793	AAT	2	6	17662	17667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022793	AAT	2	6	17702	17707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022793	ATT	2	6	17743	17748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022793	AAC	2	6	17768	17773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022793	ATA	2	6	17846	17851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022793	ACC	2	6	17886	17891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_022793	TAA	2	6	17900	17905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022793	ATA	2	6	18027	18032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022793	TAC	2	6	18682	18687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022793	AGG	2	6	19795	19800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022793	AAT	2	6	19843	19848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022793	AAG	2	6	21191	21196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022793	TCA	2	6	22244	22249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022793	AGC	2	6	22255	22260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022793	AAT	2	6	24304	24309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022793	ATA	2	6	24337	24342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022793	ATA	2	6	24366	24371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022793	TGA	2	6	24392	24397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022793	TAA	2	6	24428	24433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022793	ATT	2	6	24435	24440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022793	AAC	2	6	24492	24497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022793	TAA	2	6	24604	24609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022793	TAA	2	6	26089	26094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022793	CTT	2	6	26960	26965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022793	TAA	2	6	27023	27028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022793	AGA	2	6	27080	27085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022793	ACT	2	6	27098	27103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022793	TAT	2	6	27104	27109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022793	ATT	2	6	27120	27125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022793	TAA	2	6	27159	27164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022793	AGT	2	6	27228	27233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022793	TCA	2	6	27255	27260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022793	AAT	2	6	27302	27307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022793	AGC	2	6	27340	27345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022793	TAA	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022793	ATA	2	6	27379	27384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022793	ATT	2	6	27417	27422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022793	GCC	2	6	27429	27434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_022793	TAA	2	6	27436	27441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022793	TAA	2	6	27446	27451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022793	TAA	2	6	27456	27461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022793	AAT	2	6	27477	27482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022793	TAT	2	6	27589	27594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022793	ATT	2	6	27601	27606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022793	ATA	2	6	27776	27781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022793	ATG	2	6	27804	27809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022793	ATA	2	6	27826	27831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022793	TAA	2	6	27837	27842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022793	ACC	2	6	29460	29465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022793	CTT	2	6	29498	29503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022793	TAT	2	6	29504	29509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022793	TAG	2	6	34369	34374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022793	AAT	2	6	34396	34401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022793	TAA	2	6	34414	34419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022793	GAT	2	6	34431	34436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022793	GCA	2	6	34445	34450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022793	ATA	2	6	34488	34493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022793	AAT	2	6	34579	34584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022793	TCC	2	6	36878	36883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_022793	ATA	2	6	36914	36919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022793	TCA	2	6	36923	36928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022793	TAT	2	6	36995	37000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022793	ATA	2	6	37012	37017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022793	AAT	2	6	38452	38457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022793	ACC	2	6	38458	38463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_022793	AAT	2	6	38592	38597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022793	ATT	2	6	38724	38729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_022793	ATT	3	9	39062	39070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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