MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022786	TAAACA	2	12	18214	18225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022786	TGTTTT	2	12	50992	51003	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022786	CTTACG	2	12	54922	54933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022786	GGGTAA	2	12	59835	59846	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022786	TTGGAT	2	12	105159	105170	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022786	GCCCCC	2	12	130284	130295	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
7	NC_022786	TTAGGG	2	12	131640	131651	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022786	GCTGGG	2	12	157788	157799	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022786	CTTCAC	2	12	165125	165136	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022786	GGCATC	2	12	201503	201514	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022786	TAAACG	2	12	316472	316483	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022786	TGGCGG	2	12	347796	347807	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022786	GGATGA	2	12	360829	360840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022786	GGCCCG	2	12	393344	393355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022786	TGAAGA	2	12	459959	459970	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022786	CCCGTG	2	12	565701	565712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022786	CTCTTT	2	12	578088	578099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022786	GTTTTC	2	12	609422	609433	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022786	ACAGTA	2	12	680662	680673	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022786	TTAGGG	2	12	691370	691381	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022786	GATGGG	2	12	693075	693086	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022786	AACCAA	2	12	721531	721542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022786	ACCAAT	2	12	727536	727547	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022786	GCCGCG	2	12	775184	775195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022786	CCCATA	2	12	870418	870429	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022786	ATGGAC	2	12	881722	881733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022786	CCTTCT	2	12	883859	883870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022786	TTAACC	2	12	885107	885118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022786	TATAGG	2	12	892934	892945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022786	CCAGCC	2	12	920929	920940	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_022786	CCTCTC	2	12	923102	923113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_022786	GTATTT	2	12	959855	959866	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022786	CTACTT	2	12	968626	968637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022786	TGAAAG	2	12	968799	968810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022786	AGGAGA	2	12	980550	980561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022786	GCTAAC	2	12	1013820	1013831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022786	GTTTAA	2	12	1032017	1032028	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022786	AAAGAC	2	12	1127057	1127068	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022786	GCCTTT	2	12	1134110	1134121	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022786	CGGTAT	2	12	1391441	1391452	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022786	ATCACT	2	12	1445470	1445481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022786	ATGAAG	2	12	1445494	1445505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022786	CTCTTC	2	12	1508842	1508853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022786	TACCCC	2	12	1662993	1663004	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_022786	CAAGGC	2	12	1666789	1666800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.