MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022786	CTTCT	2	10	176	185	0 %	60 %	0 %	40 %	557693446
2	NC_022786	GCGAT	2	10	3539	3548	20 %	20 %	40 %	20 %	557693449
3	NC_022786	CGGTG	2	10	5208	5217	0 %	20 %	60 %	20 %	557693452
4	NC_022786	CTCTG	2	10	5923	5932	0 %	40 %	20 %	40 %	557693453
5	NC_022786	GATGG	2	10	6464	6473	20 %	20 %	60 %	0 %	557693455
6	NC_022786	TGAGG	2	10	7099	7108	20 %	20 %	60 %	0 %	557693456
7	NC_022786	TCTCC	2	10	7170	7179	0 %	40 %	0 %	60 %	557693456
8	NC_022786	GTTGC	2	10	8209	8218	0 %	40 %	40 %	20 %	557693457
9	NC_022786	GCGGA	2	10	14318	14327	20 %	0 %	60 %	20 %	557693462
10	NC_022786	CTTCT	2	10	16265	16274	0 %	60 %	0 %	40 %	557693465
11	NC_022786	CAGAC	2	10	19745	19754	40 %	0 %	20 %	40 %	557693469
12	NC_022786	TACCG	2	10	21492	21501	20 %	20 %	20 %	40 %	557693470
13	NC_022786	TCAAC	2	10	23873	23882	40 %	20 %	0 %	40 %	557693470
14	NC_022786	AGCCT	2	10	25610	25619	20 %	20 %	20 %	40 %	557693471
15	NC_022786	AGAAA	2	10	25681	25690	80 %	0 %	20 %	0 %	557693471
16	NC_022786	ATTGG	2	10	26585	26594	20 %	40 %	40 %	0 %	557693471
17	NC_022786	CTTCG	2	10	29866	29875	0 %	40 %	20 %	40 %	557693475
18	NC_022786	CAGTC	2	10	38124	38133	20 %	20 %	20 %	40 %	557693481
19	NC_022786	GGATT	2	10	39544	39553	20 %	40 %	40 %	0 %	557693482
20	NC_022786	TATGT	2	10	41779	41788	20 %	60 %	20 %	0 %	557693484
21	NC_022786	AGAAT	2	10	42064	42073	60 %	20 %	20 %	0 %	557693484
22	NC_022786	CTGTT	2	10	42742	42751	0 %	60 %	20 %	20 %	557693485
23	NC_022786	ACCGA	2	10	43738	43747	40 %	0 %	20 %	40 %	557693485
24	NC_022786	TGGGT	2	10	44682	44691	0 %	40 %	60 %	0 %	557693485
25	NC_022786	TTCTC	2	10	45248	45257	0 %	60 %	0 %	40 %	557693487
26	NC_022786	GAAGG	2	10	46842	46851	40 %	0 %	60 %	0 %	557693488
27	NC_022786	CGGCT	2	10	47227	47236	0 %	20 %	40 %	40 %	557693488
28	NC_022786	AGACC	2	10	47533	47542	40 %	0 %	20 %	40 %	557693488
29	NC_022786	GTGAA	2	10	49687	49696	40 %	20 %	40 %	0 %	557693489
30	NC_022786	TCCTC	2	10	57359	57368	0 %	40 %	0 %	60 %	557693496
31	NC_022786	ACGTC	2	10	66293	66302	20 %	20 %	20 %	40 %	557693502
32	NC_022786	CTGGG	2	10	73009	73018	0 %	20 %	60 %	20 %	557693509
33	NC_022786	CCAGC	2	10	73045	73054	20 %	0 %	20 %	60 %	557693509
34	NC_022786	ATGCT	2	10	73737	73746	20 %	40 %	20 %	20 %	557693509
35	NC_022786	CGTTG	2	10	77715	77724	0 %	40 %	40 %	20 %	557693512
36	NC_022786	GGCTG	2	10	78511	78520	0 %	20 %	60 %	20 %	557693513
37	NC_022786	TATAC	2	10	85828	85837	40 %	40 %	0 %	20 %	557693520
38	NC_022786	AGGCG	2	10	89039	89048	20 %	0 %	60 %	20 %	557693523
39	NC_022786	GCCCT	2	10	91830	91839	0 %	20 %	20 %	60 %	557693526
40	NC_022786	AGGCG	2	10	93191	93200	20 %	0 %	60 %	20 %	557693528
41	NC_022786	CCACA	2	10	96274	96283	40 %	0 %	0 %	60 %	557693529
42	NC_022786	GCATC	2	10	97622	97631	20 %	20 %	20 %	40 %	557693532
43	NC_022786	TGCTT	2	10	101656	101665	0 %	60 %	20 %	20 %	557693534
44	NC_022786	ATGAA	2	10	108626	108635	60 %	20 %	20 %	0 %	557693539
45	NC_022786	TCTCC	2	10	109140	109149	0 %	40 %	0 %	60 %	557693539
46	NC_022786	AACAG	2	10	110038	110047	60 %	0 %	20 %	20 %	557693541
47	NC_022786	GGCAC	2	10	111871	111880	20 %	0 %	40 %	40 %	557693543
48	NC_022786	GGGCT	2	10	113259	113268	0 %	20 %	60 %	20 %	557693545
49	NC_022786	GGGCT	2	10	114043	114052	0 %	20 %	60 %	20 %	557693545
50	NC_022786	TTTTC	2	10	114192	114201	0 %	80 %	0 %	20 %	557693545
51	NC_022786	AAAGC	2	10	115559	115568	60 %	0 %	20 %	20 %	557693547
52	NC_022786	CTCGA	2	10	124267	124276	20 %	20 %	20 %	40 %	557693557
53	NC_022786	CCCAG	2	10	125745	125754	20 %	0 %	20 %	60 %	557693558
54	NC_022786	TGGCG	2	10	126186	126195	0 %	20 %	60 %	20 %	557693559
55	NC_022786	CCACT	2	10	127638	127647	20 %	20 %	0 %	60 %	557693560
56	NC_022786	AAGCC	2	10	128315	128324	40 %	0 %	20 %	40 %	557693561
57	NC_022786	AGCCA	2	10	135553	135562	40 %	0 %	20 %	40 %	557693569
58	NC_022786	TCACA	2	10	136161	136170	40 %	20 %	0 %	40 %	557693569
59	NC_022786	CCACA	2	10	138569	138578	40 %	0 %	0 %	60 %	557693572
60	NC_022786	CCCCG	2	10	138697	138706	0 %	0 %	20 %	80 %	557693572
61	NC_022786	CCGCA	2	10	139105	139114	20 %	0 %	20 %	60 %	557693573
62	NC_022786	ACCTC	2	10	140723	140732	20 %	20 %	0 %	60 %	557693574
63	NC_022786	TTTTC	2	10	141346	141355	0 %	80 %	0 %	20 %	557693576
64	NC_022786	GTGGA	2	10	141514	141523	20 %	20 %	60 %	0 %	557693577
65	NC_022786	TGACA	2	10	142084	142093	40 %	20 %	20 %	20 %	557693577
66	NC_022786	ACCAA	2	10	144488	144497	60 %	0 %	0 %	40 %	557693580
67	NC_022786	TGTCT	2	10	144794	144803	0 %	60 %	20 %	20 %	557693580
68	NC_022786	AAGCG	2	10	145249	145258	40 %	0 %	40 %	20 %	557693580
69	NC_022786	ATCTT	2	10	146082	146091	20 %	60 %	0 %	20 %	557693580
70	NC_022786	TGGCT	2	10	149167	149176	0 %	40 %	40 %	20 %	557693582
71	NC_022786	CTAAC	2	10	151434	151443	40 %	20 %	0 %	40 %	557693585
72	NC_022786	TCCAC	2	10	153754	153763	20 %	20 %	0 %	60 %	557693588
73	NC_022786	GGTTC	2	10	158178	158187	0 %	40 %	40 %	20 %	557693593
74	NC_022786	ATGAG	2	10	160168	160177	40 %	20 %	40 %	0 %	557693596
75	NC_022786	CATCC	2	10	161519	161528	20 %	20 %	0 %	60 %	557693597
76	NC_022786	TATCT	2	10	162448	162457	20 %	60 %	0 %	20 %	557693597
77	NC_022786	AAGGC	2	10	163595	163604	40 %	0 %	40 %	20 %	557693597
78	NC_022786	AGAGC	2	10	164211	164220	40 %	0 %	40 %	20 %	557693598
79	NC_022786	AACAC	2	10	165242	165251	60 %	0 %	0 %	40 %	557693599
80	NC_022786	GGCTG	2	10	168369	168378	0 %	20 %	60 %	20 %	557693603
81	NC_022786	CTCTC	2	10	168498	168507	0 %	40 %	0 %	60 %	557693603
82	NC_022786	TGTGG	2	10	170542	170551	0 %	40 %	60 %	0 %	557693606
83	NC_022786	AAGAG	2	10	170821	170830	60 %	0 %	40 %	0 %	557693607
84	NC_022786	AACAA	2	10	171668	171677	80 %	0 %	0 %	20 %	557693608
85	NC_022786	ATACG	2	10	172874	172883	40 %	20 %	20 %	20 %	557693609
86	NC_022786	TCTCC	2	10	175623	175632	0 %	40 %	0 %	60 %	557693611
87	NC_022786	TGCTC	2	10	177661	177670	0 %	40 %	20 %	40 %	557693613
88	NC_022786	GGCTT	2	10	181621	181630	0 %	40 %	40 %	20 %	557693618
89	NC_022786	CCTGT	2	10	181990	181999	0 %	40 %	20 %	40 %	557693619
90	NC_022786	GAGAA	2	10	182546	182555	60 %	0 %	40 %	0 %	557693620
91	NC_022786	TTGGT	2	10	183241	183250	0 %	60 %	40 %	0 %	557693622
92	NC_022786	CGGCG	2	10	183379	183388	0 %	0 %	60 %	40 %	557693622
93	NC_022786	GTGTA	2	10	183553	183562	20 %	40 %	40 %	0 %	557693622
94	NC_022786	TTCAT	2	10	185197	185206	20 %	60 %	0 %	20 %	557693623
95	NC_022786	TGGGC	2	10	189434	189443	0 %	20 %	60 %	20 %	557693627
96	NC_022786	AGCTG	2	10	190525	190534	20 %	20 %	40 %	20 %	557693627
97	NC_022786	TCCCA	2	10	191742	191751	20 %	20 %	0 %	60 %	557693629
98	NC_022786	TTGTG	2	10	197519	197528	0 %	60 %	40 %	0 %	557693635
99	NC_022786	TTGGT	2	10	197575	197584	0 %	60 %	40 %	0 %	557693635
100	NC_022786	GGCTT	2	10	198002	198011	0 %	40 %	40 %	20 %	557693635
101	NC_022786	GGTGA	2	10	200242	200251	20 %	20 %	60 %	0 %	557693637
102	NC_022786	GAGCC	2	10	203686	203695	20 %	0 %	40 %	40 %	557693640
103	NC_022786	GCTTG	2	10	205958	205967	0 %	40 %	40 %	20 %	557693642
104	NC_022786	TTGAT	2	10	207933	207942	20 %	60 %	20 %	0 %	557693643
105	NC_022786	AGCAA	2	10	209958	209967	60 %	0 %	20 %	20 %	557693646
106	NC_022786	GCTCG	2	10	215675	215684	0 %	20 %	40 %	40 %	557693652
107	NC_022786	GCGTC	2	10	216813	216822	0 %	20 %	40 %	40 %	557693653
108	NC_022786	ATGTC	2	10	218979	218988	20 %	40 %	20 %	20 %	557693655
109	NC_022786	GAACA	2	10	225788	225797	60 %	0 %	20 %	20 %	557693661
110	NC_022786	CCGTT	2	10	228255	228264	0 %	40 %	20 %	40 %	557693664
111	NC_022786	AGACG	2	10	229648	229657	40 %	0 %	40 %	20 %	557693664
112	NC_022786	CTGAA	2	10	229956	229965	40 %	20 %	20 %	20 %	557693664
113	NC_022786	ATGGA	2	10	231993	232002	40 %	20 %	40 %	0 %	557693667
114	NC_022786	TAGAT	2	10	233521	233530	40 %	40 %	20 %	0 %	557693669
115	NC_022786	GCCAA	2	10	234327	234336	40 %	0 %	20 %	40 %	557693670
116	NC_022786	AACAC	2	10	234900	234909	60 %	0 %	0 %	40 %	557693670
117	NC_022786	GCTGA	2	10	235046	235055	20 %	20 %	40 %	20 %	557693671
118	NC_022786	CGAGG	2	10	235923	235932	20 %	0 %	60 %	20 %	557693672
119	NC_022786	CGAGC	2	10	240012	240021	20 %	0 %	40 %	40 %	557693676
120	NC_022786	CATCA	2	10	246140	246149	40 %	20 %	0 %	40 %	557693680
121	NC_022786	AGCCA	2	10	247526	247535	40 %	0 %	20 %	40 %	557693681
122	NC_022786	CGCCT	2	10	249296	249305	0 %	20 %	20 %	60 %	557693683
123	NC_022786	TCAGG	2	10	250044	250053	20 %	20 %	40 %	20 %	557693683
124	NC_022786	GAGCT	2	10	256458	256467	20 %	20 %	40 %	20 %	557693689
125	NC_022786	GCCGC	2	10	257222	257231	0 %	0 %	40 %	60 %	557693690
126	NC_022786	GCTCC	2	10	259125	259134	0 %	20 %	20 %	60 %	557693693
127	NC_022786	ACCTC	2	10	263738	263747	20 %	20 %	0 %	60 %	557693699
128	NC_022786	AAACC	2	10	264899	264908	60 %	0 %	0 %	40 %	557693701
129	NC_022786	CTGGG	2	10	267109	267118	0 %	20 %	60 %	20 %	557693703
130	NC_022786	ATGTG	2	10	268856	268865	20 %	40 %	40 %	0 %	557693705
131	NC_022786	ATCAA	2	10	269687	269696	60 %	20 %	0 %	20 %	557693705
132	NC_022786	ATCCA	2	10	270207	270216	40 %	20 %	0 %	40 %	557693706
133	NC_022786	CGATG	2	10	271504	271513	20 %	20 %	40 %	20 %	557693707
134	NC_022786	AGCTA	2	10	272807	272816	40 %	20 %	20 %	20 %	557693708
135	NC_022786	GGCTG	2	10	279474	279483	0 %	20 %	60 %	20 %	557693717
136	NC_022786	TTGTT	2	10	279505	279514	0 %	80 %	20 %	0 %	557693717
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149	NC_022786	TGGTG	2	10	305208	305217	0 %	40 %	60 %	0 %	557693748
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261	NC_022786	CACTT	2	10	528866	528875	20 %	40 %	0 %	40 %	557693990
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380	NC_022786	CCATA	2	10	749436	749445	40 %	20 %	0 %	40 %	557694211
381	NC_022786	ACATC	2	10	750535	750544	40 %	20 %	0 %	40 %	557694212
382	NC_022786	CCAAC	2	10	754885	754894	40 %	0 %	0 %	60 %	557694214
383	NC_022786	CCATG	2	10	756333	756342	20 %	20 %	20 %	40 %	557694215
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387	NC_022786	GGATG	2	10	767643	767652	20 %	20 %	60 %	0 %	557694228
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389	NC_022786	TCAGG	2	10	769190	769199	20 %	20 %	40 %	20 %	557694229
390	NC_022786	TTCTC	2	10	772240	772249	0 %	60 %	0 %	40 %	557694233
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498	NC_022786	GAGAG	2	10	1015139	1015148	40 %	0 %	60 %	0 %	557694475
499	NC_022786	GACCC	2	10	1015185	1015194	20 %	0 %	20 %	60 %	557694475
500	NC_022786	TCAGC	2	10	1018261	1018270	20 %	20 %	20 %	40 %	557694478

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