MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 3288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022786	CTTT	2	8	186	193	0 %	75 %	0 %	25 %	557693446
2	NC_022786	ATCT	2	8	545	552	25 %	50 %	0 %	25 %	557693446
3	NC_022786	AGGA	2	8	803	810	50 %	0 %	50 %	0 %	557693446
4	NC_022786	AGCG	2	8	907	914	25 %	0 %	50 %	25 %	557693446
5	NC_022786	CCAT	2	8	2372	2379	25 %	25 %	0 %	50 %	557693447
6	NC_022786	GCAT	2	8	3760	3767	25 %	25 %	25 %	25 %	557693449
7	NC_022786	TCTT	2	8	3910	3917	0 %	75 %	0 %	25 %	557693449
8	NC_022786	TGGA	2	8	4307	4314	25 %	25 %	50 %	0 %	557693450
9	NC_022786	GTCT	2	8	4371	4378	0 %	50 %	25 %	25 %	557693450
10	NC_022786	CCGG	2	8	4656	4663	0 %	0 %	50 %	50 %	557693451
11	NC_022786	TCAA	2	8	6316	6323	50 %	25 %	0 %	25 %	557693454
12	NC_022786	ATGT	2	8	7136	7143	25 %	50 %	25 %	0 %	557693456
13	NC_022786	CATC	2	8	8084	8091	25 %	25 %	0 %	50 %	557693457
14	NC_022786	CTTC	2	8	8386	8393	0 %	50 %	0 %	50 %	557693458
15	NC_022786	TTTC	2	8	8865	8872	0 %	75 %	0 %	25 %	557693458
16	NC_022786	CCTT	2	8	9894	9901	0 %	50 %	0 %	50 %	557693458
17	NC_022786	TGTT	2	8	10342	10349	0 %	75 %	25 %	0 %	557693459
18	NC_022786	CCAT	2	8	10620	10627	25 %	25 %	0 %	50 %	557693459
19	NC_022786	ATCA	2	8	10683	10690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022786	GATT	2	8	10820	10827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022786	GCCA	2	8	11792	11799	25 %	0 %	25 %	50 %	557693460
22	NC_022786	CAAC	2	8	12555	12562	50 %	0 %	0 %	50 %	557693461
23	NC_022786	CACC	2	8	12738	12745	25 %	0 %	0 %	75 %	557693461
24	NC_022786	TGGC	2	8	13714	13721	0 %	25 %	50 %	25 %	557693462
25	NC_022786	GCTG	2	8	13790	13797	0 %	25 %	50 %	25 %	557693462
26	NC_022786	AAGG	2	8	15027	15034	50 %	0 %	50 %	0 %	557693464
27	NC_022786	GCTG	2	8	15308	15315	0 %	25 %	50 %	25 %	557693464
28	NC_022786	TGGT	2	8	15625	15632	0 %	50 %	50 %	0 %	557693464
29	NC_022786	CTGT	2	8	15921	15928	0 %	50 %	25 %	25 %	557693465
30	NC_022786	TCTT	2	8	16443	16450	0 %	75 %	0 %	25 %	557693465
31	NC_022786	AATA	2	8	16925	16932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022786	ATTG	2	8	18181	18188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022786	GGCA	2	8	18254	18261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022786	TTTG	2	8	18482	18489	0 %	75 %	25 %	0 %	557693468
35	NC_022786	TAGA	2	8	18572	18579	50 %	25 %	25 %	0 %	557693468
36	NC_022786	TGTC	2	8	18943	18950	0 %	50 %	25 %	25 %	557693468
37	NC_022786	TTTC	2	8	19187	19194	0 %	75 %	0 %	25 %	557693468
38	NC_022786	GTCT	2	8	19507	19514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022786	GCCT	2	8	19797	19804	0 %	25 %	25 %	50 %	557693469
40	NC_022786	GCAG	2	8	19805	19812	25 %	0 %	50 %	25 %	557693469
41	NC_022786	CGCC	2	8	19837	19844	0 %	0 %	25 %	75 %	557693469
42	NC_022786	AGCC	2	8	20021	20028	25 %	0 %	25 %	50 %	557693469
43	NC_022786	TGGG	2	8	20318	20325	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022786	CTCC	2	8	20372	20379	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_022786	CGCC	2	8	20516	20523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_022786	GGAT	2	8	20589	20596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022786	GCTA	2	8	20753	20760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022786	GGAA	2	8	21425	21432	50 %	0 %	50 %	0 %	557693470
49	NC_022786	GGCT	2	8	21796	21803	0 %	25 %	50 %	25 %	557693470
50	NC_022786	AGGA	2	8	21893	21900	50 %	0 %	50 %	0 %	557693470
51	NC_022786	CCCT	2	8	22866	22873	0 %	25 %	0 %	75 %	557693470
52	NC_022786	ACTA	2	8	22921	22928	50 %	25 %	0 %	25 %	557693470
53	NC_022786	ATAG	2	8	23536	23543	50 %	25 %	25 %	0 %	557693470
54	NC_022786	ATAC	2	8	23784	23791	50 %	25 %	0 %	25 %	557693470
55	NC_022786	TGAT	2	8	23999	24006	25 %	50 %	25 %	0 %	557693470
56	NC_022786	AAGA	2	8	24263	24270	75 %	0 %	25 %	0 %	557693471
57	NC_022786	GGGA	2	8	24404	24411	25 %	0 %	75 %	0 %	557693471
58	NC_022786	TGGT	2	8	24624	24631	0 %	50 %	50 %	0 %	557693471
59	NC_022786	CTCC	2	8	25327	25334	0 %	25 %	0 %	75 %	557693471
60	NC_022786	TACC	2	8	25343	25350	25 %	25 %	0 %	50 %	557693471
61	NC_022786	ATCA	2	8	25377	25384	50 %	25 %	0 %	25 %	557693471
62	NC_022786	TAGA	2	8	25500	25507	50 %	25 %	25 %	0 %	557693471
63	NC_022786	GAAG	2	8	25508	25515	50 %	0 %	50 %	0 %	557693471
64	NC_022786	AATG	2	8	25988	25995	50 %	25 %	25 %	0 %	557693471
65	NC_022786	GATA	2	8	26437	26444	50 %	25 %	25 %	0 %	557693471
66	NC_022786	ACCG	2	8	27387	27394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022786	ATAA	2	8	28615	28622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022786	TCTA	2	8	29591	29598	25 %	50 %	0 %	25 %	557693475
69	NC_022786	GATT	2	8	30010	30017	25 %	50 %	25 %	0 %	557693475
70	NC_022786	TTAT	2	8	30341	30348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022786	GATA	2	8	30740	30747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022786	TTGT	2	8	30962	30969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022786	TCTA	2	8	31073	31080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022786	AGGT	2	8	31304	31311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022786	AGTT	2	8	31790	31797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022786	GAAA	2	8	31961	31968	75 %	0 %	25 %	0 %	557693476
77	NC_022786	CTTT	2	8	32607	32614	0 %	75 %	0 %	25 %	557693476
78	NC_022786	TAGC	2	8	32675	32682	25 %	25 %	25 %	25 %	557693476
79	NC_022786	GAAA	2	8	33057	33064	75 %	0 %	25 %	0 %	557693477
80	NC_022786	GAAT	2	8	33875	33882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022786	CCGT	2	8	34044	34051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022786	TATC	2	8	34477	34484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022786	TTCG	2	8	34787	34794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_022786	CAAC	2	8	35129	35136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022786	ATTC	2	8	36765	36772	25 %	50 %	0 %	25 %	557693479
86	NC_022786	TATG	2	8	36777	36784	25 %	50 %	25 %	0 %	557693479
87	NC_022786	TAAT	3	12	37353	37364	50 %	50 %	0 %	0 %	557693480
88	NC_022786	TCAG	2	8	37886	37893	25 %	25 %	25 %	25 %	557693481
89	NC_022786	TATG	2	8	38416	38423	25 %	50 %	25 %	0 %	557693481
90	NC_022786	ATGG	2	8	39262	39269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022786	GGGT	2	8	39942	39949	0 %	25 %	75 %	0 %	557693482
92	NC_022786	CTGG	2	8	40330	40337	0 %	25 %	50 %	25 %	557693483
93	NC_022786	TCAG	2	8	40953	40960	25 %	25 %	25 %	25 %	557693483
94	NC_022786	GTCG	2	8	42333	42340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022786	GATG	2	8	42668	42675	25 %	25 %	50 %	0 %	557693485
96	NC_022786	CATC	2	8	43729	43736	25 %	25 %	0 %	50 %	557693485
97	NC_022786	GAAT	2	8	44083	44090	50 %	25 %	25 %	0 %	557693485
98	NC_022786	GCCT	2	8	44263	44270	0 %	25 %	25 %	50 %	557693485
99	NC_022786	GATG	2	8	44639	44646	25 %	25 %	50 %	0 %	557693485
100	NC_022786	ATGG	2	8	45285	45292	25 %	25 %	50 %	0 %	557693487
101	NC_022786	AGGC	2	8	46061	46068	25 %	0 %	50 %	25 %	557693487
102	NC_022786	CCTC	2	8	46207	46214	0 %	25 %	0 %	75 %	557693487
103	NC_022786	CCTA	2	8	47114	47121	25 %	25 %	0 %	50 %	557693488
104	NC_022786	GCTT	2	8	47736	47743	0 %	50 %	25 %	25 %	557693488
105	NC_022786	ACAG	2	8	48734	48741	50 %	0 %	25 %	25 %	557693488
106	NC_022786	CCAC	2	8	48927	48934	25 %	0 %	0 %	75 %	557693488
107	NC_022786	CGCT	2	8	49560	49567	0 %	25 %	25 %	50 %	557693489
108	NC_022786	ATAC	2	8	49754	49761	50 %	25 %	0 %	25 %	557693489
109	NC_022786	GCTG	2	8	49970	49977	0 %	25 %	50 %	25 %	557693489
110	NC_022786	AAAT	2	8	50867	50874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022786	TCTA	2	8	51044	51051	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022786	GATG	2	8	51146	51153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022786	TTCT	2	8	51170	51177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022786	ATTA	2	8	52832	52839	50 %	50 %	0 %	0 %	557693490
115	NC_022786	GTTT	2	8	53173	53180	0 %	75 %	25 %	0 %	557693490
116	NC_022786	AAAG	2	8	53317	53324	75 %	0 %	25 %	0 %	557693490
117	NC_022786	CCCT	2	8	54327	54334	0 %	25 %	0 %	75 %	557693491
118	NC_022786	GGAG	2	8	54358	54365	25 %	0 %	75 %	0 %	557693491
119	NC_022786	CCAA	2	8	54396	54403	50 %	0 %	0 %	50 %	557693491
120	NC_022786	AAAT	2	8	54750	54757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022786	TTTG	2	8	54958	54965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022786	TCCT	2	8	55395	55402	0 %	50 %	0 %	50 %	557693492
123	NC_022786	TCCA	2	8	55482	55489	25 %	25 %	0 %	50 %	557693492
124	NC_022786	TATC	2	8	55529	55536	25 %	50 %	0 %	25 %	557693492
125	NC_022786	TTCT	2	8	55601	55608	0 %	75 %	0 %	25 %	557693493
126	NC_022786	TGTT	2	8	56055	56062	0 %	75 %	25 %	0 %	557693494
127	NC_022786	TCTA	2	8	56462	56469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022786	CAGC	2	8	56795	56802	25 %	0 %	25 %	50 %	557693496
129	NC_022786	TTGC	2	8	57176	57183	0 %	50 %	25 %	25 %	557693496
130	NC_022786	CAGC	2	8	58028	58035	25 %	0 %	25 %	50 %	557693496
131	NC_022786	GACG	2	8	58224	58231	25 %	0 %	50 %	25 %	557693496
132	NC_022786	CAAC	2	8	59111	59118	50 %	0 %	0 %	50 %	557693496
133	NC_022786	CATA	2	8	59509	59516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022786	ACAG	2	8	60049	60056	50 %	0 %	25 %	25 %	557693498
135	NC_022786	TACA	2	8	60182	60189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022786	GGAA	2	8	60225	60232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022786	TAGT	2	8	60363	60370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022786	CCAG	2	8	60649	60656	25 %	0 %	25 %	50 %	557693499
139	NC_022786	AGCA	2	8	60696	60703	50 %	0 %	25 %	25 %	557693499
140	NC_022786	TAAA	2	8	60950	60957	75 %	25 %	0 %	0 %	557693499
141	NC_022786	GTAT	2	8	61731	61738	25 %	50 %	25 %	0 %	557693500
142	NC_022786	ACCC	2	8	62760	62767	25 %	0 %	0 %	75 %	557693500
143	NC_022786	ATGC	2	8	62836	62843	25 %	25 %	25 %	25 %	557693500
144	NC_022786	CTCC	2	8	63411	63418	0 %	25 %	0 %	75 %	557693500
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