MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 35726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022785	GTCC	2	8	119	126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022785	GGCT	2	8	255	262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022785	AGGG	2	8	657	664	25 %	0 %	75 %	0 %	557683038
4	NC_022785	CACG	2	8	847	854	25 %	0 %	25 %	50 %	557683038
5	NC_022785	GGTG	2	8	1187	1194	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022785	GGCG	2	8	1599	1606	0 %	0 %	75 %	25 %	557683039
7	NC_022785	CGGC	2	8	1977	1984	0 %	0 %	50 %	50 %	557683039
8	NC_022785	CTGC	2	8	2164	2171	0 %	25 %	25 %	50 %	557683039
9	NC_022785	CGTG	2	8	2352	2359	0 %	25 %	50 %	25 %	557683039
10	NC_022785	GGTG	2	8	2978	2985	0 %	25 %	75 %	0 %	557683039
11	NC_022785	GTGG	2	8	3600	3607	0 %	25 %	75 %	0 %	557683039
12	NC_022785	CCCG	2	8	3951	3958	0 %	0 %	25 %	75 %	557683040
13	NC_022785	GCAG	2	8	4770	4777	25 %	0 %	50 %	25 %	557683041
14	NC_022785	GGTG	2	8	5008	5015	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022785	CGGC	2	8	5468	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	557683043
16	NC_022785	GGGC	2	8	5569	5576	0 %	0 %	75 %	25 %	557683043
17	NC_022785	GTGG	2	8	5716	5723	0 %	25 %	75 %	0 %	557683043
18	NC_022785	GCGG	2	8	5794	5801	0 %	0 %	75 %	25 %	557683043
19	NC_022785	GGAG	2	8	5814	5821	25 %	0 %	75 %	0 %	557683043
20	NC_022785	GCGG	2	8	6180	6187	0 %	0 %	75 %	25 %	557683043
21	NC_022785	GGTG	2	8	6204	6211	0 %	25 %	75 %	0 %	557683043
22	NC_022785	GCAG	2	8	7147	7154	25 %	0 %	50 %	25 %	557683044
23	NC_022785	GCGG	2	8	7241	7248	0 %	0 %	75 %	25 %	557683044
24	NC_022785	CCGG	2	8	7361	7368	0 %	0 %	50 %	50 %	557683045
25	NC_022785	GCGG	2	8	7660	7667	0 %	0 %	75 %	25 %	557683045
26	NC_022785	CGGC	2	8	7923	7930	0 %	0 %	50 %	50 %	557683045
27	NC_022785	AGGC	2	8	8199	8206	25 %	0 %	50 %	25 %	557683045
28	NC_022785	CGGC	2	8	8443	8450	0 %	0 %	50 %	50 %	557683045
29	NC_022785	GGTC	2	8	8493	8500	0 %	25 %	50 %	25 %	557683045
30	NC_022785	GCCA	2	8	8819	8826	25 %	0 %	25 %	50 %	557683045
31	NC_022785	CCAC	2	8	9188	9195	25 %	0 %	0 %	75 %	557683046
32	NC_022785	GCCC	2	8	9342	9349	0 %	0 %	25 %	75 %	557683046
33	NC_022785	CAGC	2	8	9986	9993	25 %	0 %	25 %	50 %	557683046
34	NC_022785	TCCC	2	8	10016	10023	0 %	25 %	0 %	75 %	557683046
35	NC_022785	CCAG	2	8	10112	10119	25 %	0 %	25 %	50 %	557683046
36	NC_022785	CGCA	2	8	10161	10168	25 %	0 %	25 %	50 %	557683046
37	NC_022785	ACCC	3	12	10403	10414	25 %	0 %	0 %	75 %	557683048
38	NC_022785	CAGC	2	8	10545	10552	25 %	0 %	25 %	50 %	557683048
39	NC_022785	AGGT	2	8	11432	11439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022785	GTCG	2	8	11509	11516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022785	GGAG	2	8	11701	11708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022785	CGCC	2	8	12277	12284	0 %	0 %	25 %	75 %	557683049
43	NC_022785	TCCA	2	8	12728	12735	25 %	25 %	0 %	50 %	557683050
44	NC_022785	GCCG	2	8	13256	13263	0 %	0 %	50 %	50 %	557683050
45	NC_022785	CCGC	2	8	13497	13504	0 %	0 %	25 %	75 %	557683050
46	NC_022785	GCCC	2	8	13546	13553	0 %	0 %	25 %	75 %	557683050
47	NC_022785	CGCC	2	8	14662	14669	0 %	0 %	25 %	75 %	557683050
48	NC_022785	CAGC	2	8	14904	14911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022785	CGCA	2	8	15040	15047	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022785	GGGC	2	8	15608	15615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022785	TCCA	2	8	15632	15639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022785	GCCG	2	8	15805	15812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022785	TGCG	2	8	15972	15979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022785	ACGG	2	8	16200	16207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022785	CGGT	2	8	16521	16528	0 %	25 %	50 %	25 %	557683052
56	NC_022785	GGCG	2	8	16658	16665	0 %	0 %	75 %	25 %	557683052
57	NC_022785	GCTG	2	8	16746	16753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022785	CGTC	2	8	16806	16813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022785	GCCA	2	8	17037	17044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022785	TCCA	2	8	17300	17307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022785	GCCC	2	8	17429	17436	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_022785	CGGC	2	8	17568	17575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022785	CGAT	2	8	17633	17640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022785	TACG	2	8	17731	17738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022785	CGGC	2	8	17915	17922	0 %	0 %	50 %	50 %	557683053
66	NC_022785	GCCA	2	8	17931	17938	25 %	0 %	25 %	50 %	557683053
67	NC_022785	GCTC	2	8	18050	18057	0 %	25 %	25 %	50 %	557683053
68	NC_022785	GCTG	2	8	20105	20112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022785	CGCC	2	8	20228	20235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_022785	CAGC	2	8	20290	20297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022785	GGCT	2	8	20602	20609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022785	GGCG	2	8	20953	20960	0 %	0 %	75 %	25 %	557683056
73	NC_022785	GCCA	2	8	20991	20998	25 %	0 %	25 %	50 %	557683056
74	NC_022785	GGCG	2	8	21082	21089	0 %	0 %	75 %	25 %	557683056
75	NC_022785	GGCC	2	8	21384	21391	0 %	0 %	50 %	50 %	557683057
76	NC_022785	CCGT	2	8	21827	21834	0 %	25 %	25 %	50 %	557683057
77	NC_022785	GGGC	2	8	21968	21975	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022785	GCGG	2	8	22054	22061	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022785	CCCG	2	8	22214	22221	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_022785	GCCG	2	8	22415	22422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022785	CGGC	2	8	22483	22490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022785	GGCA	2	8	22964	22971	25 %	0 %	50 %	25 %	557683058
83	NC_022785	GCAC	2	8	23022	23029	25 %	0 %	25 %	50 %	557683058
84	NC_022785	CCGG	2	8	23520	23527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022785	CAGC	2	8	23606	23613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022785	GGCA	2	8	23627	23634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022785	GGCA	2	8	23754	23761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022785	GGCG	2	8	23790	23797	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022785	CGGC	2	8	23822	23829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022785	CGTG	2	8	24192	24199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022785	GTCC	2	8	24369	24376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022785	GCTG	2	8	24923	24930	0 %	25 %	50 %	25 %	557683059
93	NC_022785	GCAG	2	8	25137	25144	25 %	0 %	50 %	25 %	557683059
94	NC_022785	TCCT	2	8	25455	25462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022785	GCTC	2	8	25619	25626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022785	CGGG	2	8	26783	26790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022785	TGGC	2	8	26977	26984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022785	GGAA	2	8	27049	27056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022785	CAGC	2	8	27276	27283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022785	CGCC	2	8	27407	27414	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_022785	CCGC	2	8	27921	27928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_022785	CCAG	2	8	28385	28392	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022785	TGCC	2	8	28407	28414	0 %	25 %	25 %	50 %	557683062
104	NC_022785	ACGG	2	8	28515	28522	25 %	0 %	50 %	25 %	557683062
105	NC_022785	CCGG	2	8	28689	28696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022785	CGGC	2	8	28829	28836	0 %	0 %	50 %	50 %	557683063
107	NC_022785	GCTG	2	8	28890	28897	0 %	25 %	50 %	25 %	557683063
108	NC_022785	GCCC	2	8	30351	30358	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_022785	TGGG	2	8	30445	30452	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022785	CAGG	2	8	30510	30517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022785	CACC	2	8	31126	31133	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_022785	CCGG	2	8	31198	31205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022785	GCCC	2	8	32684	32691	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_022785	CGGG	2	8	33058	33065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022785	GACC	2	8	33151	33158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022785	TGGC	2	8	33671	33678	0 %	25 %	50 %	25 %	557683064
117	NC_022785	CAGG	2	8	33892	33899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022785	GAGG	2	8	37390	37397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022785	GGCT	2	8	38926	38933	0 %	25 %	50 %	25 %	557683068
120	NC_022785	CGAG	2	8	39452	39459	25 %	0 %	50 %	25 %	557683069
121	NC_022785	CCGG	2	8	39465	39472	0 %	0 %	50 %	50 %	557683069
122	NC_022785	GCCT	2	8	39841	39848	0 %	25 %	25 %	50 %	557683069
123	NC_022785	CGCC	2	8	40587	40594	0 %	0 %	25 %	75 %	557683070
124	NC_022785	CCAG	2	8	41102	41109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022785	CAGG	2	8	41477	41484	25 %	0 %	50 %	25 %	557683071
126	NC_022785	TCGA	2	8	41565	41572	25 %	25 %	25 %	25 %	557683071
127	NC_022785	GATG	2	8	41595	41602	25 %	25 %	50 %	0 %	557683071
128	NC_022785	CCGG	2	8	41743	41750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022785	GGCG	2	8	42045	42052	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022785	GTGC	2	8	42083	42090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022785	GTCC	2	8	42524	42531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022785	GACG	2	8	42860	42867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022785	CGGC	2	8	42881	42888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022785	GGCC	2	8	42968	42975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022785	GGTC	2	8	43163	43170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022785	CCAT	2	8	43963	43970	25 %	25 %	0 %	50 %	557683072
137	NC_022785	GGAT	2	8	44069	44076	25 %	25 %	50 %	0 %	557683072
138	NC_022785	CCAC	2	8	44768	44775	25 %	0 %	0 %	75 %	557683073
139	NC_022785	GATC	2	8	44981	44988	25 %	25 %	25 %	25 %	557683073
140	NC_022785	CCGC	2	8	45109	45116	0 %	0 %	25 %	75 %	557683073
141	NC_022785	GCCG	2	8	45132	45139	0 %	0 %	50 %	50 %	557683073
142	NC_022785	GCAC	2	8	45394	45401	25 %	0 %	25 %	50 %	557683074
143	NC_022785	GACC	2	8	46335	46342	25 %	0 %	25 %	50 %	557683075
144	NC_022785	CGCC	2	8	47815	47822	0 %	0 %	25 %	75 %	557683076
145	NC_022785	GCGG	2	8	48492	48499	0 %	0 %	75 %	25 %	557683076
146	NC_022785	GTCC	2	8	48626	48633	0 %	25 %	25 %	50 %	557683076
147	NC_022785	CGTC	2	8	48751	48758	0 %	25 %	25 %	50 %	557683076
148	NC_022785	TCCG	2	8	48762	48769	0 %	25 %	25 %	50 %	557683076
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