Hexa-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 247

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_022784TTGCAA2121454146533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %557625307
2NC_022784TGTTGC212382038310 %50 %33.33 %16.67 %557625310
3NC_022784TATGGG2123955396616.67 %33.33 %50 %0 %557625310
4NC_022784TACATC2127278728933.33 %33.33 %0 %33.33 %557625314
5NC_022784GTGGCC212943994500 %16.67 %50 %33.33 %557625315
6NC_022784ACCGGA212158261583733.33 %0 %33.33 %33.33 %557625320
7NC_022784GCCGCG21218067180780 %0 %50 %50 %557625321
8NC_022784GAAGTA212244672447850 %16.67 %33.33 %0 %Non-Coding
9NC_022784AGAAGC212316773168850 %0 %33.33 %16.67 %557625332
10NC_022784CTACTT212363983640916.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
11NC_022784AAACCC212380463805750 %0 %0 %50 %557625333
12NC_022784TTTCCT21247792478030 %66.67 %0 %33.33 %Non-Coding
13NC_022784CTACTT212479764798716.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
14NC_022784AAAGAC212697276973866.67 %0 %16.67 %16.67 %557625351
15NC_022784TTTGTG21285665856760 %66.67 %33.33 %0 %557625361
16NC_022784TGGGTG21288448884590 %33.33 %66.67 %0 %557625364
17NC_022784ACAAAC21210536210537366.67 %0 %0 %33.33 %Non-Coding
18NC_022784CCTGGA21210571910573016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %557625370
19NC_022784GGTTAA21210675910677033.33 %33.33 %33.33 %0 %Non-Coding
20NC_022784TACCCA21212629312630433.33 %16.67 %0 %50 %557625383
21NC_022784TTGCCC2121345701345810 %33.33 %16.67 %50 %557625391
22NC_022784GTGCTG2121351151351260 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
23NC_022784CTGTTG2121368311368420 %50 %33.33 %16.67 %557625392
24NC_022784TGGGCA21213698113699216.67 %16.67 %50 %16.67 %557625392
25NC_022784TTCATG21213724413725516.67 %50 %16.67 %16.67 %557625392
26NC_022784GTTGCA21213960313961416.67 %33.33 %33.33 %16.67 %557625396
27NC_022784AACTGC21215829815830933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
28NC_022784CGCCTG2121590881590990 %16.67 %33.33 %50 %Non-Coding
29NC_022784TGCACA21216372916374033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %557625414
30NC_022784CAAGCT21216756416757533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %557625416
31NC_022784GATCAA21217074917076050 %16.67 %16.67 %16.67 %557625419
32NC_022784AGATAT21217451217452350 %33.33 %16.67 %0 %557625423
33NC_022784CTACTT21217756617757716.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
34NC_022784AGGTCA21217792117793233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %557625425
35NC_022784TATAAT21219057319058450 %50 %0 %0 %Non-Coding
36NC_022784CTTCCT2121913031913140 %50 %0 %50 %557625433
37NC_022784AATTTC21219412519413633.33 %50 %0 %16.67 %Non-Coding
38NC_022784GGAGCG21220983720984816.67 %0 %66.67 %16.67 %557625447
39NC_022784GGCCGT2122099752099860 %16.67 %50 %33.33 %557625447
40NC_022784AGGGGC21222684422685516.67 %0 %66.67 %16.67 %557625458
41NC_022784AACACT21223807323808450 %16.67 %0 %33.33 %557625469
42NC_022784GGAAGT21224186624187733.33 %16.67 %50 %0 %557625472
43NC_022784ATGCGC21224717124718216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %557625474
44NC_022784ACAAAA21225063925065083.33 %0 %0 %16.67 %Non-Coding
45NC_022784GGTGCT2122509022509130 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
46NC_022784TCCCAA21225415925417033.33 %16.67 %0 %50 %557625479
47NC_022784CACAAG21225897625898750 %0 %16.67 %33.33 %557625484
48NC_022784GCCAAG21226129426130533.33 %0 %33.33 %33.33 %557625485
49NC_022784GAGGTT21226359626360716.67 %33.33 %50 %0 %557625488
50NC_022784ACACCG21226508826509933.33 %0 %16.67 %50 %557625488
51NC_022784CTCAGC21227732027733116.67 %16.67 %16.67 %50 %557625497
52NC_022784TGGTAT21227890127891216.67 %50 %33.33 %0 %557625498
53NC_022784TTGTTT2122839862839970 %83.33 %16.67 %0 %557625502
54NC_022784TGGGCT2122846232846340 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
55NC_022784GTCCCT2122880442880550 %33.33 %16.67 %50 %557625505
56NC_022784TGCAAT21229555629556733.33 %33.33 %16.67 %16.67 %Non-Coding
57NC_022784CATATA21230164230165350 %33.33 %0 %16.67 %557625513
58NC_022784TGTCGG2123078513078620 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
59NC_022784ACCACT21230973630974733.33 %16.67 %0 %50 %Non-Coding
60NC_022784TATCCC21231243131244216.67 %33.33 %0 %50 %Non-Coding
61NC_022784ACATCT21232230532231633.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
62NC_022784GGGTTT2123236893237000 %50 %50 %0 %Non-Coding
63NC_022784AGGTGC21233275633276716.67 %16.67 %50 %16.67 %557625520
64NC_022784AGACAG21233344133345250 %0 %33.33 %16.67 %557625521
65NC_022784ATGCCC21233524633525716.67 %16.67 %16.67 %50 %557625521
66NC_022784GAGGCG21234078134079216.67 %0 %66.67 %16.67 %557625525
67NC_022784GTCAAT21234284434285533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %Non-Coding
68NC_022784CCTTGC2123438783438890 %33.33 %16.67 %50 %Non-Coding
69NC_022784CATTGC21234488434489516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %Non-Coding
70NC_022784AACAAT21234508634509766.67 %16.67 %0 %16.67 %Non-Coding
71NC_022784GCTGTT2123457373457480 %50 %33.33 %16.67 %Non-Coding
72NC_022784TAGTGA21235510635511733.33 %33.33 %33.33 %0 %557625533
73NC_022784TGAAAG21237107737108850 %16.67 %33.33 %0 %557625540
74NC_022784GATGCT21238949938951016.67 %33.33 %33.33 %16.67 %557625551
75NC_022784AACTTC21239133539134633.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
76NC_022784ATCGCC21239172539173616.67 %16.67 %16.67 %50 %557625553
77NC_022784TATGGG21239651439652516.67 %33.33 %50 %0 %557625558
78NC_022784ACTTAT21240062440063533.33 %50 %0 %16.67 %557625561
79NC_022784TATAAT21240475240476350 %50 %0 %0 %557625564
80NC_022784GTGCAG21240774440775516.67 %16.67 %50 %16.67 %557625568
81NC_022784CTCATT21241755141756216.67 %50 %0 %33.33 %557625576
82NC_022784CGCTCA21242750642751716.67 %16.67 %16.67 %50 %557625578
83NC_022784GAGTAA21243335143336250 %16.67 %33.33 %0 %557625583
84NC_022784GCTATC21243827343828416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %557625585
85NC_022784ACGAAA21243833943835066.67 %0 %16.67 %16.67 %557625585
86NC_022784CTTCAT21244632344633416.67 %50 %0 %33.33 %557625591
87NC_022784ACCATA21244817644818750 %16.67 %0 %33.33 %557625592
88NC_022784GAAATT21244842344843450 %33.33 %16.67 %0 %557625593
89NC_022784GTCTTC2124508644508750 %50 %16.67 %33.33 %557625596
90NC_022784AATCGG21245791045792133.33 %16.67 %33.33 %16.67 %557625598
91NC_022784TAGGGG21246318246319316.67 %16.67 %66.67 %0 %557625602
92NC_022784TGCGAA21247185747186833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %557625608
93NC_022784TGCAAC21247471847472933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
94NC_022784TGCTGG2124867484867590 %33.33 %50 %16.67 %557625617
95NC_022784GAGTTG21248685048686116.67 %33.33 %50 %0 %557625617
96NC_022784TGCACT21248704548705616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %557625617
97NC_022784GTGTTG2124898964899070 %50 %50 %0 %557625620
98NC_022784GCACCG21249099149100216.67 %0 %33.33 %50 %557625621
99NC_022784GCGATA21249644249645333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %Non-Coding
100NC_022784TAAAAG21250378450379566.67 %16.67 %16.67 %0 %557625623
101NC_022784AGGGGA21250437650438733.33 %0 %66.67 %0 %Non-Coding
102NC_022784TAAAAG21250618250619366.67 %16.67 %16.67 %0 %557625624
103NC_022784TTGCTG2125083645083750 %50 %33.33 %16.67 %Non-Coding
104NC_022784GTTTCC2125210645210750 %50 %16.67 %33.33 %557625634
105NC_022784CACATC21252388152389233.33 %16.67 %0 %50 %Non-Coding
106NC_022784AGGGAT21252565152566233.33 %16.67 %50 %0 %557625639
107NC_022784ACCACA21252859452860550 %0 %0 %50 %557625643
108NC_022784TTTTCC2125292545292650 %66.67 %0 %33.33 %557625643
109NC_022784CGCACA21253770953772033.33 %0 %16.67 %50 %Non-Coding
110NC_022784TTTACT21253910653911716.67 %66.67 %0 %16.67 %557625653
111NC_022784TGCCCA21254298454299516.67 %16.67 %16.67 %50 %557625657
112NC_022784TAACTA21254929554930650 %33.33 %0 %16.67 %Non-Coding
113NC_022784GGCCAT21255487855488916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %557625666
114NC_022784ATTGCA21256109256110333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %557625670
115NC_022784TCCTTA21256277956279016.67 %50 %0 %33.33 %557625672
116NC_022784AGGCGC21256375356376416.67 %0 %50 %33.33 %557625673
117NC_022784TTGATG21256465156466216.67 %50 %33.33 %0 %557625674
118NC_022784TCACCA21257087957089033.33 %16.67 %0 %50 %557625680
119NC_022784GCAGCC21257421557422616.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
120NC_022784GGCATA21257834857835933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %Non-Coding
121NC_022784TGCCTA21258725758726816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %557625686
122NC_022784ATGTAT21259276259277333.33 %50 %16.67 %0 %557625691
123NC_022784GCACCA21259707059708133.33 %0 %16.67 %50 %557625695
124NC_022784GTATGG21260709860710916.67 %33.33 %50 %0 %557625704
125NC_022784CAAAAT21261938461939566.67 %16.67 %0 %16.67 %557625707
126NC_022784GCCCAG21261963161964216.67 %0 %33.33 %50 %557625707
127NC_022784TCCCGG2126265686265790 %16.67 %33.33 %50 %Non-Coding
128NC_022784CGATTG21263478663479716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %557625714
129NC_022784TGCACA21264376364377433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
130NC_022784CGGTTC2126440216440320 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
131NC_022784CAGCTG21264404164405216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %Non-Coding
132NC_022784TGCCGC2126506976507080 %16.67 %33.33 %50 %Non-Coding
133NC_022784GGAGGC21265162465163516.67 %0 %66.67 %16.67 %Non-Coding
134NC_022784ACCCAG21265626765627833.33 %0 %16.67 %50 %Non-Coding
135NC_022784CGCAGG21265905265906316.67 %0 %50 %33.33 %557625721
136NC_022784CTACTT21266309666310716.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
137NC_022784CGGTCA21266746966748016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %557625725
138NC_022784CGGCAG21267283867284916.67 %0 %50 %33.33 %557625728
139NC_022784TCCTCA21268204568205616.67 %33.33 %0 %50 %557625734
140NC_022784CGGAAA21268418168419250 %0 %33.33 %16.67 %557625736
141NC_022784GCTGTG2126859796859900 %33.33 %50 %16.67 %557625737
142NC_022784ATTCAC21268860068861133.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
143NC_022784CTCGCC2126915756915860 %16.67 %16.67 %66.67 %557625742
144NC_022784GCCATA21271144771145833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %557625757
145NC_022784ACCCAA21271312071313150 %0 %0 %50 %Non-Coding
146NC_022784GCCCTC2127140007140110 %16.67 %16.67 %66.67 %Non-Coding
147NC_022784TGCAGC21271507471508516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %Non-Coding
148NC_022784TCTTGC2127224837224940 %50 %16.67 %33.33 %557625765
149NC_022784GTGCTG2127299307299410 %33.33 %50 %16.67 %557626144
150NC_022784GCTACC21273316573317616.67 %16.67 %16.67 %50 %557625773
151NC_022784ATGTAC21274277074278133.33 %33.33 %16.67 %16.67 %Non-Coding
152NC_022784TCCTTG2127438357438460 %50 %16.67 %33.33 %Non-Coding
153NC_022784GGCCAC21274462274463316.67 %0 %33.33 %50 %557625775
154NC_022784GCCCAC21276107276108316.67 %0 %16.67 %66.67 %Non-Coding
155NC_022784TCGCGC2127666697666800 %16.67 %33.33 %50 %Non-Coding
156NC_022784CAGGTA21276902776903833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %557625785
157NC_022784ATCAGC21277798677799733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %557625792
158NC_022784ACCCCT21278148678149716.67 %16.67 %0 %66.67 %557625794
159NC_022784TCGGCC2127831507831610 %16.67 %33.33 %50 %557625795
160NC_022784AGAATC21278895978897050 %16.67 %16.67 %16.67 %Non-Coding
161NC_022784TAGTGG21279039679040716.67 %33.33 %50 %0 %Non-Coding
162NC_022784AGGGCA21279042679043733.33 %0 %50 %16.67 %Non-Coding
163NC_022784GCCTGT2127906757906860 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
164NC_022784TAAACA21279285179286266.67 %16.67 %0 %16.67 %Non-Coding
165NC_022784TATGGA21279374379375433.33 %33.33 %33.33 %0 %557625802
166NC_022784GCTTGT2127942527942630 %50 %33.33 %16.67 %557625802
167NC_022784CCAACC21279519679520733.33 %0 %0 %66.67 %557625802
168NC_022784TTCATC21279889279890316.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
169NC_022784AGAGCT21279951079952133.33 %16.67 %33.33 %16.67 %557625806
170NC_022784AGTTGC21280242080243116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %557625807
171NC_022784CGGGAG21280862580863616.67 %0 %66.67 %16.67 %557625814
172NC_022784TAGGGC21281390181391216.67 %16.67 %50 %16.67 %Non-Coding
173NC_022784CTTACC21282407482408516.67 %33.33 %0 %50 %557625824
174NC_022784TACCCT21282514182515216.67 %33.33 %0 %50 %557625826
175NC_022784TCCTAA21282618382619433.33 %33.33 %0 %33.33 %557625828
176NC_022784GGCAGA21283904783905833.33 %0 %50 %16.67 %557625850
177NC_022784AAAAAG21285003485004583.33 %0 %16.67 %0 %557625859
178NC_022784TTGAAG21285212785213833.33 %33.33 %33.33 %0 %Non-Coding
179NC_022784CAGGAC21285235985237033.33 %0 %33.33 %33.33 %Non-Coding
180NC_022784TTTGGT2128626078626180 %66.67 %33.33 %0 %557625865
181NC_022784TCAAGA21287290587291650 %16.67 %16.67 %16.67 %557625873
182NC_022784TCAGAA21288577188578250 %16.67 %16.67 %16.67 %557625881
183NC_022784TTTTCT2128933308933410 %83.33 %0 %16.67 %Non-Coding
184NC_022784TGAAAA21289438189439266.67 %16.67 %16.67 %0 %557625884
185NC_022784CAACGC21289587989589033.33 %0 %16.67 %50 %557625886
186NC_022784TGGAGC21289943489944516.67 %16.67 %50 %16.67 %Non-Coding
187NC_022784GAAGTA21290183890184950 %16.67 %33.33 %0 %557625890
188NC_022784TGGGCG2129020519020620 %16.67 %66.67 %16.67 %Non-Coding
189NC_022784CCTGTA21290207490208516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %Non-Coding
190NC_022784AAACCC21290324090325150 %0 %0 %50 %557625891
191NC_022784GTGGCG2129148949149050 %16.67 %66.67 %16.67 %557625902
192NC_022784GCGACA21291879491880533.33 %0 %33.33 %33.33 %557625905
193NC_022784ATCCAC21292921092922133.33 %16.67 %0 %50 %557625916
194NC_022784GGGCTT2129323449323550 %33.33 %50 %16.67 %557625919
195NC_022784TGCACA21293821293822333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
196NC_022784TTTGAG21294285694286716.67 %50 %33.33 %0 %557625925
197NC_022784GCTCAC21294440194441216.67 %16.67 %16.67 %50 %557625925
198NC_022784ATTACT21294684894685933.33 %50 %0 %16.67 %Non-Coding
199NC_022784CAACCT21294700694701733.33 %16.67 %0 %50 %Non-Coding
200NC_022784TGTCAT21295449495450516.67 %50 %16.67 %16.67 %Non-Coding
201NC_022784ACACTT21295648695649733.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
202NC_022784CTCTTA21296132596133616.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
203NC_022784GCAGCC21296303996305016.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
204NC_022784AGCGGC21297012497013516.67 %0 %50 %33.33 %557625933
205NC_022784CGTGTA21297334697335716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %Non-Coding
206NC_022784GCAAAC21297524697525750 %0 %16.67 %33.33 %Non-Coding
207NC_022784CTGCAG21297573297574316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %Non-Coding
208NC_022784TCCATC21297788197789216.67 %33.33 %0 %50 %557625940
209NC_022784GGGCTG2129954819954920 %16.67 %66.67 %16.67 %557625957
210NC_022784AAACCA21299867799868866.67 %0 %0 %33.33 %557625958
211NC_022784CAACCA2121017298101730950 %0 %0 %50 %Non-Coding
212NC_022784CATACA2121020681102069250 %16.67 %0 %33.33 %557625975
213NC_022784ATGGAG2121021089102110033.33 %16.67 %50 %0 %Non-Coding
214NC_022784GGGAGA2121030840103085133.33 %0 %66.67 %0 %557625983
215NC_022784GAAGTA2121031750103176150 %16.67 %33.33 %0 %Non-Coding
216NC_022784CTACTT2121037893103790416.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
217NC_022784CAAAGC2121046214104622550 %0 %16.67 %33.33 %557625994
218NC_022784CCCGGA2121062693106270416.67 %0 %33.33 %50 %557626006
219NC_022784GAGATT2121063667106367833.33 %33.33 %33.33 %0 %557626006
220NC_022784GTTCTA2121072340107235116.67 %50 %16.67 %16.67 %557626012
221NC_022784CGTGCC212107968410796950 %16.67 %33.33 %50 %557626017
222NC_022784CACAAG2121081853108186450 %0 %16.67 %33.33 %557626019
223NC_022784CAGTAG2121083254108326533.33 %16.67 %33.33 %16.67 %Non-Coding
224NC_022784CTACAA2121084998108500950 %16.67 %0 %33.33 %Non-Coding
225NC_022784CAGAAA2121088397108840866.67 %0 %16.67 %16.67 %557626023
226NC_022784CAGAAA2121093423109343466.67 %0 %16.67 %16.67 %557626026
227NC_022784GATATA2121095220109523150 %33.33 %16.67 %0 %Non-Coding
228NC_022784CAAGAA2121102678110268966.67 %0 %16.67 %16.67 %Non-Coding
229NC_022784TGAGAA2121103349110336050 %16.67 %33.33 %0 %557626035
230NC_022784CTACTT2121113578111358916.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
231NC_022784CCAGCT2121116598111660916.67 %16.67 %16.67 %50 %Non-Coding
232NC_022784CCAGCA2121118701111871233.33 %0 %16.67 %50 %557626047
233NC_022784TAAGGT2121127961112797233.33 %33.33 %33.33 %0 %557626058
234NC_022784CCCGTC212113199611320070 %16.67 %16.67 %66.67 %Non-Coding
235NC_022784GTGCTG212113519511352060 %33.33 %50 %16.67 %557626062
236NC_022784ACTCCC2121136616113662716.67 %16.67 %0 %66.67 %557626064
237NC_022784GAGGAA2121142513114252450 %0 %50 %0 %557626069
238NC_022784TATAAA2121145846114585766.67 %33.33 %0 %0 %557626072
239NC_022784TTTCTA2121146088114609916.67 %66.67 %0 %16.67 %557626072
240NC_022784ACCTTA2121155045115505633.33 %33.33 %0 %33.33 %557626081
241NC_022784ACCGAA2121161652116166350 %0 %16.67 %33.33 %557626084
242NC_022784TACTTT2121175738117574916.67 %66.67 %0 %16.67 %557626096
243NC_022784GCACCA2121180549118056033.33 %0 %16.67 %50 %Non-Coding
244NC_022784ACCACA2121187272118728350 %0 %0 %50 %557626102
245NC_022784ACTGCA2121189063118907433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %557626105
246NC_022784ACTGGC2121194500119451116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %557626107
247NC_022784CCTCGC212119621011962210 %16.67 %16.67 %66.67 %557626108