MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022784	GAAGTA	2	12	24467	24478	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022784	CTACTT	2	12	36398	36409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022784	TTTCCT	2	12	47792	47803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022784	CTACTT	2	12	47976	47987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022784	ACAAAC	2	12	105362	105373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022784	GGTTAA	2	12	106759	106770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022784	GTGCTG	2	12	135115	135126	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022784	AACTGC	2	12	158298	158309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022784	CGCCTG	2	12	159088	159099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022784	CTACTT	2	12	177566	177577	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022784	TATAAT	2	12	190573	190584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022784	AATTTC	2	12	194125	194136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022784	ACAAAA	2	12	250639	250650	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022784	GGTGCT	2	12	250902	250913	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022784	TGGGCT	2	12	284623	284634	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022784	TGCAAT	2	12	295556	295567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022784	TGTCGG	2	12	307851	307862	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022784	ACCACT	2	12	309736	309747	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022784	TATCCC	2	12	312431	312442	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022784	ACATCT	2	12	322305	322316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022784	GGGTTT	2	12	323689	323700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022784	GTCAAT	2	12	342844	342855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022784	CCTTGC	2	12	343878	343889	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022784	CATTGC	2	12	344884	344895	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022784	AACAAT	2	12	345086	345097	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022784	GCTGTT	2	12	345737	345748	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022784	AACTTC	2	12	391335	391346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022784	TGCAAC	2	12	474718	474729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022784	GCGATA	2	12	496442	496453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022784	AGGGGA	2	12	504376	504387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022784	TTGCTG	2	12	508364	508375	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022784	CACATC	2	12	523881	523892	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022784	CGCACA	2	12	537709	537720	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022784	TAACTA	2	12	549295	549306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022784	GCAGCC	2	12	574215	574226	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022784	GGCATA	2	12	578348	578359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022784	TCCCGG	2	12	626568	626579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022784	TGCACA	2	12	643763	643774	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022784	CGGTTC	2	12	644021	644032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022784	CAGCTG	2	12	644041	644052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022784	TGCCGC	2	12	650697	650708	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022784	GGAGGC	2	12	651624	651635	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022784	ACCCAG	2	12	656267	656278	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022784	CTACTT	2	12	663096	663107	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022784	ATTCAC	2	12	688600	688611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022784	ACCCAA	2	12	713120	713131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022784	GCCCTC	2	12	714000	714011	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_022784	TGCAGC	2	12	715074	715085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022784	ATGTAC	2	12	742770	742781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022784	TCCTTG	2	12	743835	743846	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022784	GCCCAC	2	12	761072	761083	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_022784	TCGCGC	2	12	766669	766680	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022784	AGAATC	2	12	788959	788970	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022784	TAGTGG	2	12	790396	790407	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022784	AGGGCA	2	12	790426	790437	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022784	GCCTGT	2	12	790675	790686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022784	TAAACA	2	12	792851	792862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022784	TTCATC	2	12	798892	798903	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022784	TAGGGC	2	12	813901	813912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022784	TTGAAG	2	12	852127	852138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022784	CAGGAC	2	12	852359	852370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022784	TTTTCT	2	12	893330	893341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022784	TGGAGC	2	12	899434	899445	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022784	TGGGCG	2	12	902051	902062	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022784	CCTGTA	2	12	902074	902085	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022784	TGCACA	2	12	938212	938223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022784	ATTACT	2	12	946848	946859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022784	CAACCT	2	12	947006	947017	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022784	TGTCAT	2	12	954494	954505	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022784	ACACTT	2	12	956486	956497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022784	CTCTTA	2	12	961325	961336	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022784	GCAGCC	2	12	963039	963050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022784	CGTGTA	2	12	973346	973357	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022784	GCAAAC	2	12	975246	975257	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022784	CTGCAG	2	12	975732	975743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022784	CAACCA	2	12	1017298	1017309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022784	ATGGAG	2	12	1021089	1021100	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022784	GAAGTA	2	12	1031750	1031761	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022784	CTACTT	2	12	1037893	1037904	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022784	CAGTAG	2	12	1083254	1083265	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022784	CTACAA	2	12	1084998	1085009	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022784	GATATA	2	12	1095220	1095231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022784	CAAGAA	2	12	1102678	1102689	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022784	CTACTT	2	12	1113578	1113589	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022784	CCAGCT	2	12	1116598	1116609	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022784	CCCGTC	2	12	1131996	1132007	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_022784	GCACCA	2	12	1180549	1180560	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.