MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022784	AGATA	2	10	905731	905740	60 %	20 %	20 %	0 %	557625894
502	NC_022784	TATAT	2	10	907971	907980	40 %	60 %	0 %	0 %	557625896
503	NC_022784	CTTCC	2	10	908087	908096	0 %	40 %	0 %	60 %	557625896
504	NC_022784	TTGCA	2	10	909172	909181	20 %	40 %	20 %	20 %	557625897
505	NC_022784	ACGTA	2	10	909502	909511	40 %	20 %	20 %	20 %	557625897
506	NC_022784	TGCGG	2	10	909580	909589	0 %	20 %	60 %	20 %	557625897
507	NC_022784	TGCGG	2	10	917255	917264	0 %	20 %	60 %	20 %	557625905
508	NC_022784	TAGCG	2	10	918734	918743	20 %	20 %	40 %	20 %	557625905
509	NC_022784	CCCAA	2	10	920391	920400	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
510	NC_022784	GGACC	2	10	925978	925987	20 %	0 %	40 %	40 %	557625912
511	NC_022784	CAAGG	2	10	927744	927753	40 %	0 %	40 %	20 %	557625914
512	NC_022784	CTGCA	2	10	934894	934903	20 %	20 %	20 %	40 %	557625921
513	NC_022784	ATTGC	2	10	937110	937119	20 %	40 %	20 %	20 %	557625922
514	NC_022784	CACTC	2	10	938327	938336	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
515	NC_022784	TGCAG	2	10	939834	939843	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
516	NC_022784	AACTT	2	10	940958	940967	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_022784	AACTT	2	10	941405	941414	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
518	NC_022784	TCTAT	2	10	941889	941898	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
519	NC_022784	TTTCG	2	10	948429	948438	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_022784	TGTTC	2	10	948767	948776	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_022784	CGCAG	2	10	951057	951066	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
522	NC_022784	AGGCA	2	10	951721	951730	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
523	NC_022784	CTTTG	2	10	954669	954678	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
524	NC_022784	CGTTG	2	10	955658	955667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
525	NC_022784	TGCCT	2	10	957402	957411	0 %	40 %	20 %	40 %	557625926
526	NC_022784	AATGC	2	10	958649	958658	40 %	20 %	20 %	20 %	557625926
527	NC_022784	CTCTT	2	10	958883	958892	0 %	60 %	0 %	40 %	557625926
528	NC_022784	ATTAC	2	10	961105	961114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
529	NC_022784	AGCAA	2	10	964454	964463	60 %	0 %	20 %	20 %	557625930
530	NC_022784	GGCTG	2	10	966316	966325	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
531	NC_022784	GTAGC	2	10	968275	968284	20 %	20 %	40 %	20 %	557625932
532	NC_022784	AGATC	2	10	968506	968515	40 %	20 %	20 %	20 %	557625932
533	NC_022784	CAGGG	2	10	971329	971338	20 %	0 %	60 %	20 %	557625935
534	NC_022784	TATAA	2	10	971728	971737	60 %	40 %	0 %	0 %	557625935
535	NC_022784	GCCGC	2	10	973321	973330	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
536	NC_022784	CACAA	2	10	973443	973452	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
537	NC_022784	CAGCG	2	10	973626	973635	20 %	0 %	40 %	40 %	557625938
538	NC_022784	AGCGA	2	10	974901	974910	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
539	NC_022784	AGTTG	2	10	975900	975909	20 %	40 %	40 %	0 %	557625939
540	NC_022784	TGCAT	2	10	976057	976066	20 %	40 %	20 %	20 %	557625939
541	NC_022784	GTAGC	2	10	980150	980159	20 %	20 %	40 %	20 %	557625943
542	NC_022784	TTGCA	2	10	981126	981135	20 %	40 %	20 %	20 %	557625944
543	NC_022784	GACAA	2	10	992341	992350	60 %	0 %	20 %	20 %	557625954
544	NC_022784	GAGCT	2	10	993037	993046	20 %	20 %	40 %	20 %	557625955
545	NC_022784	GCACT	2	10	995386	995395	20 %	20 %	20 %	40 %	557625957
546	NC_022784	ACCCT	2	10	995517	995526	20 %	20 %	0 %	60 %	557625957
547	NC_022784	GCACG	2	10	996038	996047	20 %	0 %	40 %	40 %	557625957
548	NC_022784	AAACA	2	10	996379	996388	80 %	0 %	0 %	20 %	557625957
549	NC_022784	GCATG	2	10	996631	996640	20 %	20 %	40 %	20 %	557625957
550	NC_022784	CAACG	2	10	996772	996781	40 %	0 %	20 %	40 %	557625958
551	NC_022784	TGGGC	2	10	997557	997566	0 %	20 %	60 %	20 %	557625958
552	NC_022784	AGCGC	2	10	997778	997787	20 %	0 %	40 %	40 %	557625958
553	NC_022784	GCAAG	2	10	999063	999072	40 %	0 %	40 %	20 %	557625959
554	NC_022784	ATCTG	2	10	1000448	1000457	20 %	40 %	20 %	20 %	557625961
555	NC_022784	ATGGT	2	10	1000689	1000698	20 %	40 %	40 %	0 %	557625961
556	NC_022784	GGTAG	2	10	1004653	1004662	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022784	ACCCC	2	10	1007642	1007651	20 %	0 %	0 %	80 %	557625967
558	NC_022784	CAACA	2	10	1007769	1007778	60 %	0 %	0 %	40 %	557625967
559	NC_022784	TAACA	2	10	1011169	1011178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
560	NC_022784	GGCGC	2	10	1013431	1013440	0 %	0 %	60 %	40 %	557625970
561	NC_022784	AGCGC	2	10	1014594	1014603	20 %	0 %	40 %	40 %	557625970
562	NC_022784	TCCTT	2	10	1014768	1014777	0 %	60 %	0 %	40 %	557625970
563	NC_022784	AGAAA	2	10	1015237	1015246	80 %	0 %	20 %	0 %	557625970
564	NC_022784	GGGCC	2	10	1018976	1018985	0 %	0 %	60 %	40 %	557625973
565	NC_022784	GTGCT	2	10	1019048	1019057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
566	NC_022784	TCCCC	2	10	1019131	1019140	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
567	NC_022784	CTGCT	2	10	1020882	1020891	0 %	40 %	20 %	40 %	557625975
568	NC_022784	GGAAG	2	10	1022362	1022371	40 %	0 %	60 %	0 %	557625976
569	NC_022784	TAGGA	2	10	1026625	1026634	40 %	20 %	40 %	0 %	557625979
570	NC_022784	GGCAT	2	10	1027571	1027580	20 %	20 %	40 %	20 %	557625980
571	NC_022784	ATTGC	2	10	1027755	1027764	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
572	NC_022784	GTACA	2	10	1028034	1028043	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
573	NC_022784	GGACT	2	10	1028853	1028862	20 %	20 %	40 %	20 %	557625981
574	NC_022784	GGACT	2	10	1031522	1031531	20 %	20 %	40 %	20 %	557625984
575	NC_022784	GGCTG	2	10	1032376	1032385	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
576	NC_022784	AGCAA	2	10	1035605	1035614	60 %	0 %	20 %	20 %	557625989
577	NC_022784	TGTGC	2	10	1040592	1040601	0 %	40 %	40 %	20 %	557625990
578	NC_022784	TAAAA	2	10	1040715	1040724	80 %	20 %	0 %	0 %	557625990
579	NC_022784	GCAGT	2	10	1047278	1047287	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
580	NC_022784	GCAAT	2	10	1048620	1048629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
581	NC_022784	GCAGA	2	10	1049344	1049353	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
582	NC_022784	GCCAA	2	10	1051169	1051178	40 %	0 %	20 %	40 %	557625996
583	NC_022784	GCCTT	2	10	1051328	1051337	0 %	40 %	20 %	40 %	557625996
584	NC_022784	TTGCC	2	10	1053045	1053054	0 %	40 %	20 %	40 %	557625998
585	NC_022784	ACTTA	2	10	1053826	1053835	40 %	40 %	0 %	20 %	557625999
586	NC_022784	CTTTG	2	10	1054438	1054447	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
587	NC_022784	ATTAA	2	10	1058212	1058221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022784	TACCA	2	10	1062266	1062275	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
589	NC_022784	TGTGA	2	10	1062835	1062844	20 %	40 %	40 %	0 %	557626006
590	NC_022784	CATGT	2	10	1065131	1065140	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
591	NC_022784	TATAC	2	10	1069790	1069799	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
592	NC_022784	GCATT	2	10	1074512	1074521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
593	NC_022784	ACATC	2	10	1077654	1077663	40 %	20 %	0 %	40 %	557626016
594	NC_022784	CGCCT	2	10	1078298	1078307	0 %	20 %	20 %	60 %	557626017
595	NC_022784	ACGTT	2	10	1080014	1080023	20 %	40 %	20 %	20 %	557626017
596	NC_022784	TCTGT	2	10	1081201	1081210	0 %	60 %	20 %	20 %	557626019
597	NC_022784	ATAGA	2	10	1082230	1082239	60 %	20 %	20 %	0 %	557626020
598	NC_022784	AACAT	2	10	1083844	1083853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
599	NC_022784	AAGTG	2	10	1086523	1086532	40 %	20 %	40 %	0 %	557626021
600	NC_022784	ATTGG	2	10	1088789	1088798	20 %	40 %	40 %	0 %	557626024
601	NC_022784	CTGTC	2	10	1089547	1089556	0 %	40 %	20 %	40 %	557626025
602	NC_022784	CTGTC	2	10	1090810	1090819	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
603	NC_022784	CACAA	2	10	1094189	1094198	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
604	NC_022784	GGTCA	2	10	1095918	1095927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
605	NC_022784	TTTGG	2	10	1096029	1096038	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022784	GTATA	2	10	1096497	1096506	40 %	40 %	20 %	0 %	557626158
607	NC_022784	GCACC	2	10	1096661	1096670	20 %	0 %	20 %	60 %	557626028
608	NC_022784	CAAGT	2	10	1099523	1099532	40 %	20 %	20 %	20 %	557626030
609	NC_022784	ACTCT	2	10	1100745	1100754	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
610	NC_022784	TGCAA	2	10	1100959	1100968	40 %	20 %	20 %	20 %	557626032
611	NC_022784	GAAAA	2	10	1102547	1102556	80 %	0 %	20 %	0 %	557626034
612	NC_022784	ATGCT	2	10	1107358	1107367	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
613	NC_022784	CACAT	2	10	1107799	1107808	40 %	20 %	0 %	40 %	557626041
614	NC_022784	AGGCA	2	10	1109178	1109187	40 %	0 %	40 %	20 %	557626041
615	NC_022784	TATGG	2	10	1111606	1111615	20 %	40 %	40 %	0 %	557626044
616	NC_022784	ATTGC	2	10	1112496	1112505	20 %	40 %	20 %	20 %	557626044
617	NC_022784	CAGCC	2	10	1116018	1116027	20 %	0 %	20 %	60 %	557626045
618	NC_022784	AGAAA	2	10	1119793	1119802	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022784	AAAAT	2	10	1119996	1120005	80 %	20 %	0 %	0 %	557626048
620	NC_022784	AGCCT	2	10	1120707	1120716	20 %	20 %	20 %	40 %	557626048
621	NC_022784	TCCTT	2	10	1121428	1121437	0 %	60 %	0 %	40 %	557626049
622	NC_022784	AGGTA	2	10	1123877	1123886	40 %	20 %	40 %	0 %	557626053
623	NC_022784	CGGTA	2	10	1124958	1124967	20 %	20 %	40 %	20 %	557626054
624	NC_022784	TCAAA	2	10	1126707	1126716	60 %	20 %	0 %	20 %	557626057
625	NC_022784	CGGGT	2	10	1127518	1127527	0 %	20 %	60 %	20 %	557626057
626	NC_022784	CAGTG	2	10	1129547	1129556	20 %	20 %	40 %	20 %	557626060
627	NC_022784	TATGG	2	10	1131396	1131405	20 %	40 %	40 %	0 %	557626061
628	NC_022784	AAACT	2	10	1136458	1136467	60 %	20 %	0 %	20 %	557626064
629	NC_022784	AACCA	2	10	1137162	1137171	60 %	0 %	0 %	40 %	557626064
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631	NC_022784	AGGAA	2	10	1140561	1140570	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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648	NC_022784	CTTGT	2	10	1167292	1167301	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
649	NC_022784	AGGAG	2	10	1168232	1168241	40 %	0 %	60 %	0 %	557626090
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656	NC_022784	ACCTA	2	10	1178766	1178775	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
657	NC_022784	ACCGC	2	10	1187430	1187439	20 %	0 %	20 %	60 %	557626102
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659	NC_022784	GCACA	2	10	1192071	1192080	40 %	0 %	20 %	40 %	557626106
660	NC_022784	TCCCT	2	10	1195084	1195093	0 %	40 %	0 %	60 %	557626161
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