MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium tetani 12124569

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022778	ATAATT	2	12	4308	4319	50 %	50 %	0 %	0 %	557606937
2	NC_022778	ATTTTT	2	12	5104	5115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	557606938
3	NC_022778	CTTTTT	2	12	5521	5532	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	557606939
4	NC_022778	GCAAAG	2	12	6180	6191	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	557606940
5	NC_022778	TAAAAA	2	12	6329	6340	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557606940
6	NC_022778	AATTTA	2	12	7058	7069	50 %	50 %	0 %	0 %	557606941
7	NC_022778	TATTAA	2	12	8324	8335	50 %	50 %	0 %	0 %	557606943
8	NC_022778	ATATGC	2	12	9531	9542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557606945
9	NC_022778	GAATAT	2	12	10625	10636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557606946
10	NC_022778	AATTAA	2	12	13360	13371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606948
11	NC_022778	AGAAAA	2	12	15330	15341	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	557606949
12	NC_022778	TAATGC	2	12	15548	15559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557606950
13	NC_022778	CTAATA	2	12	16474	16485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557606950
14	NC_022778	AATAAA	2	12	16756	16767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557606951
15	NC_022778	AATTTT	2	12	17032	17043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606952
16	NC_022778	TATTAA	2	12	19796	19807	50 %	50 %	0 %	0 %	557606956
17	NC_022778	AGTTGA	2	12	20573	20584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557606958
18	NC_022778	TCTTTA	2	12	23143	23154	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	557606961
19	NC_022778	TAGAAA	2	12	26642	26653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022778	TTTTCT	2	12	29602	29613	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	557606971
21	NC_022778	CATATT	2	12	31160	31171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	557606971
22	NC_022778	TTTTAT	2	12	32996	33007	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022778	TAGATT	2	12	34329	34340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	557606975
24	NC_022778	AGATAT	2	12	35691	35702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557606976
25	NC_022778	TATTTC	2	12	36514	36525	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022778	TGTAAA	2	12	43903	43914	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022778	TTAATT	2	12	44150	44161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606988
28	NC_022778	AGATAA	2	12	46104	46115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	557606989
29	NC_022778	TTTATT	2	12	46342	46353	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022778	TTGATA	2	12	49003	49014	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022778	TGGAGC	2	12	49555	49566	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	557606995
32	NC_022778	TATTTC	2	12	49902	49913	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	557606996
33	NC_022778	TATCAA	2	12	53303	53314	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557606997
34	NC_022778	AAATTT	2	12	54429	54440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022778	GCAAAG	2	12	55418	55429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022778	TAGATT	2	12	56531	56542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	557607000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.