MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium tetani 12124569

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022778	GAAAT	2	10	833	842	60 %	20 %	20 %	0 %	557606928
2	NC_022778	AATTA	2	10	1314	1323	60 %	40 %	0 %	0 %	557606930
3	NC_022778	ATATT	2	10	1557	1566	40 %	60 %	0 %	0 %	557606931
4	NC_022778	TAAAG	2	10	2151	2160	60 %	20 %	20 %	0 %	557606933
5	NC_022778	TATAA	2	10	2751	2760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022778	TTCAT	2	10	4231	4240	20 %	60 %	0 %	20 %	557606937
7	NC_022778	TAGCT	2	10	4518	4527	20 %	40 %	20 %	20 %	557606937
8	NC_022778	ATATT	2	10	7256	7265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022778	ATTTT	2	10	7670	7679	20 %	80 %	0 %	0 %	557606942
10	NC_022778	ATATA	2	10	8214	8223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022778	AAAGT	2	10	8362	8371	60 %	20 %	20 %	0 %	557606943
12	NC_022778	ATATT	2	10	9074	9083	40 %	60 %	0 %	0 %	557606944
13	NC_022778	TGAAA	2	10	9366	9375	60 %	20 %	20 %	0 %	557606944
14	NC_022778	ATTTA	2	10	9811	9820	40 %	60 %	0 %	0 %	557606945
15	NC_022778	ATAAA	2	10	11413	11422	80 %	20 %	0 %	0 %	557606946
16	NC_022778	TAAAA	2	10	12032	12041	80 %	20 %	0 %	0 %	557606946
17	NC_022778	ACCTT	2	10	12995	13004	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_022778	ATTAA	2	10	15139	15148	60 %	40 %	0 %	0 %	557606949
19	NC_022778	TATTT	2	10	17339	17348	20 %	80 %	0 %	0 %	557606953
20	NC_022778	TTTTA	2	10	18846	18855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022778	CATAA	2	10	19951	19960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022778	ATTTT	2	10	20079	20088	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022778	AAAAG	2	10	20492	20501	80 %	0 %	20 %	0 %	557606958
24	NC_022778	ATATA	2	10	20840	20849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022778	GTAAA	2	10	21093	21102	60 %	20 %	20 %	0 %	557606959
26	NC_022778	ATTAT	2	10	21287	21296	40 %	60 %	0 %	0 %	557606959
27	NC_022778	ATGGT	2	10	21312	21321	20 %	40 %	40 %	0 %	557606959
28	NC_022778	AACAA	2	10	23025	23034	80 %	0 %	0 %	20 %	557606961
29	NC_022778	GTAAA	2	10	23359	23368	60 %	20 %	20 %	0 %	557606961
30	NC_022778	GAAAT	2	10	23657	23666	60 %	20 %	20 %	0 %	557606961
31	NC_022778	ATTAT	2	10	23752	23761	40 %	60 %	0 %	0 %	557606961
32	NC_022778	GTTTT	2	10	24491	24500	0 %	80 %	20 %	0 %	557606962
33	NC_022778	CCATA	2	10	24626	24635	40 %	20 %	0 %	40 %	557606962
34	NC_022778	TTTTA	2	10	25335	25344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022778	TGTAC	2	10	26326	26335	20 %	40 %	20 %	20 %	557606965
36	NC_022778	ATTAT	2	10	26778	26787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022778	ATAAA	2	10	27141	27150	80 %	20 %	0 %	0 %	557606967
38	NC_022778	AAAAT	2	10	27410	27419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022778	TATCT	2	10	28209	28218	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022778	ATATA	2	10	28770	28779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022778	ATTTA	2	10	29280	29289	40 %	60 %	0 %	0 %	557606971
42	NC_022778	ATATT	2	10	29615	29624	40 %	60 %	0 %	0 %	557606971
43	NC_022778	AATGT	2	10	29876	29885	40 %	40 %	20 %	0 %	557606971
44	NC_022778	GTTTA	2	10	30609	30618	20 %	60 %	20 %	0 %	557606971
45	NC_022778	TTGTT	2	10	31280	31289	0 %	80 %	20 %	0 %	557606971
46	NC_022778	ATTTA	2	10	32176	32185	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022778	TAATT	2	10	32191	32200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022778	GTAAA	2	10	33100	33109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022778	GTAGA	2	10	33319	33328	40 %	20 %	40 %	0 %	557606974
50	NC_022778	TTTTA	2	10	33598	33607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022778	AAATT	2	10	34310	34319	60 %	40 %	0 %	0 %	557606975
52	NC_022778	ATAAA	2	10	36261	36270	80 %	20 %	0 %	0 %	557606977
53	NC_022778	TTTCT	2	10	36280	36289	0 %	80 %	0 %	20 %	557606977
54	NC_022778	ATTAT	2	10	36669	36678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022778	TTTTC	2	10	37217	37226	0 %	80 %	0 %	20 %	557606978
56	NC_022778	TATTT	2	10	37760	37769	20 %	80 %	0 %	0 %	557606979
57	NC_022778	TAAAA	2	10	39040	39049	80 %	20 %	0 %	0 %	557606981
58	NC_022778	ATTTA	2	10	39500	39509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022778	TAAAA	2	10	41106	41115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022778	TTTTG	2	10	41743	41752	0 %	80 %	20 %	0 %	557606986
61	NC_022778	AAAAT	2	10	42047	42056	80 %	20 %	0 %	0 %	557606986
62	NC_022778	AAAAC	2	10	42170	42179	80 %	0 %	0 %	20 %	557606986
63	NC_022778	TTAAA	2	10	42619	42628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022778	TTCAT	2	10	43083	43092	20 %	60 %	0 %	20 %	557606987
65	NC_022778	TAAAT	2	10	45951	45960	60 %	40 %	0 %	0 %	557606989
66	NC_022778	ATAAA	2	10	46594	46603	80 %	20 %	0 %	0 %	557606990
67	NC_022778	ATATA	2	10	46613	46622	60 %	40 %	0 %	0 %	557606990
68	NC_022778	TAGCT	2	10	46978	46987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022778	ATAAA	2	10	47063	47072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022778	TTTAT	2	10	47095	47104	20 %	80 %	0 %	0 %	557606991
71	NC_022778	TTTAT	2	10	47334	47343	20 %	80 %	0 %	0 %	557606992
72	NC_022778	TAAAA	2	10	47634	47643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022778	TTAAT	2	10	48174	48183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022778	ATATT	2	10	48308	48317	40 %	60 %	0 %	0 %	557606994
75	NC_022778	TATAG	2	10	49856	49865	40 %	40 %	20 %	0 %	557606996
76	NC_022778	ATTTT	2	10	49878	49887	20 %	80 %	0 %	0 %	557606996
77	NC_022778	TTAAC	2	10	49956	49965	40 %	40 %	0 %	20 %	557606996
78	NC_022778	ATTAT	2	10	50057	50066	40 %	60 %	0 %	0 %	557606996
79	NC_022778	CTTTT	2	10	52167	52176	0 %	80 %	0 %	20 %	557606997
80	NC_022778	GTAAT	2	10	52691	52700	40 %	40 %	20 %	0 %	557606997
81	NC_022778	TGACT	2	10	53336	53345	20 %	40 %	20 %	20 %	557606997
82	NC_022778	CAATA	2	10	53736	53745	60 %	20 %	0 %	20 %	557606997
83	NC_022778	AAGGT	2	10	53910	53919	40 %	20 %	40 %	0 %	557606997
84	NC_022778	AATTA	2	10	54478	54487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022778	AATTT	2	10	54718	54727	40 %	60 %	0 %	0 %	557606998
86	NC_022778	TGTAT	2	10	55131	55140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022778	AAATT	2	10	56512	56521	60 %	40 %	0 %	0 %	557607000
88	NC_022778	AAAAC	2	10	57299	57308	80 %	0 %	0 %	20 %	557607000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.