MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium tetani 12124569

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022778	GAAAT	2	10	833	842	60 %	20 %	20 %	0 %	557606928
2	NC_022778	AATTA	2	10	1314	1323	60 %	40 %	0 %	0 %	557606930
3	NC_022778	ATATT	2	10	1557	1566	40 %	60 %	0 %	0 %	557606931
4	NC_022778	TAAAG	2	10	2151	2160	60 %	20 %	20 %	0 %	557606933
5	NC_022778	TTCAT	2	10	4231	4240	20 %	60 %	0 %	20 %	557606937
6	NC_022778	TAGCT	2	10	4518	4527	20 %	40 %	20 %	20 %	557606937
7	NC_022778	ATTTT	2	10	7670	7679	20 %	80 %	0 %	0 %	557606942
8	NC_022778	AAAGT	2	10	8362	8371	60 %	20 %	20 %	0 %	557606943
9	NC_022778	ATATT	2	10	9074	9083	40 %	60 %	0 %	0 %	557606944
10	NC_022778	TGAAA	2	10	9366	9375	60 %	20 %	20 %	0 %	557606944
11	NC_022778	ATTTA	2	10	9811	9820	40 %	60 %	0 %	0 %	557606945
12	NC_022778	ATAAA	2	10	11413	11422	80 %	20 %	0 %	0 %	557606946
13	NC_022778	TAAAA	2	10	12032	12041	80 %	20 %	0 %	0 %	557606946
14	NC_022778	ATTAA	2	10	15139	15148	60 %	40 %	0 %	0 %	557606949
15	NC_022778	TATTT	2	10	17339	17348	20 %	80 %	0 %	0 %	557606953
16	NC_022778	AAAAG	2	10	20492	20501	80 %	0 %	20 %	0 %	557606958
17	NC_022778	GTAAA	2	10	21093	21102	60 %	20 %	20 %	0 %	557606959
18	NC_022778	ATTAT	2	10	21287	21296	40 %	60 %	0 %	0 %	557606959
19	NC_022778	ATGGT	2	10	21312	21321	20 %	40 %	40 %	0 %	557606959
20	NC_022778	AACAA	2	10	23025	23034	80 %	0 %	0 %	20 %	557606961
21	NC_022778	GTAAA	2	10	23359	23368	60 %	20 %	20 %	0 %	557606961
22	NC_022778	GAAAT	2	10	23657	23666	60 %	20 %	20 %	0 %	557606961
23	NC_022778	ATTAT	2	10	23752	23761	40 %	60 %	0 %	0 %	557606961
24	NC_022778	GTTTT	2	10	24491	24500	0 %	80 %	20 %	0 %	557606962
25	NC_022778	CCATA	2	10	24626	24635	40 %	20 %	0 %	40 %	557606962
26	NC_022778	TGTAC	2	10	26326	26335	20 %	40 %	20 %	20 %	557606965
27	NC_022778	ATAAA	2	10	27141	27150	80 %	20 %	0 %	0 %	557606967
28	NC_022778	ATTTA	2	10	29280	29289	40 %	60 %	0 %	0 %	557606971
29	NC_022778	ATATT	2	10	29615	29624	40 %	60 %	0 %	0 %	557606971
30	NC_022778	AATGT	2	10	29876	29885	40 %	40 %	20 %	0 %	557606971
31	NC_022778	GTTTA	2	10	30609	30618	20 %	60 %	20 %	0 %	557606971
32	NC_022778	TTGTT	2	10	31280	31289	0 %	80 %	20 %	0 %	557606971
33	NC_022778	GTAGA	2	10	33319	33328	40 %	20 %	40 %	0 %	557606974
34	NC_022778	AAATT	2	10	34310	34319	60 %	40 %	0 %	0 %	557606975
35	NC_022778	ATAAA	2	10	36261	36270	80 %	20 %	0 %	0 %	557606977
36	NC_022778	TTTCT	2	10	36280	36289	0 %	80 %	0 %	20 %	557606977
37	NC_022778	TTTTC	2	10	37217	37226	0 %	80 %	0 %	20 %	557606978
38	NC_022778	TATTT	2	10	37760	37769	20 %	80 %	0 %	0 %	557606979
39	NC_022778	TAAAA	2	10	39040	39049	80 %	20 %	0 %	0 %	557606981
40	NC_022778	TTTTG	2	10	41743	41752	0 %	80 %	20 %	0 %	557606986
41	NC_022778	AAAAT	2	10	42047	42056	80 %	20 %	0 %	0 %	557606986
42	NC_022778	AAAAC	2	10	42170	42179	80 %	0 %	0 %	20 %	557606986
43	NC_022778	TTCAT	2	10	43083	43092	20 %	60 %	0 %	20 %	557606987
44	NC_022778	TAAAT	2	10	45951	45960	60 %	40 %	0 %	0 %	557606989
45	NC_022778	ATAAA	2	10	46594	46603	80 %	20 %	0 %	0 %	557606990
46	NC_022778	ATATA	2	10	46613	46622	60 %	40 %	0 %	0 %	557606990
47	NC_022778	TTTAT	2	10	47095	47104	20 %	80 %	0 %	0 %	557606991
48	NC_022778	TTTAT	2	10	47334	47343	20 %	80 %	0 %	0 %	557606992
49	NC_022778	ATATT	2	10	48308	48317	40 %	60 %	0 %	0 %	557606994
50	NC_022778	TATAG	2	10	49856	49865	40 %	40 %	20 %	0 %	557606996
51	NC_022778	ATTTT	2	10	49878	49887	20 %	80 %	0 %	0 %	557606996
52	NC_022778	TTAAC	2	10	49956	49965	40 %	40 %	0 %	20 %	557606996
53	NC_022778	ATTAT	2	10	50057	50066	40 %	60 %	0 %	0 %	557606996
54	NC_022778	CTTTT	2	10	52167	52176	0 %	80 %	0 %	20 %	557606997
55	NC_022778	GTAAT	2	10	52691	52700	40 %	40 %	20 %	0 %	557606997
56	NC_022778	TGACT	2	10	53336	53345	20 %	40 %	20 %	20 %	557606997
57	NC_022778	CAATA	2	10	53736	53745	60 %	20 %	0 %	20 %	557606997
58	NC_022778	AAGGT	2	10	53910	53919	40 %	20 %	40 %	0 %	557606997
59	NC_022778	AATTT	2	10	54718	54727	40 %	60 %	0 %	0 %	557606998
60	NC_022778	AAATT	2	10	56512	56521	60 %	40 %	0 %	0 %	557607000
61	NC_022778	AAAAC	2	10	57299	57308	80 %	0 %	0 %	20 %	557607000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.