MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium tetani 12124569

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022778	ATGA	2	8	146	153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022778	AAGA	3	12	642	653	75 %	0 %	25 %	0 %	557606927
3	NC_022778	TAAA	2	8	725	732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022778	GATT	2	8	773	780	25 %	50 %	25 %	0 %	557606928
5	NC_022778	CTTT	2	8	784	791	0 %	75 %	0 %	25 %	557606928
6	NC_022778	ATGA	2	8	932	939	50 %	25 %	25 %	0 %	557606928
7	NC_022778	TATT	2	8	1051	1058	25 %	75 %	0 %	0 %	557606929
8	NC_022778	AATT	2	8	1213	1220	50 %	50 %	0 %	0 %	557606930
9	NC_022778	GGAA	2	8	1680	1687	50 %	0 %	50 %	0 %	557606931
10	NC_022778	TATT	2	8	1908	1915	25 %	75 %	0 %	0 %	557606932
11	NC_022778	AAAT	2	8	1951	1958	75 %	25 %	0 %	0 %	557606932
12	NC_022778	ATAC	2	8	2182	2189	50 %	25 %	0 %	25 %	557606933
13	NC_022778	TGAA	2	8	2432	2439	50 %	25 %	25 %	0 %	557606934
14	NC_022778	TACT	2	8	2620	2627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022778	TTTA	2	8	2628	2635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022778	AGTA	2	8	2647	2654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022778	TTAT	2	8	2794	2801	25 %	75 %	0 %	0 %	557606935
18	NC_022778	ACAA	2	8	3024	3031	75 %	0 %	0 %	25 %	557606935
19	NC_022778	ACCA	2	8	3148	3155	50 %	0 %	0 %	50 %	557606935
20	NC_022778	TGTA	2	8	3190	3197	25 %	50 %	25 %	0 %	557606935
21	NC_022778	GAAA	3	12	3220	3231	75 %	0 %	25 %	0 %	557606935
22	NC_022778	ATTA	2	8	3365	3372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022778	TTTA	2	8	3698	3705	25 %	75 %	0 %	0 %	557606936
24	NC_022778	AATA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	557606937
25	NC_022778	AATT	2	8	4250	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	557606937
26	NC_022778	ACTT	2	8	4352	4359	25 %	50 %	0 %	25 %	557606937
27	NC_022778	TAAA	2	8	4388	4395	75 %	25 %	0 %	0 %	557606937
28	NC_022778	TTAC	2	8	4528	4535	25 %	50 %	0 %	25 %	557606937
29	NC_022778	ACTT	2	8	4573	4580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022778	CTAT	2	8	4871	4878	25 %	50 %	0 %	25 %	557606938
31	NC_022778	TGTT	2	8	4879	4886	0 %	75 %	25 %	0 %	557606938
32	NC_022778	TATT	2	8	4943	4950	25 %	75 %	0 %	0 %	557606938
33	NC_022778	ATTA	2	8	5573	5580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022778	AATT	2	8	5637	5644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022778	TAAA	2	8	5720	5727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022778	TAAC	2	8	6739	6746	50 %	25 %	0 %	25 %	557606940
37	NC_022778	ATAG	2	8	6809	6816	50 %	25 %	25 %	0 %	557606940
38	NC_022778	GTTA	2	8	6898	6905	25 %	50 %	25 %	0 %	557606941
39	NC_022778	ATTT	2	8	7499	7506	25 %	75 %	0 %	0 %	557606942
40	NC_022778	TATT	3	12	7744	7755	25 %	75 %	0 %	0 %	557606942
41	NC_022778	TCCT	2	8	8031	8038	0 %	50 %	0 %	50 %	557606942
42	NC_022778	ATTA	2	8	8303	8310	50 %	50 %	0 %	0 %	557606943
43	NC_022778	TAAA	2	8	8395	8402	75 %	25 %	0 %	0 %	557606943
44	NC_022778	ATTT	2	8	8644	8651	25 %	75 %	0 %	0 %	557606943
45	NC_022778	AAAT	2	8	8914	8921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022778	TATT	2	8	9275	9282	25 %	75 %	0 %	0 %	557606944
47	NC_022778	TAAA	2	8	9621	9628	75 %	25 %	0 %	0 %	557606945
48	NC_022778	ATTA	2	8	10232	10239	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
49	NC_022778	ACAA	2	8	10411	10418	75 %	0 %	0 %	25 %	557606946
50	NC_022778	TAAT	2	8	10672	10679	50 %	50 %	0 %	0 %	557606946
51	NC_022778	TAGA	2	8	11077	11084	50 %	25 %	25 %	0 %	557606946
52	NC_022778	AGAA	2	8	11121	11128	75 %	0 %	25 %	0 %	557606946
53	NC_022778	TATT	2	8	11299	11306	25 %	75 %	0 %	0 %	557606946
54	NC_022778	ATAA	2	8	11691	11698	75 %	25 %	0 %	0 %	557606946
55	NC_022778	CATG	2	8	11699	11706	25 %	25 %	25 %	25 %	557606946
56	NC_022778	TAAA	2	8	11755	11762	75 %	25 %	0 %	0 %	557606946
57	NC_022778	TAAA	2	8	12049	12056	75 %	25 %	0 %	0 %	557606946
58	NC_022778	AAAT	2	8	12127	12134	75 %	25 %	0 %	0 %	557606946
59	NC_022778	AAAG	2	8	12212	12219	75 %	0 %	25 %	0 %	557606946
60	NC_022778	TTAT	2	8	12579	12586	25 %	75 %	0 %	0 %	557606946
61	NC_022778	AATA	2	8	12638	12645	75 %	25 %	0 %	0 %	557606946
62	NC_022778	GTAT	2	8	13067	13074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022778	TCTA	2	8	13169	13176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022778	CTTT	2	8	13720	13727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022778	AAAG	2	8	14668	14675	75 %	0 %	25 %	0 %	557606949
66	NC_022778	GAAG	2	8	14788	14795	50 %	0 %	50 %	0 %	557606949
67	NC_022778	TTAA	2	8	14806	14813	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
68	NC_022778	TTAA	2	8	14836	14843	50 %	50 %	0 %	0 %	557606949
69	NC_022778	AATC	2	8	15013	15020	50 %	25 %	0 %	25 %	557606949
70	NC_022778	GTTT	2	8	16191	16198	0 %	75 %	25 %	0 %	557606950
71	NC_022778	TAAA	2	8	16294	16301	75 %	25 %	0 %	0 %	557606950
72	NC_022778	AATT	2	8	16605	16612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022778	AAAT	2	8	16685	16692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022778	ATTT	2	8	16720	16727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022778	ATTG	2	8	17353	17360	25 %	50 %	25 %	0 %	557606953
76	NC_022778	AAAT	2	8	17536	17543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022778	AAAT	2	8	17884	17891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022778	TTTA	2	8	17990	17997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022778	ATGG	2	8	18483	18490	25 %	25 %	50 %	0 %	557606954
80	NC_022778	GTTT	2	8	18706	18713	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022778	AACT	2	8	18888	18895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022778	ATAA	2	8	18940	18947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022778	GATT	2	8	19032	19039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022778	GATA	2	8	19114	19121	50 %	25 %	25 %	0 %	557606955
85	NC_022778	TAAT	2	8	19294	19301	50 %	50 %	0 %	0 %	557606955
86	NC_022778	TAAT	2	8	19308	19315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022778	TTTA	2	8	19462	19469	25 %	75 %	0 %	0 %	557606956
88	NC_022778	TTTC	2	8	19771	19778	0 %	75 %	0 %	25 %	557606956
89	NC_022778	TTCA	2	8	19809	19816	25 %	50 %	0 %	25 %	557606956
90	NC_022778	TAAA	2	8	20243	20250	75 %	25 %	0 %	0 %	557606957
91	NC_022778	AAAT	2	8	20587	20594	75 %	25 %	0 %	0 %	557606958
92	NC_022778	AGTA	2	8	20742	20749	50 %	25 %	25 %	0 %	557606958
93	NC_022778	AGAA	2	8	21136	21143	75 %	0 %	25 %	0 %	557606959
94	NC_022778	GTTT	2	8	22009	22016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022778	TTTA	2	8	22064	22071	25 %	75 %	0 %	0 %	557606961
96	NC_022778	ATCC	2	8	22396	22403	25 %	25 %	0 %	50 %	557606961
97	NC_022778	ATAG	2	8	22525	22532	50 %	25 %	25 %	0 %	557606961
98	NC_022778	TCAT	2	8	22705	22712	25 %	50 %	0 %	25 %	557606961
99	NC_022778	ATTT	2	8	22769	22776	25 %	75 %	0 %	0 %	557606961
100	NC_022778	ATTT	2	8	22958	22965	25 %	75 %	0 %	0 %	557606961
101	NC_022778	AGTT	2	8	23391	23398	25 %	50 %	25 %	0 %	557606961
102	NC_022778	AATA	2	8	24128	24135	75 %	25 %	0 %	0 %	557606961
103	NC_022778	CATA	2	8	24210	24217	50 %	25 %	0 %	25 %	557606961
104	NC_022778	ATGC	2	8	24218	24225	25 %	25 %	25 %	25 %	557606961
105	NC_022778	ATTA	2	8	24264	24271	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
106	NC_022778	TAAT	2	8	24302	24309	50 %	50 %	0 %	0 %	557606961
107	NC_022778	TAAA	2	8	24341	24348	75 %	25 %	0 %	0 %	557606961
108	NC_022778	TCCT	2	8	24395	24402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022778	TTCT	2	8	24802	24809	0 %	75 %	0 %	25 %	557606962
110	NC_022778	ATTT	2	8	25137	25144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022778	TTAA	2	8	25585	25592	50 %	50 %	0 %	0 %	557606963
112	NC_022778	TTTA	2	8	25635	25642	25 %	75 %	0 %	0 %	557606963
113	NC_022778	ACTA	2	8	25864	25871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022778	ATTT	2	8	26754	26761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022778	AATA	2	8	26986	26993	75 %	25 %	0 %	0 %	557606966
116	NC_022778	AAAC	2	8	27209	27216	75 %	0 %	0 %	25 %	557606967
117	NC_022778	ATAA	2	8	27872	27879	75 %	25 %	0 %	0 %	557606968
118	NC_022778	AATA	3	12	27901	27912	75 %	25 %	0 %	0 %	557606968
119	NC_022778	ATTT	2	8	27915	27922	25 %	75 %	0 %	0 %	557606968
120	NC_022778	TAAA	2	8	27939	27946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022778	TAAT	2	8	27956	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	557606969
122	NC_022778	ATTT	2	8	28538	28545	25 %	75 %	0 %	0 %	557606970
123	NC_022778	AATA	2	8	28605	28612	75 %	25 %	0 %	0 %	557606970
124	NC_022778	TATT	2	8	28613	28620	25 %	75 %	0 %	0 %	557606970
125	NC_022778	TTTA	2	8	28713	28720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022778	TTTA	2	8	28740	28747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022778	ATAA	2	8	28958	28965	75 %	25 %	0 %	0 %	557606971
128	NC_022778	TTAG	2	8	29089	29096	25 %	50 %	25 %	0 %	557606971
129	NC_022778	AATA	2	8	29135	29142	75 %	25 %	0 %	0 %	557606971
130	NC_022778	TTTA	2	8	29298	29305	25 %	75 %	0 %	0 %	557606971
131	NC_022778	TTTA	2	8	29811	29818	25 %	75 %	0 %	0 %	557606971
132	NC_022778	CTTT	2	8	29926	29933	0 %	75 %	0 %	25 %	557606971
133	NC_022778	CATC	2	8	30247	30254	25 %	25 %	0 %	50 %	557606971
134	NC_022778	TCTT	2	8	30291	30298	0 %	75 %	0 %	25 %	557606971
135	NC_022778	AAAG	2	8	30543	30550	75 %	0 %	25 %	0 %	557606971
136	NC_022778	TTTA	2	8	30900	30907	25 %	75 %	0 %	0 %	557606971
137	NC_022778	ATTT	2	8	31185	31192	25 %	75 %	0 %	0 %	557606971
138	NC_022778	TAAA	2	8	31470	31477	75 %	25 %	0 %	0 %	557606971
139	NC_022778	TTTG	2	8	31584	31591	0 %	75 %	25 %	0 %	557606971
140	NC_022778	TTTA	2	8	31689	31696	25 %	75 %	0 %	0 %	557606971
141	NC_022778	AGTT	2	8	31769	31776	25 %	50 %	25 %	0 %	557606971
142	NC_022778	ATGG	2	8	32307	32314	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022778	ATAA	2	8	32337	32344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022778	CTTT	2	8	32700	32707	0 %	75 %	0 %	25 %	557606973
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146	NC_022778	TAAA	2	8	34536	34543	75 %	25 %	0 %	0 %	557606975
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.