MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium tetani 12124569 main chromosome

Total Repeats: 1846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022777	TTATCT	2	12	2275	2286	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	557604011
2	NC_022777	AATATA	2	12	2719	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022777	ATTCAA	2	12	5265	5276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557604014
4	NC_022777	AAAAAT	2	12	11045	11056	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604015
5	NC_022777	ACTTCA	2	12	12737	12748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604019
6	NC_022777	AAAAAT	2	12	13142	13153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604019
7	NC_022777	TACTTT	2	12	13899	13910	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	557604020
8	NC_022777	TGTAGA	2	12	19008	19019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604025
9	NC_022777	CTATTG	2	12	22377	22388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	557604030
10	NC_022777	TTATAT	2	12	24548	24559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604033
11	NC_022777	TAACTT	2	12	26385	26396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022777	ATTTAT	2	12	26574	26585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604036
13	NC_022777	AAAATA	2	12	27327	27338	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022777	CCCTGT	2	12	30235	30246	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	557604039
15	NC_022777	TCAAAT	2	12	30455	30466	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557604039
16	NC_022777	ATTTGG	2	12	30529	30540	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	557604039
17	NC_022777	ATATTT	2	12	31172	31183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604040
18	NC_022777	TAATAT	2	12	32166	32177	50 %	50 %	0 %	0 %	557604041
19	NC_022777	TAAGTA	2	12	37153	37164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604044
20	NC_022777	TATAAT	2	12	37253	37264	50 %	50 %	0 %	0 %	557604044
21	NC_022777	TTATAT	2	12	37282	37293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604044
22	NC_022777	TTTATT	2	12	38882	38893	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	557604046
23	NC_022777	TTTTTC	2	12	44668	44679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	557604047
24	NC_022777	TGCTTG	2	12	45793	45804	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	557604047
25	NC_022777	TCTCTT	2	12	49825	49836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604051
26	NC_022777	TCTTTA	2	12	50233	50244	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	557604051
27	NC_022777	TGATAG	2	12	53906	53917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022777	ATAAAT	2	12	59319	59330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604060
29	NC_022777	AGTTAT	2	12	60415	60426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	557604062
30	NC_022777	TTAGAA	2	12	61595	61606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604063
31	NC_022777	AAGAAA	2	12	61900	61911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	557604064
32	NC_022777	AGATAT	2	12	62417	62428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604064
33	NC_022777	ATAGAA	2	12	62634	62645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	557604064
34	NC_022777	GAATTA	2	12	63802	63813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604066
35	NC_022777	CTAAAG	2	12	64131	64142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	557604067
36	NC_022777	TAAAAT	2	12	66029	66040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604068
37	NC_022777	GAACAG	2	12	66729	66740	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	557604071
38	NC_022777	GTAGAA	2	12	67837	67848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022777	TAATGA	2	12	69291	69302	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604076
40	NC_022777	GGGAGG	2	12	70785	70796	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	557604076
41	NC_022777	AAATTT	2	12	71027	71038	50 %	50 %	0 %	0 %	557604077
42	NC_022777	ATGTTA	2	12	72943	72954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	557604078
43	NC_022777	GAAATG	2	12	75119	75130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	557604080
44	NC_022777	TATAAA	2	12	76603	76614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604081
45	NC_022777	GGAGCA	2	12	78089	78100	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	557604084
46	NC_022777	AGATAT	2	12	79276	79287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604084
47	NC_022777	TAAATA	2	12	79327	79338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022777	ATATAA	2	12	79915	79926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604086
49	NC_022777	TAAAAA	2	12	79954	79965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604086
50	NC_022777	ATAGCT	2	12	85093	85104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557604092
51	NC_022777	AGCTAT	2	12	90538	90549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557604099
52	NC_022777	TAAATG	2	12	91014	91025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604099
53	NC_022777	CACCAG	2	12	92060	92071	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	557604100
54	NC_022777	GGTACA	2	12	92158	92169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	557604100
55	NC_022777	AAAAGA	2	12	92561	92572	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	557604101
56	NC_022777	ATCACC	2	12	92753	92764	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	557604101
57	NC_022777	AGCAGA	2	12	93362	93373	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	557604102
58	NC_022777	ATAAAA	2	12	96466	96477	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604104
59	NC_022777	TTTTAT	2	12	96503	96514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022777	ATTTAA	2	12	100418	100429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022777	AATCCA	2	12	100524	100535	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	557604110
62	NC_022777	TAAAGA	2	12	103968	103979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	557604113
63	NC_022777	TAAAAA	2	12	110838	110849	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022777	ATGGTG	2	12	111710	111721	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	557604121
65	NC_022777	ACATAT	2	12	114200	114211	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557604124
66	NC_022777	ATAATT	2	12	114375	114386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022777	TAGAGC	2	12	117390	117401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	557604128
68	NC_022777	TTTTAA	2	12	117806	117817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604128
69	NC_022777	CTTTAT	2	12	118342	118353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	557604129
70	NC_022777	TTATTT	2	12	118951	118962	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	557604130
71	NC_022777	TAATAT	2	12	123857	123868	50 %	50 %	0 %	0 %	557604137
72	NC_022777	AACACC	2	12	123981	123992	50 %	0 %	0 %	50 %	557604137
73	NC_022777	AATATC	2	12	126769	126780	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557604140
74	NC_022777	TCAAAA	2	12	128645	128656	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	557604141
75	NC_022777	AGATAA	2	12	128788	128799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	557604141
76	NC_022777	ATAGAG	2	12	130285	130296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	557604143
77	NC_022777	AATTTA	2	12	130367	130378	50 %	50 %	0 %	0 %	557604143
78	NC_022777	TGAAAA	2	12	130898	130909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	557604144
79	NC_022777	TAGAAT	2	12	130921	130932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604144
80	NC_022777	TTAAAG	2	12	133090	133101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604146
81	NC_022777	ATAAAA	2	12	133723	133734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604146
82	NC_022777	TTTTAT	2	12	134986	134997	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022777	ATCAAT	2	12	136827	136838	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557604150
84	NC_022777	TATCTT	2	12	136973	136984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	557604151
85	NC_022777	ATTTAT	2	12	137001	137012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604151
86	NC_022777	ATTTAT	2	12	137252	137263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604151
87	NC_022777	TAAATC	2	12	140159	140170	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022777	AATAAA	2	12	141529	141540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604155
89	NC_022777	TGTAGT	2	12	143583	143594	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	557604157
90	NC_022777	ATAGAT	2	12	144597	144608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604158
91	NC_022777	TAGATG	2	12	145900	145911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604159
92	NC_022777	AGGGCT	2	12	146165	146176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	557604159
93	NC_022777	TATCTA	2	12	154719	154730	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	557604165
94	NC_022777	TTAATA	2	12	156107	156118	50 %	50 %	0 %	0 %	557604166
95	NC_022777	AAAATA	2	12	156413	156424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604166
96	NC_022777	TAAAAA	2	12	158393	158404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604171
97	NC_022777	GTACTA	2	12	163007	163018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557604174
98	NC_022777	ATTTTG	2	12	163394	163405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	557604174
99	NC_022777	AGATTT	2	12	163921	163932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	557604175
100	NC_022777	TTTTTG	2	12	164351	164362	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	557604176
101	NC_022777	GTTTAT	2	12	164679	164690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	557604176
102	NC_022777	AGAAAA	2	12	166065	166076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	557604176
103	NC_022777	TATGGA	2	12	167377	167388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604178
104	NC_022777	TAATGA	2	12	167846	167857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604179
105	NC_022777	TGATAA	2	12	168023	168034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604179
106	NC_022777	GATAAG	2	12	168500	168511	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	557604180
107	NC_022777	TAGATA	2	12	170706	170717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604183
108	NC_022777	ATTTTT	2	12	171819	171830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022777	CAGAAG	2	12	181028	181039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	557604186
110	NC_022777	AAGAAA	2	12	181430	181441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	557604186
111	NC_022777	CTTTAA	2	12	184289	184300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	557604189
112	NC_022777	AAAGAA	2	12	188536	188547	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	557604195
113	NC_022777	ATAGAA	2	12	189140	189151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	557604196
114	NC_022777	AAGATA	2	12	189165	189176	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	557604196
115	NC_022777	TGTAAT	2	12	191200	191211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	557604200
116	NC_022777	TAAAGT	2	12	194854	194865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604204
117	NC_022777	ACTAAT	2	12	195867	195878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557604205
118	NC_022777	GTATAA	2	12	197756	197767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022777	CAGATG	2	12	198949	198960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	557604209
120	NC_022777	TATTAA	2	12	199223	199234	50 %	50 %	0 %	0 %	557604209
121	NC_022777	AAATAA	2	12	206600	206611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	557604217
122	NC_022777	TAGGTA	2	12	207711	207722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604218
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241	NC_022777	AATTAG	2	12	380936	380947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557604382
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355	NC_022777	TGGGGA	2	12	547510	547521	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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357	NC_022777	AGAGTT	2	12	548361	548372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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