MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium tetani 12124569 main chromosome

Total Repeats: 2471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022777	TCTAT	2	10	589	598	20 %	60 %	0 %	20 %	557604011
2	NC_022777	ATTTT	2	10	1384	1393	20 %	80 %	0 %	0 %	557604011
3	NC_022777	TAAAT	2	10	2957	2966	60 %	40 %	0 %	0 %	557604012
4	NC_022777	ATGAT	2	10	3313	3322	40 %	40 %	20 %	0 %	557604012
5	NC_022777	AACAG	2	10	4127	4136	60 %	0 %	20 %	20 %	557604012
6	NC_022777	TAAAA	2	10	4494	4503	80 %	20 %	0 %	0 %	557604013
7	NC_022777	CTAAA	2	10	11352	11361	60 %	20 %	0 %	20 %	557604015
8	NC_022777	ATTAT	2	10	12701	12710	40 %	60 %	0 %	0 %	557604018
9	NC_022777	ATAGT	2	10	13262	13271	40 %	40 %	20 %	0 %	557604019
10	NC_022777	TTTTA	2	10	13272	13281	20 %	80 %	0 %	0 %	557604019
11	NC_022777	CACAT	2	10	15805	15814	40 %	20 %	0 %	40 %	557604022
12	NC_022777	CTCTT	2	10	16285	16294	0 %	60 %	0 %	40 %	557604022
13	NC_022777	AAATA	2	10	16548	16557	80 %	20 %	0 %	0 %	557604023
14	NC_022777	TCTAA	2	10	17384	17393	40 %	40 %	0 %	20 %	557604024
15	NC_022777	ATATA	2	10	18324	18333	60 %	40 %	0 %	0 %	557604025
16	NC_022777	TCTTT	2	10	19124	19133	0 %	80 %	0 %	20 %	557604025
17	NC_022777	TTTAA	2	10	19908	19917	40 %	60 %	0 %	0 %	557604026
18	NC_022777	TATTT	2	10	20254	20263	20 %	80 %	0 %	0 %	557604027
19	NC_022777	TTTCT	2	10	21810	21819	0 %	80 %	0 %	20 %	557604030
20	NC_022777	ATTAT	2	10	23266	23275	40 %	60 %	0 %	0 %	557604032
21	NC_022777	ATTTT	2	10	23284	23293	20 %	80 %	0 %	0 %	557604032
22	NC_022777	TTCTT	2	10	28199	28208	0 %	80 %	0 %	20 %	557604038
23	NC_022777	AAAAT	2	10	28250	28259	80 %	20 %	0 %	0 %	557604038
24	NC_022777	TTTCA	2	10	30631	30640	20 %	60 %	0 %	20 %	557604039
25	NC_022777	CTTCT	2	10	31883	31892	0 %	60 %	0 %	40 %	557604041
26	NC_022777	AATTT	2	10	33753	33762	40 %	60 %	0 %	0 %	557604042
27	NC_022777	ACATT	2	10	33765	33774	40 %	40 %	0 %	20 %	557604042
28	NC_022777	AGTTA	2	10	34765	34774	40 %	40 %	20 %	0 %	557604042
29	NC_022777	ATTTT	2	10	34907	34916	20 %	80 %	0 %	0 %	557604042
30	NC_022777	AATTT	2	10	34988	34997	40 %	60 %	0 %	0 %	557604042
31	NC_022777	ATAAA	2	10	35121	35130	80 %	20 %	0 %	0 %	557604042
32	NC_022777	TTTAC	2	10	36721	36730	20 %	60 %	0 %	20 %	557604043
33	NC_022777	TATAT	2	10	37065	37074	40 %	60 %	0 %	0 %	557604044
34	NC_022777	ATACA	2	10	37711	37720	60 %	20 %	0 %	20 %	557604044
35	NC_022777	TTATT	2	10	38040	38049	20 %	80 %	0 %	0 %	557604045
36	NC_022777	TAGTA	2	10	38109	38118	40 %	40 %	20 %	0 %	557604045
37	NC_022777	TTAAT	2	10	38565	38574	40 %	60 %	0 %	0 %	557604046
38	NC_022777	TTAAG	2	10	39034	39043	40 %	40 %	20 %	0 %	557604046
39	NC_022777	GCTTT	2	10	46245	46254	0 %	60 %	20 %	20 %	557604047
40	NC_022777	TTTTA	2	10	46417	46426	20 %	80 %	0 %	0 %	557604047
41	NC_022777	AATAT	2	10	46905	46914	60 %	40 %	0 %	0 %	557604047
42	NC_022777	GTTTT	2	10	47966	47975	0 %	80 %	20 %	0 %	557604048
43	NC_022777	TCAAT	2	10	49988	49997	40 %	40 %	0 %	20 %	557604051
44	NC_022777	TATAA	2	10	50527	50536	60 %	40 %	0 %	0 %	557604052
45	NC_022777	ATTTT	2	10	52523	52532	20 %	80 %	0 %	0 %	557604054
46	NC_022777	TATAT	2	10	53238	53247	40 %	60 %	0 %	0 %	557604054
47	NC_022777	ATAAA	2	10	54367	54376	80 %	20 %	0 %	0 %	557604056
48	NC_022777	AATAT	2	10	54983	54992	60 %	40 %	0 %	0 %	557604057
49	NC_022777	TAATT	2	10	55516	55525	40 %	60 %	0 %	0 %	557604058
50	NC_022777	AAGAG	2	10	55816	55825	60 %	0 %	40 %	0 %	557604058
51	NC_022777	GTAAA	2	10	57861	57870	60 %	20 %	20 %	0 %	557604060
52	NC_022777	TAGAA	2	10	59203	59212	60 %	20 %	20 %	0 %	557604060
53	NC_022777	AAATA	2	10	60595	60604	80 %	20 %	0 %	0 %	557604062
54	NC_022777	ATTAT	2	10	62808	62817	40 %	60 %	0 %	0 %	557604065
55	NC_022777	AAGCC	2	10	65935	65944	40 %	0 %	20 %	40 %	557604068
56	NC_022777	AATAC	2	10	67920	67929	60 %	20 %	0 %	20 %	557604074
57	NC_022777	GATAA	2	10	70102	70111	60 %	20 %	20 %	0 %	557604076
58	NC_022777	TTTTA	2	10	70447	70456	20 %	80 %	0 %	0 %	557604076
59	NC_022777	AAATT	2	10	71287	71296	60 %	40 %	0 %	0 %	557604077
60	NC_022777	AGTAC	2	10	73786	73795	40 %	20 %	20 %	20 %	557604079
61	NC_022777	AAATT	2	10	75040	75049	60 %	40 %	0 %	0 %	557604080
62	NC_022777	TAAAA	2	10	76545	76554	80 %	20 %	0 %	0 %	557604081
63	NC_022777	ATAAA	2	10	78261	78270	80 %	20 %	0 %	0 %	557604084
64	NC_022777	CCTAT	2	10	81618	81627	20 %	40 %	0 %	40 %	557604087
65	NC_022777	ATAAA	2	10	86804	86813	80 %	20 %	0 %	0 %	557604093
66	NC_022777	GATTA	2	10	88621	88630	40 %	40 %	20 %	0 %	557604097
67	NC_022777	ATAAA	2	10	90242	90251	80 %	20 %	0 %	0 %	557604098
68	NC_022777	TGATA	2	10	91051	91060	40 %	40 %	20 %	0 %	557604099
69	NC_022777	ATTAG	2	10	92095	92104	40 %	40 %	20 %	0 %	557604100
70	NC_022777	AAATA	2	10	92411	92420	80 %	20 %	0 %	0 %	557604100
71	NC_022777	AAGAA	2	10	92645	92654	80 %	0 %	20 %	0 %	557604101
72	NC_022777	ATGGA	2	10	92917	92926	40 %	20 %	40 %	0 %	557604101
73	NC_022777	TTAAG	2	10	93301	93310	40 %	40 %	20 %	0 %	557604102
74	NC_022777	TTTTA	2	10	94252	94261	20 %	80 %	0 %	0 %	557604103
75	NC_022777	TAATA	2	10	96359	96368	60 %	40 %	0 %	0 %	557604104
76	NC_022777	TCTAG	2	10	96600	96609	20 %	40 %	20 %	20 %	557604105
77	NC_022777	TTTTA	2	10	98158	98167	20 %	80 %	0 %	0 %	557604106
78	NC_022777	TTCTT	2	10	101364	101373	0 %	80 %	0 %	20 %	557604110
79	NC_022777	TGAAG	2	10	101511	101520	40 %	20 %	40 %	0 %	557604110
80	NC_022777	TTATA	2	10	105620	105629	40 %	60 %	0 %	0 %	557604115
81	NC_022777	TATAA	2	10	106989	106998	60 %	40 %	0 %	0 %	557604117
82	NC_022777	AATTT	2	10	109146	109155	40 %	60 %	0 %	0 %	557604119
83	NC_022777	AAAGA	2	10	111673	111682	80 %	0 %	20 %	0 %	557604121
84	NC_022777	CTTCT	2	10	112794	112803	0 %	60 %	0 %	40 %	557604122
85	NC_022777	AAAAT	2	10	114689	114698	80 %	20 %	0 %	0 %	557604125
86	NC_022777	TAATA	2	10	116570	116579	60 %	40 %	0 %	0 %	557604127
87	NC_022777	TAATC	2	10	117048	117057	40 %	40 %	0 %	20 %	557604128
88	NC_022777	GGTAT	2	10	120870	120879	20 %	40 %	40 %	0 %	557604132
89	NC_022777	TCTTT	2	10	122238	122247	0 %	80 %	0 %	20 %	557604134
90	NC_022777	TCCTC	2	10	122559	122568	0 %	40 %	0 %	60 %	557604134
91	NC_022777	GGCAA	2	10	123762	123771	40 %	0 %	40 %	20 %	557604137
92	NC_022777	AACAT	2	10	124936	124945	60 %	20 %	0 %	20 %	557604138
93	NC_022777	ATTTA	2	10	125211	125220	40 %	60 %	0 %	0 %	557604138
94	NC_022777	TGTTC	2	10	127843	127852	0 %	60 %	20 %	20 %	557604140
95	NC_022777	GAGTA	2	10	129008	129017	40 %	20 %	40 %	0 %	557604141
96	NC_022777	ATGAA	2	10	130720	130729	60 %	20 %	20 %	0 %	557604144
97	NC_022777	TAGTA	2	10	131066	131075	40 %	40 %	20 %	0 %	557604144
98	NC_022777	TTAAA	2	10	132367	132376	60 %	40 %	0 %	0 %	557604145
99	NC_022777	TTAAA	2	10	133147	133156	60 %	40 %	0 %	0 %	557604146
100	NC_022777	CAATA	2	10	133710	133719	60 %	20 %	0 %	20 %	557604146
101	NC_022777	AAATG	2	10	134039	134048	60 %	20 %	20 %	0 %	557604147
102	NC_022777	TAAAT	2	10	136722	136731	60 %	40 %	0 %	0 %	557604150
103	NC_022777	ACAGG	2	10	137992	138001	40 %	0 %	40 %	20 %	557604151
104	NC_022777	AAAAT	2	10	138634	138643	80 %	20 %	0 %	0 %	557604152
105	NC_022777	AAATT	3	15	138757	138771	60 %	40 %	0 %	0 %	557604153
106	NC_022777	AATAA	2	10	140283	140292	80 %	20 %	0 %	0 %	557604154
107	NC_022777	GACAG	2	10	143375	143384	40 %	0 %	40 %	20 %	557604157
108	NC_022777	AAGAC	2	10	143726	143735	60 %	0 %	20 %	20 %	557604157
109	NC_022777	TAAAT	2	10	144140	144149	60 %	40 %	0 %	0 %	557604158
110	NC_022777	ATATT	2	10	147501	147510	40 %	60 %	0 %	0 %	557604160
111	NC_022777	TAGAA	2	10	148806	148815	60 %	20 %	20 %	0 %	557604162
112	NC_022777	CAGCA	2	10	150380	150389	40 %	0 %	20 %	40 %	557604162
113	NC_022777	AATAG	2	10	151621	151630	60 %	20 %	20 %	0 %	557604162
114	NC_022777	AAAGT	2	10	152095	152104	60 %	20 %	20 %	0 %	557604163
115	NC_022777	AAAGG	2	10	153309	153318	60 %	0 %	40 %	0 %	557604164
116	NC_022777	AATAT	2	10	154928	154937	60 %	40 %	0 %	0 %	557604165
117	NC_022777	GATAA	2	10	156217	156226	60 %	20 %	20 %	0 %	557604166
118	NC_022777	AAAAT	2	10	156634	156643	80 %	20 %	0 %	0 %	557604166
119	NC_022777	TAAAG	2	10	158741	158750	60 %	20 %	20 %	0 %	557604172
120	NC_022777	ATTAT	3	15	160268	160282	40 %	60 %	0 %	0 %	557604173
121	NC_022777	AAAAC	2	10	160314	160323	80 %	0 %	0 %	20 %	557604173
122	NC_022777	ATTAT	2	10	161128	161137	40 %	60 %	0 %	0 %	557604173
123	NC_022777	AGCAG	2	10	161183	161192	40 %	0 %	40 %	20 %	557604173
124	NC_022777	AATAA	2	10	161298	161307	80 %	20 %	0 %	0 %	557604173
125	NC_022777	GATGG	2	10	161631	161640	20 %	20 %	60 %	0 %	557604173
126	NC_022777	ATACA	2	10	162293	162302	60 %	20 %	0 %	20 %	557604174
127	NC_022777	GAAAT	2	10	163559	163568	60 %	20 %	20 %	0 %	557604174
128	NC_022777	GAAAA	2	10	165523	165532	80 %	0 %	20 %	0 %	557604176
129	NC_022777	ATATA	2	10	168614	168623	60 %	40 %	0 %	0 %	557604181
130	NC_022777	AAAAT	2	10	168641	168650	80 %	20 %	0 %	0 %	557604181
131	NC_022777	ATATA	2	10	168762	168771	60 %	40 %	0 %	0 %	557604181
132	NC_022777	AAATG	2	10	169338	169347	60 %	20 %	20 %	0 %	557604181
133	NC_022777	GAATT	2	10	169385	169394	40 %	40 %	20 %	0 %	557604181
134	NC_022777	AAAAG	2	10	169618	169627	80 %	0 %	20 %	0 %	557604182
135	NC_022777	TCTTT	2	10	171142	171151	0 %	80 %	0 %	20 %	557604183
136	NC_022777	TTTAA	2	10	172555	172564	40 %	60 %	0 %	0 %	557604184
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