MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium tetani 12124569 main chromosome

Total Repeats: 5477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022777	TGT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022777	CAA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022777	TAT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022777	GTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022777	TAT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022777	TTA	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022777	TTA	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022777	AGG	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022777	AGG	2	6	4218	4223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022777	AGA	3	9	4251	4259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022777	GAT	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022777	ATA	2	6	5421	5426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022777	ATT	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022777	AAT	2	6	5810	5815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022777	AAT	2	6	5838	5843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022777	TGC	2	6	5888	5893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022777	TCG	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022777	CTC	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_022777	ACG	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022777	CTA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022777	ACC	2	6	6337	6342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_022777	AGG	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022777	GGT	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022777	GCC	2	6	6831	6836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_022777	CCG	2	6	7062	7067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_022777	CTT	2	6	7480	7485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022777	CTC	2	6	7514	7519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022777	GGT	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022777	GCT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022777	GTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022777	TGT	2	6	7808	7813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022777	GAG	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022777	TCC	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_022777	AGT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022777	CTA	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022777	TCC	2	6	8522	8527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_022777	GCT	2	6	8815	8820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022777	TAC	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022777	TTA	2	6	8881	8886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022777	AGG	2	6	9004	9009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022777	ATG	2	6	9339	9344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022777	TCC	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_022777	CTG	2	6	9411	9416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022777	CTA	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022777	GAC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022777	CAC	2	6	9492	9497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022777	TTC	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022777	GCT	2	6	9603	9608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022777	CCT	2	6	9706	9711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_022777	TCC	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_022777	GCT	2	6	10020	10025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022777	ACA	2	6	10078	10083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022777	TCA	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022777	TGC	2	6	10124	10129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022777	CTG	2	6	10163	10168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022777	TCG	2	6	10238	10243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022777	TCC	2	6	10356	10361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_022777	CCG	2	6	10417	10422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_022777	CGC	2	6	10475	10480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_022777	GTT	2	6	10720	10725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022777	GAC	2	6	10745	10750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022777	TTC	2	6	10773	10778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022777	TAT	2	6	10799	10804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022777	GTT	3	9	10878	10886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022777	ATT	3	9	10940	10948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022777	ATT	2	6	11697	11702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022777	ATC	2	6	11765	11770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022777	TGT	2	6	11982	11987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022777	TAT	2	6	11994	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022777	ATT	2	6	12025	12030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022777	TCC	2	6	12245	12250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_022777	CTT	2	6	12450	12455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022777	TAA	2	6	12466	12471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022777	TAT	2	6	12472	12477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022777	CCT	2	6	12715	12720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_022777	TTA	2	6	13588	13593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022777	ATT	2	6	13661	13666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022777	ATT	2	6	13738	13743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022777	GGA	2	6	13858	13863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022777	AAT	2	6	15128	15133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022777	TTA	2	6	16492	16497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022777	TAA	2	6	17924	17929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022777	ATT	2	6	18024	18029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022777	TAT	2	6	18043	18048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022777	ATA	2	6	18056	18061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022777	ATA	2	6	18074	18079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022777	CCT	2	6	20498	20503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_022777	TAT	2	6	20644	20649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022777	TAT	2	6	21777	21782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022777	CTC	2	6	22778	22783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022777	TTA	2	6	22785	22790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022777	TAT	2	6	22799	22804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022777	TTA	2	6	24740	24745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022777	TAT	2	6	24792	24797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022777	TCA	2	6	24807	24812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022777	GCT	2	6	24923	24928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022777	AAT	2	6	25210	25215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022777	TTA	2	6	25225	25230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022777	TAC	2	6	25246	25251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022777	TCC	2	6	25539	25544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022777	TGG	2	6	25553	25558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022777	AAT	2	6	25565	25570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022777	ATT	2	6	25589	25594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022777	ATT	2	6	25676	25681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022777	AAT	2	6	25686	25691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022777	TAA	2	6	25698	25703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022777	TTG	2	6	25713	25718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022777	TGT	2	6	26358	26363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022777	GTT	2	6	26452	26457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022777	ACC	3	9	26478	26486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022777	ATT	2	6	27061	27066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022777	ATA	2	6	27168	27173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022777	TAT	2	6	27192	27197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022777	TAA	2	6	27230	27235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022777	TAT	2	6	27254	27259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022777	TAA	2	6	27297	27302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022777	AGG	2	6	28062	28067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022777	AAG	3	9	28806	28814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022777	TGG	2	6	28828	28833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022777	TAA	2	6	28958	28963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022777	TGA	2	6	29464	29469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022777	CCT	2	6	30877	30882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022777	TAT	2	6	31011	31016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022777	CTA	2	6	31098	31103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022777	TAT	2	6	31138	31143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022777	TAA	2	6	35310	35315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022777	ATA	2	6	36885	36890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022777	TAT	2	6	36953	36958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022777	TAT	2	6	36971	36976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022777	ATT	3	9	36999	37007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022777	TCT	2	6	37024	37029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022777	ATC	2	6	37032	37037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022777	ACC	2	6	38003	38008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_022777	TAA	2	6	38010	38015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022777	ATA	3	9	38030	38038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022777	ATT	2	6	38553	38558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022777	CCT	2	6	38559	38564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_022777	AAT	2	6	39082	39087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022777	AAT	2	6	39090	39095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022777	TGG	2	6	39126	39131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022777	TGG	2	6	39207	39212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022777	AAT	2	6	39485	39490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022777	AAT	2	6	39513	39518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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