MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium tetani 12124569 main chromosome

Total Repeats: 39238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022777	AAT	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
2	NC_022777	TAA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
3	NC_022777	CTT	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
4	NC_022777	CTT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
5	NC_022777	TCT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
6	NC_022777	TCA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
7	NC_022777	ATA	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
8	NC_022777	CTT	2	6	554	559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
9	NC_022777	ATT	3	9	721	729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
10	NC_022777	TCT	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
11	NC_022777	TCT	2	6	864	869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
12	NC_022777	TCA	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
13	NC_022777	TTA	2	6	977	982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
14	NC_022777	AAT	2	6	1000	1005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
15	NC_022777	TCT	2	6	1107	1112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
16	NC_022777	TAA	2	6	1185	1190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
17	NC_022777	CTT	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
18	NC_022777	ATC	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
19	NC_022777	TCT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
20	NC_022777	TTC	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
21	NC_022777	GCT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557604011
22	NC_022777	CTT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
23	NC_022777	CTA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
24	NC_022777	CCT	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
25	NC_022777	TAT	2	6	1601	1606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
26	NC_022777	CTC	2	6	1638	1643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
27	NC_022777	TCT	2	6	1662	1667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
28	NC_022777	TTC	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
29	NC_022777	CTC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
30	NC_022777	GCA	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604011
31	NC_022777	CTC	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
32	NC_022777	CTA	2	6	1868	1873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
33	NC_022777	TAA	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
34	NC_022777	TAT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
35	NC_022777	ATT	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
36	NC_022777	TCT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
37	NC_022777	ACA	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557604011
38	NC_022777	ATC	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
39	NC_022777	ATT	2	6	2328	2333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
40	NC_022777	TAA	2	6	2388	2393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
41	NC_022777	TCT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
42	NC_022777	ATT	2	6	2452	2457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
43	NC_022777	TAG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604011
44	NC_022777	TTC	2	6	2805	2810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604012
45	NC_022777	TAA	2	6	2824	2829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
46	NC_022777	TAA	3	9	2887	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
47	NC_022777	ACC	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557604012
48	NC_022777	GAT	2	6	3021	3026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604012
49	NC_022777	AAT	2	6	3087	3092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
50	NC_022777	CAT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
51	NC_022777	ATA	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
52	NC_022777	AAT	2	6	3591	3596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
53	NC_022777	TAA	2	6	3607	3612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
54	NC_022777	TCA	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
55	NC_022777	TAT	2	6	3791	3796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604012
56	NC_022777	ATT	2	6	3966	3971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604012
57	NC_022777	CTA	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
58	NC_022777	GAA	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604012
59	NC_022777	AGA	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604012
60	NC_022777	GTT	2	6	4187	4192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557604012
61	NC_022777	TTC	2	6	4193	4198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604012
62	NC_022777	AGA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
63	NC_022777	AGC	2	6	4401	4406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604013
64	NC_022777	GAA	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
65	NC_022777	CCT	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604013
66	NC_022777	ATT	2	6	4612	4617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604013
67	NC_022777	CTA	2	6	4664	4669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604013
68	NC_022777	ATC	2	6	4733	4738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604013
69	NC_022777	AGA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
70	NC_022777	ATT	2	6	4868	4873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
71	NC_022777	TTA	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
72	NC_022777	TCA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604014
73	NC_022777	TCC	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604014
74	NC_022777	CTA	2	6	4937	4942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604014
75	NC_022777	TCT	2	6	4951	4956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
76	NC_022777	TTC	2	6	4980	4985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
77	NC_022777	TCT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
78	NC_022777	CTT	3	9	5060	5068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
79	NC_022777	TCT	2	6	5110	5115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
80	NC_022777	TAT	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
81	NC_022777	TTG	2	6	5148	5153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557604014
82	NC_022777	TCT	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
83	NC_022777	TAT	2	6	5178	5183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
84	NC_022777	TTC	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
85	NC_022777	TGA	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604014
86	NC_022777	CAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557604014
87	NC_022777	TAT	2	6	11077	11082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604015
88	NC_022777	AAT	2	6	11083	11088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604015
89	NC_022777	ATA	2	6	11103	11108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604015
90	NC_022777	TAA	2	6	11226	11231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604015
91	NC_022777	ATA	2	6	11250	11255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604015
92	NC_022777	GAT	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604015
93	NC_022777	ACT	2	6	11453	11458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604015
94	NC_022777	ATT	2	6	11476	11481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604015
95	NC_022777	CTG	2	6	11508	11513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557604015
96	NC_022777	TTC	3	9	11634	11642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604015
97	NC_022777	CAT	2	6	12171	12176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604016
98	NC_022777	CAT	2	6	12214	12219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604016
99	NC_022777	CTA	2	6	12409	12414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604017
100	NC_022777	ATT	2	6	12688	12693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604018
101	NC_022777	CAT	2	6	12840	12845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604019
102	NC_022777	TAC	2	6	12861	12866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604019
103	NC_022777	TAT	2	6	12887	12892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604019
104	NC_022777	TCT	2	6	12934	12939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604019
105	NC_022777	ATT	2	6	12975	12980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604019
106	NC_022777	ATA	2	6	13004	13009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604019
107	NC_022777	ATT	2	6	13059	13064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604019
108	NC_022777	TAA	2	6	13095	13100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604019
109	NC_022777	TGA	2	6	13119	13124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604019
110	NC_022777	ATT	2	6	13171	13176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604019
111	NC_022777	ATT	2	6	13296	13301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604019
112	NC_022777	CTA	2	6	13313	13318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604019
113	NC_022777	TCT	2	6	13396	13401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604019
114	NC_022777	ATA	2	6	13440	13445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604019
115	NC_022777	ATA	2	6	13496	13501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604019
116	NC_022777	ATT	2	6	13982	13987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604020
117	NC_022777	ATT	2	6	14013	14018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604020
118	NC_022777	CTT	2	6	14040	14045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604020
119	NC_022777	TAT	2	6	14068	14073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604020
120	NC_022777	TAA	2	6	14088	14093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604020
121	NC_022777	ATT	2	6	14131	14136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604020
122	NC_022777	TAG	2	6	14250	14255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604020
123	NC_022777	ATC	2	6	14383	14388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604020
124	NC_022777	GCA	2	6	14438	14443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604020
125	NC_022777	TAT	2	6	14461	14466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604020
126	NC_022777	CTA	2	6	14517	14522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604020
127	NC_022777	TAC	2	6	14527	14532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604020
128	NC_022777	TAT	2	6	14535	14540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604020
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130	NC_022777	TAG	2	6	14577	14582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604020
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