MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022760	TAAAA	2	10	1655	1664	80 %	20 %	0 %	0 %	557237422
2	NC_022760	CCAAA	2	10	4116	4125	60 %	0 %	0 %	40 %	557237425
3	NC_022760	TAAAC	2	10	5470	5479	60 %	20 %	0 %	20 %	557237427
4	NC_022760	GGGTC	2	10	10214	10223	0 %	20 %	60 %	20 %	557237430
5	NC_022760	CCCGG	2	10	10247	10256	0 %	0 %	40 %	60 %	557237430
6	NC_022760	ATACA	2	10	19228	19237	60 %	20 %	0 %	20 %	557237433
7	NC_022760	GAGCT	2	10	20393	20402	20 %	20 %	40 %	20 %	557237433
8	NC_022760	TCCAA	2	10	23419	23428	40 %	20 %	0 %	40 %	557237435
9	NC_022760	CTAAG	2	10	27243	27252	40 %	20 %	20 %	20 %	557237437
10	NC_022760	AGCAA	2	10	34528	34537	60 %	0 %	20 %	20 %	557238159
11	NC_022760	GCTGC	2	10	39873	39882	0 %	20 %	40 %	40 %	557237447
12	NC_022760	GGCAA	2	10	39977	39986	40 %	0 %	40 %	20 %	557237447
13	NC_022760	GCTTT	2	10	41039	41048	0 %	60 %	20 %	20 %	557237448
14	NC_022760	CAAGC	2	10	44838	44847	40 %	0 %	20 %	40 %	557237452
15	NC_022760	AAGGT	2	10	45291	45300	40 %	20 %	40 %	0 %	557237452
16	NC_022760	CAGCC	2	10	45954	45963	20 %	0 %	20 %	60 %	557238160
17	NC_022760	AGCTC	2	10	52446	52455	20 %	20 %	20 %	40 %	557237456
18	NC_022760	CAGCT	2	10	53318	53327	20 %	20 %	20 %	40 %	557237456
19	NC_022760	ATCGT	2	10	54012	54021	20 %	40 %	20 %	20 %	557237456
20	NC_022760	GTGAG	2	10	62870	62879	20 %	20 %	60 %	0 %	557237459
21	NC_022760	TGCTG	2	10	76833	76842	0 %	40 %	40 %	20 %	557237463
22	NC_022760	TAGTA	2	10	79831	79840	40 %	40 %	20 %	0 %	557237467
23	NC_022760	TGCCT	2	10	91390	91399	0 %	40 %	20 %	40 %	557237473
24	NC_022760	GTGTA	2	10	96620	96629	20 %	40 %	40 %	0 %	557237477
25	NC_022760	ACGTG	2	10	102336	102345	20 %	20 %	40 %	20 %	557237480
26	NC_022760	CCCTT	2	10	102879	102888	0 %	40 %	0 %	60 %	557237480
27	NC_022760	GCGCT	2	10	103922	103931	0 %	20 %	40 %	40 %	557237480
28	NC_022760	GTGCT	2	10	105807	105816	0 %	40 %	40 %	20 %	557237481
29	NC_022760	GGTGC	2	10	106265	106274	0 %	20 %	60 %	20 %	557237482
30	NC_022760	GGGCA	2	10	108194	108203	20 %	0 %	60 %	20 %	557237482
31	NC_022760	GAATA	2	10	108552	108561	60 %	20 %	20 %	0 %	557237482
32	NC_022760	CAGTG	2	10	111968	111977	20 %	20 %	40 %	20 %	557237484
33	NC_022760	GCAGT	2	10	121665	121674	20 %	20 %	40 %	20 %	557237489
34	NC_022760	GGGCG	2	10	126917	126926	0 %	0 %	80 %	20 %	557237492
35	NC_022760	TGCCC	2	10	127824	127833	0 %	20 %	20 %	60 %	557237493
36	NC_022760	GCTTC	2	10	130625	130634	0 %	40 %	20 %	40 %	557237495
37	NC_022760	CATAA	2	10	133673	133682	60 %	20 %	0 %	20 %	557237498
38	NC_022760	TTTCT	2	10	138402	138411	0 %	80 %	0 %	20 %	557237501
39	NC_022760	GAGCT	2	10	141941	141950	20 %	20 %	40 %	20 %	557237507
40	NC_022760	CAGGG	2	10	146728	146737	20 %	0 %	60 %	20 %	557237510
41	NC_022760	CCCTA	2	10	148544	148553	20 %	20 %	0 %	60 %	557237511
42	NC_022760	GCCAC	2	10	150370	150379	20 %	0 %	20 %	60 %	557237514
43	NC_022760	CGCTA	2	10	152465	152474	20 %	20 %	20 %	40 %	557237516
44	NC_022760	CTACC	2	10	156877	156886	20 %	20 %	0 %	60 %	557237518
45	NC_022760	CGTGT	2	10	167192	167201	0 %	40 %	40 %	20 %	557237525
46	NC_022760	CTATC	2	10	168614	168623	20 %	40 %	0 %	40 %	557237527
47	NC_022760	GTGGC	2	10	170938	170947	0 %	20 %	60 %	20 %	557237528
48	NC_022760	CTTGC	2	10	172213	172222	0 %	40 %	20 %	40 %	557237529
49	NC_022760	AGCCA	2	10	173311	173320	40 %	0 %	20 %	40 %	557237530
50	NC_022760	GAAGA	2	10	180199	180208	60 %	0 %	40 %	0 %	557237533
51	NC_022760	CACAC	2	10	181351	181360	40 %	0 %	0 %	60 %	557237533
52	NC_022760	GCCAT	2	10	181628	181637	20 %	20 %	20 %	40 %	557237533
53	NC_022760	GCGGT	2	10	181736	181745	0 %	20 %	60 %	20 %	557237533
54	NC_022760	TTGTG	2	10	183626	183635	0 %	60 %	40 %	0 %	557237534
55	NC_022760	AAAAG	2	10	185692	185701	80 %	0 %	20 %	0 %	557237536
56	NC_022760	CGATG	2	10	185834	185843	20 %	20 %	40 %	20 %	557237537
57	NC_022760	GGGCG	2	10	189716	189725	0 %	0 %	80 %	20 %	557237539
58	NC_022760	GACAC	2	10	192646	192655	40 %	0 %	20 %	40 %	557237542
59	NC_022760	ACTTC	2	10	192971	192980	20 %	40 %	0 %	40 %	557237542
60	NC_022760	ATGCT	2	10	194223	194232	20 %	40 %	20 %	20 %	557237544
61	NC_022760	TTCTG	2	10	199883	199892	0 %	60 %	20 %	20 %	557237549
62	NC_022760	CTTCC	2	10	199924	199933	0 %	40 %	0 %	60 %	557237549
63	NC_022760	AAGCG	2	10	201168	201177	40 %	0 %	40 %	20 %	557237550
64	NC_022760	AGGGA	2	10	202380	202389	40 %	0 %	60 %	0 %	557237551
65	NC_022760	CATGT	2	10	203101	203110	20 %	40 %	20 %	20 %	557237551
66	NC_022760	GAGTG	2	10	205869	205878	20 %	20 %	60 %	0 %	557237553
67	NC_022760	CAGAA	2	10	209842	209851	60 %	0 %	20 %	20 %	557237558
68	NC_022760	AGGTG	2	10	209853	209862	20 %	20 %	60 %	0 %	557237558
69	NC_022760	AAAAT	2	10	211310	211319	80 %	20 %	0 %	0 %	557237558
70	NC_022760	CAGTA	2	10	211735	211744	40 %	20 %	20 %	20 %	557237558
71	NC_022760	TAATG	2	10	211788	211797	40 %	40 %	20 %	0 %	557237558
72	NC_022760	CGGTG	2	10	218286	218295	0 %	20 %	60 %	20 %	557237566
73	NC_022760	TGAAA	2	10	220862	220871	60 %	20 %	20 %	0 %	557237567
74	NC_022760	CGTCC	2	10	221735	221744	0 %	20 %	20 %	60 %	557237567
75	NC_022760	GGAAG	2	10	222350	222359	40 %	0 %	60 %	0 %	557237567
76	NC_022760	GAAGG	2	10	222801	222810	40 %	0 %	60 %	0 %	557237567
77	NC_022760	TTTCT	2	10	235197	235206	0 %	80 %	0 %	20 %	557237571
78	NC_022760	TCACC	2	10	238388	238397	20 %	20 %	0 %	60 %	557237574
79	NC_022760	GCGCA	2	10	241629	241638	20 %	0 %	40 %	40 %	557237577
80	NC_022760	GCGCA	2	10	242184	242193	20 %	0 %	40 %	40 %	557237577
81	NC_022760	GCTGG	2	10	249817	249826	0 %	20 %	60 %	20 %	557237580
82	NC_022760	GCTCT	2	10	254996	255005	0 %	40 %	20 %	40 %	557237583
83	NC_022760	GGGTA	2	10	257428	257437	20 %	20 %	60 %	0 %	557237586
84	NC_022760	GAACA	2	10	257725	257734	60 %	0 %	20 %	20 %	557237586
85	NC_022760	GGGGA	2	10	262061	262070	20 %	0 %	80 %	0 %	557237590
86	NC_022760	ACTAT	2	10	268766	268775	40 %	40 %	0 %	20 %	557237595
87	NC_022760	TTGCG	2	10	272652	272661	0 %	40 %	40 %	20 %	557237597
88	NC_022760	ACTTC	2	10	277105	277114	20 %	40 %	0 %	40 %	557237599
89	NC_022760	CTTGC	2	10	277524	277533	0 %	40 %	20 %	40 %	557237599
90	NC_022760	CTTTT	2	10	279826	279835	0 %	80 %	0 %	20 %	557237601
91	NC_022760	GGAAC	2	10	279888	279897	40 %	0 %	40 %	20 %	557237601
92	NC_022760	AAGCC	2	10	283618	283627	40 %	0 %	20 %	40 %	557237605
93	NC_022760	TAATA	2	10	284433	284442	60 %	40 %	0 %	0 %	557237605
94	NC_022760	CTGTT	2	10	294182	294191	0 %	60 %	20 %	20 %	557237610
95	NC_022760	ACTGC	2	10	295076	295085	20 %	20 %	20 %	40 %	557237610
96	NC_022760	TGCGG	2	10	295274	295283	0 %	20 %	60 %	20 %	557237610
97	NC_022760	TGCGA	2	10	297401	297410	20 %	20 %	40 %	20 %	557237611
98	NC_022760	GGCCT	2	10	301494	301503	0 %	20 %	40 %	40 %	557237613
99	NC_022760	CCAAG	2	10	301801	301810	40 %	0 %	20 %	40 %	557237613
100	NC_022760	GTGCT	2	10	302222	302231	0 %	40 %	40 %	20 %	557237613
101	NC_022760	CTGCC	2	10	303777	303786	0 %	20 %	20 %	60 %	557237613
102	NC_022760	TTTGC	2	10	304689	304698	0 %	60 %	20 %	20 %	557237613
103	NC_022760	TAAGA	2	10	325699	325708	60 %	20 %	20 %	0 %	557237617
104	NC_022760	AATAG	2	10	332089	332098	60 %	20 %	20 %	0 %	557237619
105	NC_022760	GTAGA	2	10	333265	333274	40 %	20 %	40 %	0 %	557237620
106	NC_022760	CTCAC	2	10	334349	334358	20 %	20 %	0 %	60 %	557237621
107	NC_022760	TGCCG	2	10	334939	334948	0 %	20 %	40 %	40 %	557237621
108	NC_022760	TGTTC	2	10	335116	335125	0 %	60 %	20 %	20 %	557237621
109	NC_022760	ATCCC	2	10	338405	338414	20 %	20 %	0 %	60 %	557237622
110	NC_022760	TATCC	2	10	348255	348264	20 %	40 %	0 %	40 %	557237623
111	NC_022760	CAACA	2	10	349430	349439	60 %	0 %	0 %	40 %	557237625
112	NC_022760	GTGAT	2	10	350855	350864	20 %	40 %	40 %	0 %	557237626
113	NC_022760	GAAGC	2	10	353545	353554	40 %	0 %	40 %	20 %	557238214
114	NC_022760	TTACT	2	10	356323	356332	20 %	60 %	0 %	20 %	557237631
115	NC_022760	TGCAT	2	10	359939	359948	20 %	40 %	20 %	20 %	557237632
116	NC_022760	CGTAT	2	10	361216	361225	20 %	40 %	20 %	20 %	557237633
117	NC_022760	GCTGC	2	10	361605	361614	0 %	20 %	40 %	40 %	557237633
118	NC_022760	GGGCT	2	10	366910	366919	0 %	20 %	60 %	20 %	557237635
119	NC_022760	TGCTG	2	10	368577	368586	0 %	40 %	40 %	20 %	557237637
120	NC_022760	GTTTT	2	10	368895	368904	0 %	80 %	20 %	0 %	557237637
121	NC_022760	AGAGC	2	10	371985	371994	40 %	0 %	40 %	20 %	557237640
122	NC_022760	TAGCG	2	10	376318	376327	20 %	20 %	40 %	20 %	557237642
123	NC_022760	GGAAG	2	10	380953	380962	40 %	0 %	60 %	0 %	557238173
124	NC_022760	AATAA	2	10	381422	381431	80 %	20 %	0 %	0 %	557238173
125	NC_022760	TGGCG	2	10	381767	381776	0 %	20 %	60 %	20 %	557238173
126	NC_022760	CCGAA	2	10	385222	385231	40 %	0 %	20 %	40 %	557237645
127	NC_022760	GCCGT	2	10	387863	387872	0 %	20 %	40 %	40 %	557237647
128	NC_022760	CAAAA	2	10	388162	388171	80 %	0 %	0 %	20 %	557237647
129	NC_022760	ACATC	2	10	391716	391725	40 %	20 %	0 %	40 %	557237648
130	NC_022760	TGCTC	2	10	391890	391899	0 %	40 %	20 %	40 %	557237648
131	NC_022760	AATGC	2	10	393145	393154	40 %	20 %	20 %	20 %	557237649
132	NC_022760	GTGGA	2	10	403795	403804	20 %	20 %	60 %	0 %	557237656
133	NC_022760	TTTAC	2	10	403820	403829	20 %	60 %	0 %	20 %	557237656
134	NC_022760	TATGT	2	10	404492	404501	20 %	60 %	20 %	0 %	557237656
135	NC_022760	GCGCA	2	10	404649	404658	20 %	0 %	40 %	40 %	557237656
136	NC_022760	CCCAT	2	10	407338	407347	20 %	20 %	0 %	60 %	557237660
137	NC_022760	GTCTG	2	10	411307	411316	0 %	40 %	40 %	20 %	557237664
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141	NC_022760	CCACC	2	10	416043	416052	20 %	0 %	0 %	80 %	557237666
142	NC_022760	GCCGG	2	10	417663	417672	0 %	0 %	60 %	40 %	557237668
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148	NC_022760	TTGGT	2	10	430851	430860	0 %	60 %	40 %	0 %	557237674
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151	NC_022760	AGTGC	2	10	435974	435983	20 %	20 %	40 %	20 %	557237676
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155	NC_022760	GGGAG	2	10	443476	443485	20 %	0 %	80 %	0 %	557237683
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391	NC_022760	AGCCT	2	10	1120723	1120732	20 %	20 %	20 %	40 %	557238097
392	NC_022760	TCCTT	2	10	1121444	1121453	0 %	60 %	0 %	40 %	557238098
393	NC_022760	AGGTA	2	10	1123893	1123902	40 %	20 %	40 %	0 %	557238102
394	NC_022760	CGGTA	2	10	1124974	1124983	20 %	20 %	40 %	20 %	557238103
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396	NC_022760	CGGGT	2	10	1127534	1127543	0 %	20 %	60 %	20 %	557238106
397	NC_022760	CAGTG	2	10	1129559	1129568	20 %	20 %	40 %	20 %	557238109
398	NC_022760	TATGG	2	10	1131406	1131415	20 %	40 %	40 %	0 %	557238111
399	NC_022760	TGGGA	2	10	1140203	1140212	20 %	20 %	60 %	0 %	557238118
400	NC_022760	TAGTG	2	10	1142184	1142193	20 %	40 %	40 %	0 %	557238120
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403	NC_022760	GCCAT	2	10	1146233	1146242	20 %	20 %	20 %	40 %	557238122
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413	NC_022760	CATCG	2	10	1170558	1170567	20 %	20 %	20 %	40 %	557238140
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419	NC_022760	ACCGC	2	10	1187462	1187471	20 %	0 %	20 %	60 %	557238149
420	NC_022760	GTTGC	2	10	1191002	1191011	0 %	40 %	40 %	20 %	557238153
421	NC_022760	GCACA	2	10	1192102	1192111	40 %	0 %	20 %	40 %	557238153

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.