MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022760	GGACC	2	10	926047	926056	20 %	0 %	40 %	40 %	557237976
502	NC_022760	CAAGG	2	10	927813	927822	40 %	0 %	40 %	20 %	557237978
503	NC_022760	ATTGC	2	10	937179	937188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
504	NC_022760	CACTC	2	10	938396	938405	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
505	NC_022760	CATGC	2	10	939822	939831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
506	NC_022760	TGCAG	2	10	939899	939908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
507	NC_022760	AACTT	2	10	941021	941030	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
508	NC_022760	AACTT	2	10	941468	941477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
509	NC_022760	TCTAT	2	10	941945	941954	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
510	NC_022760	TTTCG	2	10	948481	948490	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
511	NC_022760	TGTTC	2	10	948821	948830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
512	NC_022760	CGCAG	2	10	951120	951129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
513	NC_022760	AGGCA	2	10	951784	951793	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
514	NC_022760	CTTTG	2	10	954731	954740	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
515	NC_022760	CGTTG	2	10	955720	955729	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
516	NC_022760	TGCCT	2	10	957464	957473	0 %	40 %	20 %	40 %	557237985
517	NC_022760	AATGC	2	10	958711	958720	40 %	20 %	20 %	20 %	557237985
518	NC_022760	CTCTT	2	10	958945	958954	0 %	60 %	0 %	40 %	557237985
519	NC_022760	ATTAC	2	10	961166	961175	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
520	NC_022760	AGCAA	2	10	964502	964511	60 %	0 %	20 %	20 %	557237989
521	NC_022760	GGCTG	2	10	966368	966377	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
522	NC_022760	GTAGC	2	10	968327	968336	20 %	20 %	40 %	20 %	557237991
523	NC_022760	AGATC	2	10	968558	968567	40 %	20 %	20 %	20 %	557237991
524	NC_022760	CAGGG	2	10	971381	971390	20 %	0 %	60 %	20 %	557237994
525	NC_022760	TATAA	2	10	971780	971789	60 %	40 %	0 %	0 %	557237994
526	NC_022760	GCCGC	2	10	973373	973382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
527	NC_022760	CACAA	2	10	973495	973504	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
528	NC_022760	CAGCG	2	10	973678	973687	20 %	0 %	40 %	40 %	557237997
529	NC_022760	AGCGA	2	10	974952	974961	40 %	0 %	40 %	20 %	557237999
530	NC_022760	AGTTG	2	10	975951	975960	20 %	40 %	40 %	0 %	557238000
531	NC_022760	TGCAT	2	10	976108	976117	20 %	40 %	20 %	20 %	557238000
532	NC_022760	GTAGC	2	10	980202	980211	20 %	20 %	40 %	20 %	557238002
533	NC_022760	TTGCA	2	10	981178	981187	20 %	40 %	20 %	20 %	557238003
534	NC_022760	GACAA	2	10	992395	992404	60 %	0 %	20 %	20 %	557238011
535	NC_022760	GAGCT	2	10	993091	993100	20 %	20 %	40 %	20 %	557238012
536	NC_022760	GCACT	2	10	995440	995449	20 %	20 %	20 %	40 %	557238014
537	NC_022760	ACCCT	2	10	995571	995580	20 %	20 %	0 %	60 %	557238014
538	NC_022760	GCACG	2	10	996092	996101	20 %	0 %	40 %	40 %	557238014
539	NC_022760	AAACA	2	10	996433	996442	80 %	0 %	0 %	20 %	557238014
540	NC_022760	GCATG	2	10	996685	996694	20 %	20 %	40 %	20 %	557238014
541	NC_022760	CAACG	2	10	996826	996835	40 %	0 %	20 %	40 %	557238015
542	NC_022760	TGGGC	2	10	997611	997620	0 %	20 %	60 %	20 %	557238015
543	NC_022760	AGCGC	2	10	997832	997841	20 %	0 %	40 %	40 %	557238015
544	NC_022760	GCAAG	2	10	999117	999126	40 %	0 %	40 %	20 %	557238016
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547	NC_022760	GGTAG	2	10	1004704	1004713	20 %	20 %	60 %	0 %	557238021
548	NC_022760	ACCCC	2	10	1007695	1007704	20 %	0 %	0 %	80 %	557238024
549	NC_022760	CAACA	2	10	1007822	1007831	60 %	0 %	0 %	40 %	557238024
550	NC_022760	TAACA	2	10	1011222	1011231	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
551	NC_022760	GGCGC	2	10	1013484	1013493	0 %	0 %	60 %	40 %	557238027
552	NC_022760	AGCGC	2	10	1014647	1014656	20 %	0 %	40 %	40 %	557238027
553	NC_022760	TCCTT	2	10	1014821	1014830	0 %	60 %	0 %	40 %	557238027
554	NC_022760	AGAAA	2	10	1015290	1015299	80 %	0 %	20 %	0 %	557238027
555	NC_022760	GGGCC	2	10	1019029	1019038	0 %	0 %	60 %	40 %	557238030
556	NC_022760	GTGCT	2	10	1019101	1019110	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
557	NC_022760	TCCCC	2	10	1019184	1019193	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
558	NC_022760	CTGCT	2	10	1020935	1020944	0 %	40 %	20 %	40 %	557238032
559	NC_022760	GGAAG	2	10	1022415	1022424	40 %	0 %	60 %	0 %	557238033
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561	NC_022760	GGCAT	2	10	1027624	1027633	20 %	20 %	40 %	20 %	557238037
562	NC_022760	ATTGC	2	10	1027808	1027817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
563	NC_022760	GTACA	2	10	1028087	1028096	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
564	NC_022760	GGACT	2	10	1028906	1028915	20 %	20 %	40 %	20 %	557238038
565	NC_022760	AGCAA	2	10	1035650	1035659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
566	NC_022760	TGTGC	2	10	1040640	1040649	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
567	NC_022760	TAAAA	2	10	1040763	1040772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022760	GCAGT	2	10	1047325	1047334	20 %	20 %	40 %	20 %	557238046
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575	NC_022760	CTTTG	2	10	1054479	1054488	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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578	NC_022760	TGTGA	2	10	1062878	1062887	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022760	TATAC	2	10	1069832	1069841	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
580	NC_022760	GCATT	2	10	1074554	1074563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
581	NC_022760	ACATC	2	10	1077696	1077705	40 %	20 %	0 %	40 %	557238068
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585	NC_022760	ATAGA	2	10	1082272	1082281	60 %	20 %	20 %	0 %	557238072
586	NC_022760	AACAT	2	10	1083886	1083895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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588	NC_022760	CTGTC	2	10	1089586	1089595	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
589	NC_022760	CTGTC	2	10	1090855	1090864	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
590	NC_022760	GGTCA	2	10	1095938	1095947	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
591	NC_022760	TTTGG	2	10	1096049	1096058	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022760	GTATA	2	10	1096517	1096526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_022760	TGCAA	2	10	1100980	1100989	40 %	20 %	20 %	20 %	557238080
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600	NC_022760	TATGG	2	10	1111625	1111634	20 %	40 %	40 %	0 %	557238092
601	NC_022760	ATTGC	2	10	1112515	1112524	20 %	40 %	20 %	20 %	557238092
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603	NC_022760	CAGCC	2	10	1116033	1116042	20 %	0 %	20 %	60 %	557238094
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611	NC_022760	CGGGT	2	10	1127534	1127543	0 %	20 %	60 %	20 %	557238106
612	NC_022760	CAGTG	2	10	1129559	1129568	20 %	20 %	40 %	20 %	557238109
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614	NC_022760	AAACT	2	10	1136466	1136475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
615	NC_022760	AACCA	2	10	1137176	1137185	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
616	NC_022760	TGGGA	2	10	1140203	1140212	20 %	20 %	60 %	0 %	557238118
617	NC_022760	AGGAA	2	10	1140575	1140584	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_022760	GTTGT	2	10	1152942	1152951	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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625	NC_022760	CTGAT	2	10	1154575	1154584	20 %	40 %	20 %	20 %	557238129
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627	NC_022760	GGTAG	2	10	1159009	1159018	20 %	20 %	60 %	0 %	557238131
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631	NC_022760	TTTCC	2	10	1164946	1164955	0 %	60 %	0 %	40 %	557238136
632	NC_022760	AGCGC	2	10	1164983	1164992	20 %	0 %	40 %	40 %	557238136
633	NC_022760	ATACA	2	10	1165741	1165750	60 %	20 %	0 %	20 %	557238137
634	NC_022760	CTTGT	2	10	1167320	1167329	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
635	NC_022760	AGGAG	2	10	1168261	1168270	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022760	GTGCC	2	10	1169745	1169754	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
637	NC_022760	CATCG	2	10	1170558	1170567	20 %	20 %	20 %	40 %	557238140
638	NC_022760	GGCAT	2	10	1172246	1172255	20 %	20 %	40 %	20 %	557238142
639	NC_022760	TAAGC	2	10	1175508	1175517	40 %	20 %	20 %	20 %	557238144
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642	NC_022760	ACCTA	2	10	1178795	1178804	40 %	20 %	0 %	40 %	557238146
643	NC_022760	ACCGC	2	10	1187462	1187471	20 %	0 %	20 %	60 %	557238149
644	NC_022760	GTTGC	2	10	1191002	1191011	0 %	40 %	40 %	20 %	557238153
645	NC_022760	GCACA	2	10	1192102	1192111	40 %	0 %	20 %	40 %	557238153
646	NC_022760	TCCCT	2	10	1195115	1195124	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

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