MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 1624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022760	AACC	2	8	1117638	1117645	50 %	0 %	0 %	50 %	557238095
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1503	NC_022760	CCAT	2	8	1119056	1119063	25 %	25 %	0 %	50 %	557238096
1504	NC_022760	TGCA	2	8	1119145	1119152	25 %	25 %	25 %	25 %	557238096
1505	NC_022760	GGCT	2	8	1119602	1119609	0 %	25 %	50 %	25 %	557238096
1506	NC_022760	TTTG	2	8	1120460	1120467	0 %	75 %	25 %	0 %	557238097
1507	NC_022760	GCTC	2	8	1120681	1120688	0 %	25 %	25 %	50 %	557238097
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1509	NC_022760	ATCA	2	8	1121030	1121037	50 %	25 %	0 %	25 %	557238097
1510	NC_022760	TTGG	2	8	1121281	1121288	0 %	50 %	50 %	0 %	557238098
1511	NC_022760	TTTC	2	8	1121559	1121566	0 %	75 %	0 %	25 %	557238098
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1516	NC_022760	ATAG	2	8	1124211	1124218	50 %	25 %	25 %	0 %	557238102
1517	NC_022760	GGGT	2	8	1126509	1126516	0 %	25 %	75 %	0 %	557238106
1518	NC_022760	AAGA	2	8	1126671	1126678	75 %	0 %	25 %	0 %	557238106
1519	NC_022760	CAAT	2	8	1127059	1127066	50 %	25 %	0 %	25 %	557238106
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1521	NC_022760	TGGT	2	8	1127715	1127722	0 %	50 %	50 %	0 %	557238106
1522	NC_022760	AGCA	2	8	1127828	1127835	50 %	0 %	25 %	25 %	557238106
1523	NC_022760	ATGG	2	8	1128101	1128108	25 %	25 %	50 %	0 %	557238107
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1530	NC_022760	CATC	2	8	1132329	1132336	25 %	25 %	0 %	50 %	557238112
1531	NC_022760	CTTT	2	8	1134642	1134649	0 %	75 %	0 %	25 %	557238114
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1534	NC_022760	TGAG	2	8	1135570	1135577	25 %	25 %	50 %	0 %	557238115
1535	NC_022760	GTAG	2	8	1135789	1135796	25 %	25 %	50 %	0 %	557238115
1536	NC_022760	AATA	2	8	1136092	1136099	75 %	25 %	0 %	0 %	557238115
1537	NC_022760	ACAT	2	8	1136106	1136113	50 %	25 %	0 %	25 %	557238115
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1542	NC_022760	CTCC	2	8	1139208	1139215	0 %	25 %	0 %	75 %	557238117
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1547	NC_022760	TAGG	2	8	1140133	1140140	25 %	25 %	50 %	0 %	557238118
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1561	NC_022760	CCTC	2	8	1150309	1150316	0 %	25 %	0 %	75 %	557238126
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1611	NC_022760	GGCA	2	8	1190203	1190210	25 %	0 %	50 %	25 %	557238153
1612	NC_022760	CCAT	2	8	1190234	1190241	25 %	25 %	0 %	50 %	557238153
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1621	NC_022760	TGGT	2	8	1194505	1194512	0 %	50 %	50 %	0 %	557238154
1622	NC_022760	GTAT	2	8	1195229	1195236	25 %	50 %	25 %	0 %	557238213
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.