MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 5121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022760	TCT	2	6	1168007	1168012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_022760	GTT	2	6	1168208	1168213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_022760	CTG	2	6	1168302	1168307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_022760	TGC	2	6	1168634	1168639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_022760	AGT	2	6	1168641	1168646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_022760	GTC	2	6	1168813	1168818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_022760	ATA	2	6	1168889	1168894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_022760	TGT	2	6	1168902	1168907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_022760	TCC	2	6	1168917	1168922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_022760	TGT	2	6	1168943	1168948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_022760	TGT	2	6	1169147	1169152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_022760	GCA	2	6	1169160	1169165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_022760	GCT	2	6	1169177	1169182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_022760	GCA	2	6	1169207	1169212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_022760	ATT	2	6	1169219	1169224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_022760	GCG	2	6	1169273	1169278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_022760	CTC	2	6	1169294	1169299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_022760	TGC	2	6	1169326	1169331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_022760	GTT	2	6	1169375	1169380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_022760	TTA	2	6	1169518	1169523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_022760	CTT	2	6	1169581	1169586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_022760	GCG	2	6	1169600	1169605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_022760	TTC	2	6	1169606	1169611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_022760	TGA	2	6	1169767	1169772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_022760	ATC	2	6	1169922	1169927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_022760	TCA	2	6	1170130	1170135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_022760	TAC	2	6	1170168	1170173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_022760	TTC	2	6	1170177	1170182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_022760	GGT	2	6	1170939	1170944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_022760	TTG	2	6	1173345	1173350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_022760	TCA	2	6	1173359	1173364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_022760	GCT	2	6	1176169	1176174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_022760	TTG	2	6	1176201	1176206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_022760	GCA	2	6	1176207	1176212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_022760	AGC	2	6	1177350	1177355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_022760	GTG	2	6	1177374	1177379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_022760	GCG	2	6	1178829	1178834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_022760	CCT	2	6	1178871	1178876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_022760	ATG	2	6	1180182	1180187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_022760	ATC	2	6	1180244	1180249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_022760	AGT	2	6	1180262	1180267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_022760	TAG	2	6	1180270	1180275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_022760	TAG	2	6	1180282	1180287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_022760	CAG	2	6	1180291	1180296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_022760	GGA	2	6	1180306	1180311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_022760	CCT	2	6	1180379	1180384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_022760	TGA	2	6	1180432	1180437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022760	GTG	2	6	1180513	1180518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_022760	ACC	2	6	1180720	1180725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_022760	TGT	2	6	1180729	1180734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_022760	CAC	2	6	1180759	1180764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_022760	TAC	2	6	1180788	1180793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_022760	ACA	2	6	1180825	1180830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_022760	AAG	2	6	1180929	1180934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_022760	TTA	2	6	1180962	1180967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_022760	GGT	2	6	1181084	1181089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_022760	TAC	2	6	1181274	1181279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_022760	GTG	2	6	1181383	1181388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_022760	TGT	2	6	1181397	1181402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_022760	TCA	2	6	1181449	1181454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_022760	TTA	2	6	1181464	1181469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_022760	TCT	2	6	1181492	1181497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_022760	CAG	2	6	1181498	1181503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_022760	GCA	2	6	1181518	1181523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_022760	AAT	2	6	1181555	1181560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_022760	TGC	2	6	1181604	1181609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_022760	CTT	2	6	1181616	1181621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_022760	CTT	2	6	1182819	1182824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_022760	GTC	2	6	1182825	1182830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_022760	CAC	2	6	1182846	1182851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_022760	CTC	2	6	1182864	1182869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_022760	TTC	2	6	1182888	1182893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_022760	TGT	2	6	1182949	1182954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_022760	TTC	2	6	1182966	1182971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_022760	TCA	2	6	1183003	1183008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_022760	ACT	2	6	1183108	1183113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_022760	CTT	2	6	1183116	1183121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_022760	TGG	2	6	1183701	1183706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_022760	TTA	2	6	1183716	1183721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_022760	CGT	2	6	1183722	1183727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_022760	CAG	2	6	1183903	1183908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_022760	GCC	2	6	1183910	1183915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_022760	CGC	2	6	1184694	1184699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_022760	GAC	2	6	1184707	1184712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_022760	CAT	2	6	1184729	1184734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_022760	GTG	2	6	1184800	1184805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_022760	CGC	2	6	1184885	1184890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_022760	AGT	2	6	1184981	1184986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_022760	CTC	2	6	1185054	1185059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_022760	TAA	2	6	1185068	1185073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_022760	CAC	2	6	1185155	1185160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_022760	GGC	2	6	1185223	1185228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_022760	ACA	2	6	1185353	1185358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_022760	GTC	2	6	1185441	1185446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_022760	CAA	2	6	1185461	1185466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_022760	CAA	2	6	1185489	1185494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_022760	GCT	2	6	1185581	1185586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_022760	CCA	2	6	1185628	1185633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_022760	TTC	2	6	1185683	1185688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_022760	TCC	2	6	1185702	1185707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_022760	CAC	2	6	1185772	1185777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_022760	GTT	2	6	1185893	1185898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_022760	ATT	2	6	1185912	1185917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_022760	GTC	2	6	1185924	1185929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_022760	TGT	2	6	1185934	1185939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_022760	AAT	2	6	1185947	1185952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_022760	ATG	2	6	1188438	1188443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_022760	ACA	2	6	1188445	1188450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_022760	CAG	2	6	1188473	1188478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_022760	CAT	2	6	1189058	1189063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_022760	TCA	2	6	1189064	1189069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_022760	GCC	2	6	1189078	1189083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_022760	AGG	2	6	1190137	1190142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_022760	CAA	2	6	1192967	1192972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_022760	ACC	2	6	1192980	1192985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_022760	AGA	2	6	1193028	1193033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_022760	ATT	2	6	1193159	1193164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_022760	GAA	2	6	1193369	1193374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_022760	CAC	2	6	1193429	1193434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_022760	GCC	2	6	1193478	1193483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_022760	CGC	2	6	1195161	1195166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.