MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 9438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022760	CAG	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
2	NC_022760	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237422
3	NC_022760	CGA	2	6	455	460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
4	NC_022760	CAT	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237422
5	NC_022760	AGG	2	6	840	845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237422
6	NC_022760	TGA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237422
7	NC_022760	AAC	2	6	973	978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237422
8	NC_022760	GCA	2	6	989	994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
9	NC_022760	GAC	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
10	NC_022760	CGG	2	6	1077	1082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237422
11	NC_022760	TTG	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237422
12	NC_022760	CGA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
13	NC_022760	TTG	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237422
14	NC_022760	GAA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237422
15	NC_022760	TGC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237422
16	NC_022760	AGA	2	6	1357	1362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237422
17	NC_022760	AGT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237422
18	NC_022760	TGC	2	6	1497	1502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237422
19	NC_022760	CTA	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237422
20	NC_022760	GCT	2	6	1611	1616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237422
21	NC_022760	ATA	2	6	1710	1715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237422
22	NC_022760	AGC	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
23	NC_022760	GCA	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
24	NC_022760	GAA	2	6	1910	1915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237422
25	NC_022760	TGC	2	6	2219	2224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237423
26	NC_022760	CGG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237423
27	NC_022760	GCC	2	6	2276	2281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237423
28	NC_022760	GCT	2	6	2285	2290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237423
29	NC_022760	TAG	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237423
30	NC_022760	ACA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237423
31	NC_022760	GCC	2	6	2435	2440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237423
32	NC_022760	TAT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237423
33	NC_022760	TGG	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237423
34	NC_022760	TGC	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237423
35	NC_022760	CAC	2	6	2617	2622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237423
36	NC_022760	CCG	2	6	2733	2738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237424
37	NC_022760	ACA	2	6	2860	2865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237424
38	NC_022760	TTG	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237424
39	NC_022760	AAT	2	6	2936	2941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237424
40	NC_022760	TCT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237424
41	NC_022760	TGC	2	6	2974	2979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237424
42	NC_022760	TTG	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237424
43	NC_022760	AGG	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237424
44	NC_022760	CTG	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
45	NC_022760	TCG	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
46	NC_022760	CTC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237425
47	NC_022760	CAC	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237425
48	NC_022760	GCG	2	6	3550	3555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237425
49	NC_022760	TTG	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237425
50	NC_022760	CTC	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237425
51	NC_022760	ATG	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237425
52	NC_022760	CTG	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
53	NC_022760	TGC	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
54	NC_022760	GCT	2	6	3999	4004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
55	NC_022760	CTT	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237425
56	NC_022760	GAG	2	6	4177	4182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237425
57	NC_022760	TCA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237425
58	NC_022760	GTC	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237426
59	NC_022760	GAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237426
60	NC_022760	AGG	2	6	4917	4922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557238156
61	NC_022760	GCG	2	6	4987	4992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557238156
62	NC_022760	GAA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557238156
63	NC_022760	ATG	2	6	5508	5513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237427
64	NC_022760	ACT	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
65	NC_022760	TTC	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237427
66	NC_022760	TTC	2	6	5615	5620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237427
67	NC_022760	TCA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
68	NC_022760	CTG	2	6	5740	5745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237427
69	NC_022760	GTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237427
70	NC_022760	TGT	2	6	5817	5822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237427
71	NC_022760	CAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237427
72	NC_022760	TCA	2	6	5934	5939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
73	NC_022760	TCA	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
74	NC_022760	GCT	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237427
75	NC_022760	CCA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237427
76	NC_022760	AAC	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237427
77	NC_022760	CAA	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237427
78	NC_022760	CAA	2	6	6122	6127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237427
79	NC_022760	TCA	2	6	6312	6317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
80	NC_022760	CGT	2	6	6388	6393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237427
81	NC_022760	TCG	2	6	6521	6526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237428
82	NC_022760	TCA	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237428
83	NC_022760	TAC	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237428
84	NC_022760	CGT	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237428
85	NC_022760	TAT	2	6	8768	8773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237429
86	NC_022760	CGC	2	6	8930	8935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237429
87	NC_022760	TGT	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237429
88	NC_022760	TCA	5	15	9042	9056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237429
89	NC_022760	TCT	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237429
90	NC_022760	GAA	2	6	9135	9140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237429
91	NC_022760	AAT	2	6	9169	9174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237429
92	NC_022760	TGC	2	6	9228	9233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237429
93	NC_022760	TCA	2	6	9240	9245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237429
94	NC_022760	GCC	2	6	9285	9290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237429
95	NC_022760	CAG	2	6	9405	9410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237429
96	NC_022760	ACC	2	6	9644	9649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237429
97	NC_022760	GCT	2	6	9868	9873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237430
98	NC_022760	TCG	2	6	9929	9934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237430
99	NC_022760	CAG	2	6	10134	10139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237430
100	NC_022760	TGC	2	6	10148	10153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237430
101	NC_022760	CGA	3	9	10394	10402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237431
102	NC_022760	CCA	2	6	10622	10627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237431
103	NC_022760	TCA	2	6	10657	10662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237431
104	NC_022760	GGT	2	6	10679	10684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237431
105	NC_022760	TGC	2	6	10771	10776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237431
106	NC_022760	TTC	2	6	10806	10811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237431
107	NC_022760	AGG	2	6	10827	10832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237431
108	NC_022760	TGG	2	6	10966	10971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237431
109	NC_022760	TGA	2	6	10991	10996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237431
110	NC_022760	CAT	2	6	11082	11087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237431
111	NC_022760	GTT	2	6	11091	11096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237431
112	NC_022760	ACG	2	6	11137	11142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237431
113	NC_022760	GTT	2	6	11246	11251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237431
114	NC_022760	CTT	2	6	11283	11288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237431
115	NC_022760	TGG	2	6	11299	11304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237431
116	NC_022760	GGA	2	6	11429	11434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237431
117	NC_022760	TGA	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557238157
118	NC_022760	TGC	2	6	11636	11641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557238157
119	NC_022760	TGC	2	6	11762	11767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557238157
120	NC_022760	ACG	2	6	11772	11777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557238157
121	NC_022760	AAC	2	6	13533	13538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237432
122	NC_022760	GCA	2	6	13600	13605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237432
123	NC_022760	AGG	2	6	13640	13645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237432
124	NC_022760	CCA	2	6	13684	13689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237432
125	NC_022760	CAG	2	6	13731	13736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237432
126	NC_022760	CAG	2	6	13740	13745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237432
127	NC_022760	ACT	2	6	14159	14164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238158
128	NC_022760	AGA	2	6	14199	14204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557238158
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132	NC_022760	CTG	2	6	18941	18946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237433
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153	NC_022760	TGA	2	6	20272	20277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237433
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251	NC_022760	TGC	2	6	30828	30833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237441
252	NC_022760	ATG	2	6	30870	30875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237441
253	NC_022760	TAC	2	6	30996	31001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237441
254	NC_022760	CTG	2	6	31490	31495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237442
255	NC_022760	TGC	2	6	31496	31501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237442
256	NC_022760	GTT	2	6	31565	31570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237442
257	NC_022760	TGC	2	6	31668	31673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237442
258	NC_022760	TGA	2	6	31684	31689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237442
259	NC_022760	ATC	2	6	31851	31856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237442
260	NC_022760	TGA	2	6	31945	31950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237442
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263	NC_022760	CTG	3	9	32484	32492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237442
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270	NC_022760	AGA	2	6	32951	32956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237443
271	NC_022760	TCC	2	6	33058	33063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237443
272	NC_022760	GGT	2	6	33117	33122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237443
273	NC_022760	CTA	2	6	33194	33199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237443
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281	NC_022760	TCA	2	6	38596	38601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237445
282	NC_022760	TCG	2	6	38693	38698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237445
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284	NC_022760	CTC	2	6	38821	38826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237445
285	NC_022760	ACC	2	6	38860	38865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237445
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360	NC_022760	GTG	2	6	48737	48742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237453
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362	NC_022760	ACG	2	6	49887	49892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237454
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371	NC_022760	GAG	2	6	50690	50695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237454
372	NC_022760	AGT	2	6	50739	50744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237454
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374	NC_022760	ACC	2	6	51287	51292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237456
375	NC_022760	CAT	2	6	51370	51375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237456
376	NC_022760	GTG	2	6	51387	51392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237456
377	NC_022760	CTA	2	6	51414	51419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237456
378	NC_022760	GTC	2	6	51455	51460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237456
379	NC_022760	TCA	2	6	51468	51473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237456
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496	NC_022760	ATC	2	6	78507	78512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237466
497	NC_022760	CCT	2	6	78524	78529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237466
498	NC_022760	TGA	2	6	78608	78613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237466
499	NC_022760	TCA	2	6	78775	78780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237466
500	NC_022760	AGC	2	6	78813	78818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237466

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