MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 14559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022760	ATG	2	6	1191919	1191924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557238153
14502	NC_022760	GGC	2	6	1192114	1192119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557238153
14503	NC_022760	AGA	2	6	1192125	1192130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557238153
14504	NC_022760	TCC	2	6	1192145	1192150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557238153
14505	NC_022760	TCA	2	6	1192173	1192178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238153
14506	NC_022760	AAT	2	6	1192237	1192242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557238153
14507	NC_022760	GCG	2	6	1192290	1192295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557238153
14508	NC_022760	CCT	2	6	1192302	1192307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557238153
14509	NC_022760	GCG	2	6	1192314	1192319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557238153
14510	NC_022760	GAT	2	6	1192340	1192345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557238153
14511	NC_022760	GCA	2	6	1192469	1192474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557238153
14512	NC_022760	ACG	2	6	1192518	1192523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557238153
14513	NC_022760	TAG	2	6	1192576	1192581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557238153
14514	NC_022760	ACA	2	6	1192601	1192606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557238153
14515	NC_022760	ATA	2	6	1192673	1192678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557238153
14516	NC_022760	CAA	2	6	1192701	1192706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557238153
14517	NC_022760	CAC	2	6	1192743	1192748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557238153
14518	NC_022760	TGG	2	6	1192779	1192784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557238153
14519	NC_022760	CAA	2	6	1192967	1192972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_022760	ACC	2	6	1192980	1192985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14521	NC_022760	AGA	2	6	1193028	1193033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_022760	ATT	2	6	1193159	1193164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_022760	GAA	2	6	1193369	1193374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_022760	CAC	2	6	1193429	1193434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14525	NC_022760	GCC	2	6	1193478	1193483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14526	NC_022760	GGT	2	6	1193690	1193695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557238154
14527	NC_022760	GAA	2	6	1193855	1193860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557238154
14528	NC_022760	TAC	2	6	1193965	1193970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238154
14529	NC_022760	AAG	2	6	1194012	1194017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557238154
14530	NC_022760	GTT	2	6	1194072	1194077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557238154
14531	NC_022760	GAT	2	6	1194120	1194125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557238154
14532	NC_022760	ACA	2	6	1194190	1194195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557238154
14533	NC_022760	TCC	2	6	1194219	1194224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557238154
14534	NC_022760	TGC	2	6	1194289	1194294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557238154
14535	NC_022760	TGG	2	6	1194359	1194364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557238154
14536	NC_022760	TGG	2	6	1194617	1194622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557238154
14537	NC_022760	AGG	2	6	1194660	1194665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557238154
14538	NC_022760	TTG	2	6	1194689	1194694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557238154
14539	NC_022760	CTA	2	6	1194717	1194722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238154
14540	NC_022760	CAT	2	6	1194945	1194950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238154
14541	NC_022760	CGC	2	6	1195161	1195166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14542	NC_022760	CAG	2	6	1195242	1195247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557238213
14543	NC_022760	GAA	2	6	1195309	1195314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557238213
14544	NC_022760	TCA	2	6	1195415	1195420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238155
14545	NC_022760	GCT	2	6	1195584	1195589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557238155
14546	NC_022760	TCC	2	6	1195661	1195666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557238155
14547	NC_022760	ACA	2	6	1195670	1195675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557238155
14548	NC_022760	GGC	2	6	1195728	1195733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557238155
14549	NC_022760	ACT	2	6	1195775	1195780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238155
14550	NC_022760	CAA	2	6	1195800	1195805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557238155
14551	NC_022760	GCA	2	6	1195845	1195850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557238155
14552	NC_022760	ATT	2	6	1195856	1195861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557238155
14553	NC_022760	CGC	2	6	1195908	1195913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557238155
14554	NC_022760	ACA	2	6	1195967	1195972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557238155
14555	NC_022760	TTG	2	6	1196036	1196041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557238155
14556	NC_022760	CCG	2	6	1196076	1196081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557238155
14557	NC_022760	CTA	2	6	1196136	1196141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238155
14558	NC_022760	TAC	2	6	1196220	1196225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238155
14559	NC_022760	GCC	2	6	1196375	1196380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557238155

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.