MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas sp. VLB120

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022738	ATGGAA	2	12	6549	6560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022738	TGGTCA	3	18	33839	33856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022738	CTTTGC	2	12	34707	34718	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022738	TAAATG	2	12	50613	50624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022738	TACTTC	2	12	55032	55043	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022738	CAAACC	2	12	65617	65628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022738	ACCTGA	2	12	73833	73844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022738	GTCTAC	2	12	171622	171633	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022738	TGAAAT	2	12	195935	195946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022738	TGAAAT	2	12	201559	201570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022738	TGCCGG	2	12	264953	264964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022738	TCTGTT	2	12	296287	296298	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022738	CATGAG	2	12	493591	493602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022738	CAAAAA	2	12	521862	521873	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022738	AGGCCA	2	12	528152	528163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022738	GCAATA	2	12	541678	541689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022738	GGTGAT	2	12	564939	564950	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022738	TTGGTG	2	12	567814	567825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022738	TGTCGG	2	12	584079	584090	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022738	GGGGGA	2	12	646889	646900	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022738	TGGAAC	2	12	681581	681592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022738	CGTGAA	2	12	721497	721508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022738	TCTTGC	10	60	734978	735037	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022738	GCTCCC	2	12	789874	789885	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_022738	CTGCGA	2	12	832134	832145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022738	TGAAAT	2	12	855534	855545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022738	CCCACG	2	12	1004471	1004482	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022738	TTTGCA	2	12	1009600	1009611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022738	GTCTGT	2	12	1049651	1049662	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022738	TACATA	2	12	1061754	1061765	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022738	ATTTGC	2	12	1072472	1072483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022738	GCTGGC	2	12	1097569	1097580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022738	CCGCAC	2	12	1108906	1108917	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_022738	TTAATG	2	12	1235532	1235543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022738	GGCGCG	2	12	1264597	1264608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022738	TGGCCG	2	12	1266542	1266553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022738	TGAAAT	2	12	1309097	1309108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022738	CGGGTC	2	12	1325031	1325042	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022738	AAGGGC	2	12	1445516	1445527	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022738	CACTGC	2	12	1470365	1470376	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022738	TACTGG	2	12	1481345	1481356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022738	AGGGCG	2	12	1481540	1481551	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022738	AGCAAA	3	18	1627909	1627926	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022738	TTTGGC	2	12	1660518	1660529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022738	TAACTG	2	12	1684671	1684682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022738	TTGCTT	2	12	1712281	1712292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022738	ATTGTT	2	12	1712856	1712867	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022738	GCTTTT	2	12	1712896	1712907	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022738	GCTTTT	2	12	1713233	1713244	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022738	GCTTTT	2	12	1757537	1757548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022738	AAGCAA	3	18	1757711	1757728	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022738	GTTTTT	2	12	1789401	1789412	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022738	CCGGTG	2	12	1804455	1804466	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022738	GGGGTG	2	12	1832942	1832953	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022738	AACAGT	2	12	1845357	1845368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022738	CGCAGT	2	12	1934900	1934911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022738	CAAACC	2	12	1934923	1934934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022738	TGAAAT	2	12	2002119	2002130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022738	GGCCAG	2	12	2066978	2066989	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022738	CCTGCT	2	12	2090444	2090455	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022738	GCGCCT	2	12	2095994	2096005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022738	TGGTGA	2	12	2096278	2096289	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022738	GCCCAA	2	12	2146703	2146714	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022738	ACGTAA	2	12	2152416	2152427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022738	AAGGGC	2	12	2190176	2190187	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022738	CAGTGG	2	12	2235240	2235251	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022738	AATTCT	2	12	2337050	2337061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022738	AATTCT	2	12	2346276	2346287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022738	CGATGT	2	12	2369832	2369843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022738	CGCGCC	2	12	2378320	2378331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_022738	GCAAGC	2	12	2490357	2490368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022738	AATGGT	2	12	2494093	2494104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022738	GGCCTT	2	12	2505670	2505681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022738	GCCTGC	2	12	2557145	2557156	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022738	ACACGG	2	12	2566791	2566802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022738	GTCAAA	2	12	2571371	2571382	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022738	GAGTGT	2	12	2596729	2596740	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022738	ACGCCA	2	12	2641994	2642005	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022738	GCGACA	2	12	2665095	2665106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022738	GCTTTT	2	12	2694707	2694718	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022738	GCCTTT	2	12	2712713	2712724	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022738	ATTTTC	2	12	2802063	2802074	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022738	CTTGTT	2	12	2809526	2809537	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022738	GGCACC	2	12	2829296	2829307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022738	CTTGGC	2	12	2953916	2953927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022738	AAAAGC	2	12	3005656	3005667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022738	CTTGCT	2	12	3005770	3005781	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022738	TGTTGG	2	12	3070231	3070242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022738	CCAAAA	2	12	3084686	3084697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022738	CCTTGG	2	12	3091134	3091145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022738	CGGCAC	2	12	3164162	3164173	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022738	CTGAAC	2	12	3237958	3237969	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022738	GTGATG	2	12	3266796	3266807	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022738	AGAAAA	2	12	3300841	3300852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022738	TGCGCG	2	12	3309901	3309912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022738	GCACGG	2	12	3327503	3327514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022738	GGAGCC	2	12	3347674	3347685	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022738	GCCCAG	2	12	3378098	3378109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022738	GCCGGA	2	12	3458024	3458035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022738	CCTTCC	4	24	3659265	3659288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022738	CGCCCA	2	12	3683836	3683847	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022738	ACGTCA	2	12	3713272	3713283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022738	TGGCGC	2	12	3750963	3750974	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022738	CGAAGG	2	12	3751315	3751326	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022738	GCGCTG	2	12	3769708	3769719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022738	CGTTTT	2	12	3849281	3849292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022738	TCAGAG	2	12	3905931	3905942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022738	CACTGA	2	12	3976468	3976479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022738	AGAAAA	2	12	4113818	4113829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022738	TTTTCT	2	12	4113932	4113943	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022738	AGCACC	2	12	4114170	4114181	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022738	TCATAC	2	12	4118145	4118156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022738	AGCATT	2	12	4120338	4120349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022738	TCGGCT	2	12	4121795	4121806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022738	CCCTCC	2	12	4144651	4144662	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
116	NC_022738	ATATGT	2	12	4154745	4154756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022738	GCCTGC	2	12	4171117	4171128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022738	TCTGCG	2	12	4251757	4251768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022738	GTTTGT	2	12	4257824	4257835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022738	TTTTGC	9	54	4257836	4257889	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022738	AAGCAA	2	12	4258543	4258554	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022738	AGCGAC	8	48	4258561	4258608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022738	AGCCTG	2	12	4310270	4310281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022738	CCGGGG	2	12	4355043	4355054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022738	TCATGT	2	12	4390970	4390981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022738	CAGCAA	2	12	4465483	4465494	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022738	CGTGGG	2	12	4505258	4505269	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022738	AGCCGT	2	12	4525148	4525159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022738	CGCGTC	2	12	4525722	4525733	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022738	ACCGGC	2	12	4542374	4542385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022738	GGGCAA	2	12	4603426	4603437	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022738	GTGCCG	2	12	4603589	4603600	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022738	TCGACC	2	12	4603846	4603857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022738	CTGACC	2	12	4606213	4606224	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022738	CGCCAG	2	12	4606682	4606693	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022738	ACCGGC	2	12	4606987	4606998	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022738	TCGCCA	2	12	4607723	4607734	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022738	GCCTGA	2	12	4608734	4608745	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022738	TACCGG	2	12	4609782	4609793	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022738	CACGGT	2	12	4610313	4610324	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022738	CACCTT	2	12	4610703	4610714	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022738	ACCGGA	2	12	4610935	4610946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022738	CTACAC	2	12	4611123	4611134	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022738	TACACC	2	12	4611916	4611927	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022738	TCACCC	2	12	4612373	4612384	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_022738	CCTTCG	2	12	4633234	4633245	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022738	TGCATC	2	12	4670804	4670815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022738	CACGGC	2	12	4778929	4778940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022738	CTTTGT	2	12	4798525	4798536	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_022738	GAAGTG	2	12	4802892	4802903	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_022738	GTCAAG	2	12	4868398	4868409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_022738	ATGCCG	2	12	4915786	4915797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_022738	GCTTTA	2	12	4951336	4951347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_022738	TGGCGG	2	12	4975661	4975672	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_022738	CGACCC	2	12	4982612	4982623	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.