MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus pasteuri SP1

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022737	AATTTA	2	12	1484	1495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022737	GCTCTA	2	12	14542	14553	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022737	TAAATG	2	12	18807	18818	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022737	TAATTT	2	12	100680	100691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022737	TTATAA	2	12	142303	142314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022737	TTTGAT	2	12	148229	148240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022737	TTATTT	2	12	170151	170162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022737	AGCCAA	2	12	183278	183289	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022737	TTGACT	2	12	183297	183308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022737	TGCAAA	2	12	190180	190191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022737	CTTTTG	2	12	207014	207025	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022737	ATTTTA	2	12	215504	215515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022737	CAGTAT	2	12	222582	222593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022737	ATTTGT	2	12	222718	222729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022737	TAATTT	2	12	225934	225945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022737	AAAAAT	2	12	225946	225957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022737	ATTAAA	2	12	233482	233493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022737	GATTGA	2	12	247653	247664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022737	TAATAT	2	12	248815	248826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022737	ACATAT	2	12	250880	250891	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022737	TACAAA	2	12	278681	278692	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022737	ATTCGA	2	12	357260	357271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022737	CTTTCA	2	12	400767	400778	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022737	TAAATT	2	12	442497	442508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022737	AAATAA	2	12	462942	462953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022737	CCCTTT	2	12	472049	472060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022737	TTTAAC	2	12	493417	493428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022737	CTACAC	2	12	504203	504214	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022737	ATTACT	2	12	577811	577822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022737	AATAAA	2	12	594259	594270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022737	TCATAC	2	12	595921	595932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022737	CAATTA	2	12	625409	625420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022737	GATTTA	2	12	633911	633922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022737	TTTTTA	2	12	674755	674766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022737	ATTTAT	2	12	676674	676685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022737	AATTTT	2	12	680065	680076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022737	ATCATT	2	12	684198	684209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022737	TTAATT	2	12	741177	741188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022737	TAAAGT	2	12	742162	742173	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022737	ACATGT	2	12	767920	767931	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022737	TTTTTA	2	12	770815	770826	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022737	ACAAAT	2	12	822709	822720	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022737	TAAAAA	2	12	839338	839349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022737	ATGGGA	2	12	871492	871503	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022737	AAAGAA	2	12	871628	871639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022737	AAAGAA	2	12	910854	910865	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022737	AAAGAA	2	12	919487	919498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022737	ACTATT	2	12	920776	920787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022737	TAAATA	2	12	923047	923058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022737	ACAAAT	2	12	926097	926108	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022737	ATTTTT	2	12	957477	957488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022737	CGTTTA	2	12	974657	974668	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022737	CTTTAC	2	12	980654	980665	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022737	CGTTTT	2	12	980791	980802	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022737	TCCCTC	2	12	987236	987247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_022737	ATTTAC	2	12	1005617	1005628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022737	CAGTTA	2	12	1030966	1030977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022737	GGTGCA	2	12	1047316	1047327	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022737	TTGTAA	2	12	1073113	1073124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022737	TTAAAT	2	12	1088101	1088112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022737	AAATAT	2	12	1092751	1092762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022737	TATATC	2	12	1115337	1115348	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022737	ATATCT	2	12	1143613	1143624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022737	ATTGAT	2	12	1256246	1256257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022737	CACTTA	2	12	1260022	1260033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022737	ATTTTT	2	12	1260107	1260118	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022737	ACCTAA	2	12	1279919	1279930	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022737	TGTAAC	2	12	1313477	1313488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022737	AGTTAC	2	12	1313489	1313500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022737	AAAATC	2	12	1315926	1315937	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022737	TATCAA	2	12	1318064	1318075	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022737	TTAATT	2	12	1326194	1326205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022737	AGAATG	2	12	1357982	1357993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022737	ATATTA	2	12	1358340	1358351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022737	ATAAAT	2	12	1378542	1378553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022737	TAAAAA	2	12	1388293	1388304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022737	GTTTCT	2	12	1408552	1408563	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022737	TACAAA	2	12	1416895	1416906	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022737	TTAAAA	2	12	1417828	1417839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022737	TTTCAT	2	12	1421606	1421617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022737	AAATAC	2	12	1441578	1441589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022737	CTAAAA	2	12	1446793	1446804	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022737	TTTGTT	2	12	1459701	1459712	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022737	TCATTT	2	12	1478262	1478273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022737	AATAGA	2	12	1480078	1480089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022737	ATTTTA	2	12	1487207	1487218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022737	ATAGTA	2	12	1488573	1488584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022737	TTAATA	2	12	1496782	1496793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022737	AAATAT	2	12	1513809	1513820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022737	TTATAA	2	12	1515950	1515961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022737	TTATTT	2	12	1528852	1528863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022737	TTAATG	2	12	1534908	1534919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022737	AATATA	2	12	1534994	1535005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022737	CTTGTA	2	12	1554732	1554743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022737	TTAAAA	2	12	1562758	1562769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022737	ATTAGA	2	12	1592068	1592079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022737	ATATCT	2	12	1609193	1609204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022737	ATAAAT	2	12	1611121	1611132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022737	AAGAGA	2	12	1617037	1617048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022737	ATAATG	2	12	1651497	1651508	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022737	AAAGTT	2	12	1662395	1662406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022737	AAAAAT	2	12	1696936	1696947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022737	TAAAAA	2	12	1711696	1711707	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022737	TAAAAA	2	12	1711800	1711811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022737	ATTTTT	2	12	1725539	1725550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022737	TTAGTT	2	12	1805737	1805748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022737	TGATAA	2	12	1810535	1810546	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022737	TTCTTT	2	12	1821853	1821864	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022737	CAAATT	2	12	1824084	1824095	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022737	TTAAAA	2	12	1840938	1840949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022737	TACAGT	2	12	1851725	1851736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022737	GATATA	2	12	1853079	1853090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022737	CGTTTT	2	12	1871943	1871954	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022737	ACTTTA	2	12	1892594	1892605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022737	TATTTT	2	12	1907579	1907590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022737	TAACAA	2	12	1927631	1927642	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_022737	ACTTTA	2	12	1937010	1937021	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022737	ATTATC	2	12	1941273	1941284	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022737	GTTTGC	2	12	1959413	1959424	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022737	ATACTG	2	12	1963310	1963321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022737	TGTGGT	2	12	2012053	2012064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022737	TTAATT	2	12	2012741	2012752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022737	TCTTTT	2	12	2020708	2020719	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_022737	TTGAAA	2	12	2021003	2021014	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022737	TTAACG	2	12	2022739	2022750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022737	GGTTAT	2	12	2083466	2083477	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022737	TCATTA	2	12	2100657	2100668	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022737	ATCAAT	2	12	2102233	2102244	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022737	TAAATA	2	12	2104662	2104673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022737	ATAATT	2	12	2125348	2125359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022737	ATATAA	2	12	2129741	2129752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022737	AATTTA	2	12	2131580	2131591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022737	AAGAAT	2	12	2145055	2145066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022737	TAAAAA	2	12	2145178	2145189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022737	GCAAAT	2	12	2150812	2150823	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_022737	TTTAAT	2	12	2160686	2160697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022737	AATTTA	2	12	2165184	2165195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022737	TATACT	2	12	2191633	2191644	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_022737	TAAATG	2	12	2192617	2192628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022737	AATCAA	2	12	2194247	2194258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_022737	TCCGTT	2	12	2195056	2195067	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022737	TATAAA	2	12	2214896	2214907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_022737	TAATTA	2	12	2403109	2403120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022737	ATTGAA	2	12	2427916	2427927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_022737	TTGAAC	2	12	2553089	2553100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.