MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 1698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022665	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	556587608
2	NC_022665	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	556587608
3	NC_022665	CATAT	2	10	2808	2817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022665	AAACA	2	10	5724	5733	80 %	0 %	0 %	20 %	556587614
5	NC_022665	TGTCT	2	10	6115	6124	0 %	60 %	20 %	20 %	556587614
6	NC_022665	GAGAT	2	10	6833	6842	40 %	20 %	40 %	0 %	556587615
7	NC_022665	TGAAA	2	10	9970	9979	60 %	20 %	20 %	0 %	556587616
8	NC_022665	CTATT	2	10	11207	11216	20 %	60 %	0 %	20 %	556587619
9	NC_022665	CTTTG	2	10	13436	13445	0 %	60 %	20 %	20 %	556587621
10	NC_022665	AACAG	2	10	13880	13889	60 %	0 %	20 %	20 %	556587622
11	NC_022665	CTTGT	2	10	15036	15045	0 %	60 %	20 %	20 %	556587622
12	NC_022665	ACAAA	2	10	16920	16929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022665	TCGTG	2	10	18054	18063	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022665	GTTAA	2	10	18819	18828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022665	ATAGA	2	10	22381	22390	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022665	ATTAT	2	10	22856	22865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022665	ATATT	2	10	23405	23414	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022665	TTTAT	2	10	24436	24445	20 %	80 %	0 %	0 %	556587626
19	NC_022665	AATGC	2	10	25402	25411	40 %	20 %	20 %	20 %	556587627
20	NC_022665	TTTTG	2	10	27848	27857	0 %	80 %	20 %	0 %	556587629
21	NC_022665	CTACG	2	10	30756	30765	20 %	20 %	20 %	40 %	556587633
22	NC_022665	GAACG	2	10	33042	33051	40 %	0 %	40 %	20 %	556587634
23	NC_022665	AAACC	2	10	33178	33187	60 %	0 %	0 %	40 %	556587634
24	NC_022665	TTCTT	2	10	34526	34535	0 %	80 %	0 %	20 %	556587634
25	NC_022665	GCCAT	2	10	35000	35009	20 %	20 %	20 %	40 %	556587634
26	NC_022665	AAATG	2	10	36086	36095	60 %	20 %	20 %	0 %	556587635
27	NC_022665	GGAGC	2	10	36956	36965	20 %	0 %	60 %	20 %	556587636
28	NC_022665	CTATT	2	10	38940	38949	20 %	60 %	0 %	20 %	556587638
29	NC_022665	GAAAA	2	10	41183	41192	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022665	CAGGA	2	10	42434	42443	40 %	0 %	40 %	20 %	556587641
31	NC_022665	AGCGG	2	10	45110	45119	20 %	0 %	60 %	20 %	556587644
32	NC_022665	TTCTA	2	10	47112	47121	20 %	60 %	0 %	20 %	556587646
33	NC_022665	ATTTT	2	10	48019	48028	20 %	80 %	0 %	0 %	556587648
34	NC_022665	TTAGT	2	10	48074	48083	20 %	60 %	20 %	0 %	556587648
35	NC_022665	GAAGT	2	10	48721	48730	40 %	20 %	40 %	0 %	556587649
36	NC_022665	TTATC	2	10	48852	48861	20 %	60 %	0 %	20 %	556587649
37	NC_022665	TCAAT	2	10	49219	49228	40 %	40 %	0 %	20 %	556587650
38	NC_022665	TTATT	2	10	49472	49481	20 %	80 %	0 %	0 %	556587650
39	NC_022665	GTAGA	2	10	50105	50114	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022665	TTACA	2	10	50359	50368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022665	GCAGA	2	10	51624	51633	40 %	0 %	40 %	20 %	556587652
42	NC_022665	GGGCT	2	10	52095	52104	0 %	20 %	60 %	20 %	556587652
43	NC_022665	TTTTG	2	10	53124	53133	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022665	TGAAT	2	10	53718	53727	40 %	40 %	20 %	0 %	556587654
45	NC_022665	TTAAG	2	10	55978	55987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022665	AGCAG	2	10	57703	57712	40 %	0 %	40 %	20 %	556587659
47	NC_022665	GCAAG	2	10	61603	61612	40 %	0 %	40 %	20 %	556587663
48	NC_022665	GTTTT	2	10	62933	62942	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022665	TTGCT	2	10	63528	63537	0 %	60 %	20 %	20 %	556587665
50	NC_022665	GGTAA	2	10	63977	63986	40 %	20 %	40 %	0 %	556587665
51	NC_022665	AGCTG	2	10	64615	64624	20 %	20 %	40 %	20 %	556587667
52	NC_022665	AACAA	2	10	67074	67083	80 %	0 %	0 %	20 %	556587669
53	NC_022665	GTATC	2	10	68033	68042	20 %	40 %	20 %	20 %	556587670
54	NC_022665	TGGCG	2	10	71505	71514	0 %	20 %	60 %	20 %	556587677
55	NC_022665	AAAAC	2	10	72065	72074	80 %	0 %	0 %	20 %	556587678
56	NC_022665	TACAC	2	10	72479	72488	40 %	20 %	0 %	40 %	556587679
57	NC_022665	GAAAA	2	10	73209	73218	80 %	0 %	20 %	0 %	556587680
58	NC_022665	GTCTT	2	10	73497	73506	0 %	60 %	20 %	20 %	556587681
59	NC_022665	TTTGG	2	10	73628	73637	0 %	60 %	40 %	0 %	556587681
60	NC_022665	AAGGA	2	10	76247	76256	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022665	AGTTT	2	10	80425	80434	20 %	60 %	20 %	0 %	556587696
62	NC_022665	AGAAT	2	10	81558	81567	60 %	20 %	20 %	0 %	556587696
63	NC_022665	GAAAA	2	10	83884	83893	80 %	0 %	20 %	0 %	556587701
64	NC_022665	TGACT	2	10	84279	84288	20 %	40 %	20 %	20 %	556587701
65	NC_022665	ACAAA	2	10	87278	87287	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022665	TCGTG	2	10	88410	88419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022665	GTTAA	2	10	89175	89184	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022665	TTAAT	2	10	92987	92996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022665	TTTTG	2	10	93457	93466	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022665	TTTTC	2	10	94065	94074	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022665	TTTGG	2	10	96361	96370	0 %	60 %	40 %	0 %	556587708
72	NC_022665	ATTGC	2	10	96826	96835	20 %	40 %	20 %	20 %	556587708
73	NC_022665	GCTTT	2	10	97057	97066	0 %	60 %	20 %	20 %	556587709
74	NC_022665	AGAAA	2	10	97515	97524	80 %	0 %	20 %	0 %	556587709
75	NC_022665	GACTT	2	10	99095	99104	20 %	40 %	20 %	20 %	556587710
76	NC_022665	TAAAC	3	15	99676	99690	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022665	TTGAA	2	10	100535	100544	40 %	40 %	20 %	0 %	556587713
78	NC_022665	CTGGG	2	10	104298	104307	0 %	20 %	60 %	20 %	556587715
79	NC_022665	AAGAA	2	10	108853	108862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022665	CCGTT	2	10	109896	109905	0 %	40 %	20 %	40 %	556587717
81	NC_022665	GTCTG	2	10	113369	113378	0 %	40 %	40 %	20 %	556587719
82	NC_022665	GGCCT	2	10	113444	113453	0 %	20 %	40 %	40 %	556587719
83	NC_022665	TGGTT	2	10	115520	115529	0 %	60 %	40 %	0 %	556587721
84	NC_022665	GGTCA	2	10	115819	115828	20 %	20 %	40 %	20 %	556587721
85	NC_022665	AAGGA	2	10	116909	116918	60 %	0 %	40 %	0 %	556587724
86	NC_022665	GGCAA	2	10	117467	117476	40 %	0 %	40 %	20 %	556587726
87	NC_022665	TTGGT	2	10	119855	119864	0 %	60 %	40 %	0 %	556587728
88	NC_022665	GGATG	2	10	120157	120166	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022665	GAAAA	2	10	120317	120326	80 %	0 %	20 %	0 %	556587729
90	NC_022665	CCTTG	2	10	120370	120379	0 %	40 %	20 %	40 %	556587729
91	NC_022665	CTGGA	2	10	121258	121267	20 %	20 %	40 %	20 %	556587730
92	NC_022665	AGCAG	2	10	121614	121623	40 %	0 %	40 %	20 %	556587730
93	NC_022665	AATCA	2	10	122234	122243	60 %	20 %	0 %	20 %	556587731
94	NC_022665	AGGTG	2	10	122922	122931	20 %	20 %	60 %	0 %	556587731
95	NC_022665	CATGA	2	10	123295	123304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022665	ACTTT	2	10	126492	126501	20 %	60 %	0 %	20 %	556587736
97	NC_022665	CTATA	2	10	127516	127525	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_022665	ATCGT	2	10	128054	128063	20 %	40 %	20 %	20 %	556587739
99	NC_022665	TAGCG	2	10	129592	129601	20 %	20 %	40 %	20 %	556587740
100	NC_022665	ATCAA	2	10	130753	130762	60 %	20 %	0 %	20 %	556587742
101	NC_022665	GAAGC	2	10	131242	131251	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022665	CGTAT	2	10	131910	131919	20 %	40 %	20 %	20 %	556587743
103	NC_022665	ATCCA	2	10	132001	132010	40 %	20 %	0 %	40 %	556587743
104	NC_022665	CAAGA	2	10	132777	132786	60 %	0 %	20 %	20 %	556587743
105	NC_022665	AAGCT	2	10	133207	133216	40 %	20 %	20 %	20 %	556587743
106	NC_022665	GCAGT	2	10	135746	135755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022665	ATCCA	2	10	135857	135866	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_022665	TACGA	2	10	136358	136367	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022665	TTAAG	2	10	136690	136699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022665	GTAAA	2	10	138172	138181	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022665	CTATT	2	10	140206	140215	20 %	60 %	0 %	20 %	556587746
112	NC_022665	GTTTA	2	10	140385	140394	20 %	60 %	20 %	0 %	556587747
113	NC_022665	GCATG	2	10	141907	141916	20 %	20 %	40 %	20 %	556587749
114	NC_022665	AAAAT	2	10	142320	142329	80 %	20 %	0 %	0 %	556587749
115	NC_022665	ATAAA	2	10	142810	142819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022665	GTGAC	2	10	145076	145085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022665	TTTCA	2	10	147965	147974	20 %	60 %	0 %	20 %	556587756
118	NC_022665	AAAAG	2	10	148558	148567	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022665	TGGTC	2	10	151150	151159	0 %	40 %	40 %	20 %	556587759
120	NC_022665	GTCTT	2	10	152105	152114	0 %	60 %	20 %	20 %	556587760
121	NC_022665	TTGGA	2	10	154621	154630	20 %	40 %	40 %	0 %	556587761
122	NC_022665	CTTGG	2	10	155663	155672	0 %	40 %	40 %	20 %	556587763
123	NC_022665	AGGGA	2	10	155877	155886	40 %	0 %	60 %	0 %	556587763
124	NC_022665	GAGCA	2	10	156590	156599	40 %	0 %	40 %	20 %	556587764
125	NC_022665	AGAAC	2	10	156966	156975	60 %	0 %	20 %	20 %	556587764
126	NC_022665	ATGTC	2	10	159601	159610	20 %	40 %	20 %	20 %	556587766
127	NC_022665	CATTG	2	10	161799	161808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022665	ATACA	2	10	162918	162927	60 %	20 %	0 %	20 %	556587769
129	NC_022665	GGTTT	2	10	165076	165085	0 %	60 %	40 %	0 %	556587770
130	NC_022665	TTATC	2	10	165952	165961	20 %	60 %	0 %	20 %	556587771
131	NC_022665	CAAAT	2	10	168322	168331	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022665	TCTGG	2	10	169387	169396	0 %	40 %	40 %	20 %	556587774
133	NC_022665	TTCAA	2	10	169927	169936	40 %	40 %	0 %	20 %	556587774
134	NC_022665	TATAA	2	10	170777	170786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022665	TTGAT	2	10	175151	175160	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022665	GCGTG	2	10	179064	179073	0 %	20 %	60 %	20 %	556587782
137	NC_022665	GTTGG	2	10	181438	181447	0 %	40 %	60 %	0 %	556587784
138	NC_022665	GGAAA	2	10	184482	184491	60 %	0 %	40 %	0 %	556587785
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262	NC_022665	CCAAG	2	10	333977	333986	40 %	0 %	20 %	40 %	556587932
263	NC_022665	GAAAG	2	10	336772	336781	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_022665	CAACA	2	10	338146	338155	60 %	0 %	0 %	40 %	556587936
265	NC_022665	GTTTT	2	10	339007	339016	0 %	80 %	20 %	0 %	556587936
266	NC_022665	TAGAA	2	10	339738	339747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_022665	GTATG	2	10	341009	341018	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
268	NC_022665	AAACC	2	10	341154	341163	60 %	0 %	0 %	40 %	556587938
269	NC_022665	ACAAA	2	10	341903	341912	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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405	NC_022665	TTGGA	2	10	515397	515406	20 %	40 %	40 %	0 %	556588098
406	NC_022665	TTTTA	2	10	516111	516120	20 %	80 %	0 %	0 %	556588099
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