MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 29168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022665	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587608
2	NC_022665	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587608
3	NC_022665	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
4	NC_022665	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587608
5	NC_022665	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587608
6	NC_022665	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587608
7	NC_022665	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587608
8	NC_022665	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587608
9	NC_022665	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587608
10	NC_022665	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587608
11	NC_022665	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587608
12	NC_022665	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
13	NC_022665	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
14	NC_022665	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587608
15	NC_022665	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587608
16	NC_022665	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587608
17	NC_022665	TCA	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022665	ACT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022665	ATA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022665	TAA	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
21	NC_022665	TTA	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587609
22	NC_022665	AAG	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587609
23	NC_022665	GTC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587609
24	NC_022665	TGA	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587609
25	NC_022665	TGT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587609
26	NC_022665	GAT	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587609
27	NC_022665	TCT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
28	NC_022665	AAT	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
29	NC_022665	TTA	2	6	2258	2263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587609
30	NC_022665	AAC	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587609
31	NC_022665	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
32	NC_022665	TAA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
33	NC_022665	TGT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587609
34	NC_022665	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
35	NC_022665	AAT	2	6	2612	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
36	NC_022665	ATA	2	6	2666	2671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022665	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022665	AGT	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587610
39	NC_022665	TTA	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
40	NC_022665	ATT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
41	NC_022665	TGA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587610
42	NC_022665	TGG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587610
43	NC_022665	TTA	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
44	NC_022665	TCT	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587610
45	NC_022665	ATT	3	9	3557	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
46	NC_022665	AGG	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587610
47	NC_022665	TCA	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587611
48	NC_022665	TAA	2	6	3722	3727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587611
49	NC_022665	ATG	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587611
50	NC_022665	ACT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022665	GAG	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022665	TGG	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587612
53	NC_022665	AAC	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587612
54	NC_022665	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587612
55	NC_022665	TGT	2	6	4248	4253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587612
56	NC_022665	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587612
57	NC_022665	ATT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587612
58	NC_022665	CAG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
59	NC_022665	TCG	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587613
60	NC_022665	TCA	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587613
61	NC_022665	CAA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587613
62	NC_022665	AGA	2	6	4932	4937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
63	NC_022665	GAA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
64	NC_022665	TGA	2	6	5040	5045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587613
65	NC_022665	GCA	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
66	NC_022665	GTG	3	9	5122	5130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587613
67	NC_022665	GAA	3	9	5146	5154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
68	NC_022665	CGA	2	6	5166	5171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
69	NC_022665	CAG	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
70	NC_022665	AGG	2	6	5288	5293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587613
71	NC_022665	CTC	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587613
72	NC_022665	GAT	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587613
73	NC_022665	AAG	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
74	NC_022665	GAA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
75	NC_022665	CAT	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587613
76	NC_022665	TTC	2	6	5535	5540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022665	GTT	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022665	GAT	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022665	TGC	2	6	5748	5753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587614
80	NC_022665	TTA	2	6	5911	5916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587614
81	NC_022665	TAG	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587614
82	NC_022665	GAC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587614
83	NC_022665	TGG	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587614
84	NC_022665	GAA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587614
85	NC_022665	GAT	2	6	6206	6211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587614
86	NC_022665	TTA	3	9	6322	6330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587615
87	NC_022665	ATG	2	6	6419	6424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
88	NC_022665	ATT	2	6	6454	6459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587615
89	NC_022665	GAT	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
90	NC_022665	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587615
91	NC_022665	TAG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
92	NC_022665	TTG	2	6	7105	7110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
93	NC_022665	GAT	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
94	NC_022665	TTG	2	6	7201	7206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
95	NC_022665	GAT	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
96	NC_022665	CTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587615
97	NC_022665	CCA	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587615
98	NC_022665	GTT	2	6	7441	7446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
99	NC_022665	GCA	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587615
100	NC_022665	TAG	2	6	7538	7543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
101	NC_022665	TCA	2	6	7613	7618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587615
102	NC_022665	TGT	2	6	7725	7730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
103	NC_022665	ATT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587615
104	NC_022665	TCT	2	6	7860	7865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587615
105	NC_022665	TAA	2	6	7905	7910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587615
106	NC_022665	GGA	2	6	7962	7967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587615
107	NC_022665	GAT	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
108	NC_022665	TGA	3	9	8034	8042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
109	NC_022665	ACT	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587615
110	NC_022665	TGA	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
111	NC_022665	TAG	2	6	8156	8161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
112	NC_022665	ATG	2	6	8219	8224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
113	NC_022665	TGT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
114	NC_022665	CTA	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587615
115	NC_022665	CAA	2	6	8882	8887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587615
116	NC_022665	GTG	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587615
117	NC_022665	TGC	2	6	9159	9164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587615
118	NC_022665	AGA	2	6	9260	9265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587615
119	NC_022665	AAG	2	6	9395	9400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587615
120	NC_022665	GTA	2	6	9433	9438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
121	NC_022665	GAC	2	6	9506	9511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587615
122	NC_022665	TGT	2	6	9636	9641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
123	NC_022665	AAT	2	6	9767	9772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022665	TAA	2	6	9943	9948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587616
125	NC_022665	ACT	2	6	9949	9954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587616
126	NC_022665	GAA	2	6	10049	10054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587616
127	NC_022665	AAT	2	6	10074	10079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587617
128	NC_022665	CAA	2	6	10131	10136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587617
129	NC_022665	TTG	2	6	10204	10209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587617
130	NC_022665	CAG	3	9	10227	10235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587617
131	NC_022665	GAA	2	6	10269	10274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587617
132	NC_022665	GCA	2	6	10335	10340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587617
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252	NC_022665	TAA	2	6	18148	18153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_022665	GGA	2	6	18157	18162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_022665	ATC	2	6	18181	18186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_022665	CGC	2	6	18347	18352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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258	NC_022665	CCT	2	6	18519	18524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_022665	TCT	2	6	18554	18559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_022665	AGG	2	6	18620	18625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_022665	GTT	2	6	18665	18670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_022665	TAA	2	6	18812	18817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_022665	AAC	2	6	18881	18886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_022665	TAG	2	6	19053	19058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_022665	AGT	2	6	21982	21987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022665	ACC	2	6	22505	22510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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295	NC_022665	CGC	2	6	22935	22940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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301	NC_022665	CGG	2	6	23275	23280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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382	NC_022665	TAT	2	6	27369	27374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_022665	TTA	2	6	27411	27416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587629
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388	NC_022665	TTA	2	6	27587	27592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587629
389	NC_022665	TTC	2	6	27757	27762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587629
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391	NC_022665	ACG	2	6	27834	27839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587629
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393	NC_022665	CAT	2	6	28166	28171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587629
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396	NC_022665	GCA	2	6	28509	28514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587629
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400	NC_022665	CAA	2	6	29101	29106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587630
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404	NC_022665	TGA	2	6	29462	29467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587631
405	NC_022665	GAT	2	6	29541	29546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587631
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417	NC_022665	TCA	2	6	30223	30228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587631
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453	NC_022665	CTC	2	6	32377	32382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587634
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460	NC_022665	TTG	2	6	33215	33220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587634
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462	NC_022665	GTG	3	9	33259	33267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587634
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472	NC_022665	CCG	2	6	33808	33813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556587634
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480	NC_022665	AGA	2	6	34254	34259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587634
481	NC_022665	CAG	2	6	34322	34327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587634
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495	NC_022665	CAA	2	6	35435	35440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587635
496	NC_022665	TCT	4	12	35556	35567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587635
497	NC_022665	CGC	2	6	35595	35600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556587635
498	NC_022665	TGC	2	6	35696	35701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587635
499	NC_022665	GGT	2	6	35759	35764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587635
500	NC_022665	AGT	2	6	35789	35794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587635

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