MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 3271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022665	TCA	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022665	ACT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022665	ATA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022665	ATA	2	6	2666	2671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022665	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022665	ACT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022665	GAG	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022665	TTC	2	6	5535	5540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022665	GTT	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022665	GAT	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022665	AAT	2	6	9767	9772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022665	AGG	2	6	10528	10533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022665	AAC	2	6	13088	13093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022665	CTA	2	6	13649	13654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022665	CAA	2	6	15950	15955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022665	GAA	2	6	16538	16543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022665	GTT	2	6	16825	16830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022665	AGA	2	6	16868	16873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022665	GGC	2	6	17013	17018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022665	GCA	2	6	17334	17339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022665	CGC	2	6	17381	17386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_022665	TGT	2	6	17420	17425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022665	AGA	2	6	17429	17434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022665	AGA	2	6	17441	17446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022665	CAG	2	6	17503	17508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022665	GGA	2	6	17693	17698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022665	GAA	2	6	17957	17962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022665	GGT	2	6	18031	18036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022665	GTC	2	6	18045	18050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022665	CAT	2	6	18113	18118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022665	TAA	2	6	18148	18153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022665	GGA	2	6	18157	18162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022665	ATC	2	6	18181	18186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022665	CGC	2	6	18347	18352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_022665	CAC	2	6	18392	18397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_022665	GAT	2	6	18463	18468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022665	CCT	2	6	18519	18524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_022665	TCT	2	6	18554	18559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022665	AGG	2	6	18620	18625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022665	AAC	2	6	18655	18660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022665	GTT	2	6	18665	18670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022665	TAA	2	6	18812	18817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022665	AAC	2	6	18881	18886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022665	TAG	2	6	19053	19058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022665	AGG	2	6	19075	19080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022665	GAG	2	6	19088	19093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022665	CTC	2	6	19098	19103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_022665	AGA	2	6	19140	19145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022665	TCG	2	6	19243	19248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022665	GGA	2	6	19256	19261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022665	ACA	2	6	19374	19379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022665	ATG	2	6	19441	19446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022665	TAT	2	6	19506	19511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022665	GGA	2	6	19574	19579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022665	ACC	2	6	19840	19845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_022665	AAT	2	6	19860	19865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022665	AGC	2	6	19920	19925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022665	AAG	2	6	20057	20062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022665	GAG	2	6	20072	20077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022665	ACA	2	6	20228	20233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022665	GAT	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022665	AGG	2	6	20677	20682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022665	CGG	2	6	20723	20728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022665	TAC	2	6	20993	20998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022665	CCT	2	6	21081	21086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022665	GGT	2	6	21217	21222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022665	TCG	2	6	21332	21337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022665	CGT	2	6	21412	21417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022665	AGT	2	6	21905	21910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022665	CAG	2	6	21956	21961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022665	AGT	2	6	21982	21987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022665	ACC	2	6	22505	22510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_022665	CGT	2	6	22542	22547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022665	CGC	2	6	22935	22940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_022665	GGA	2	6	23039	23044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022665	TCC	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_022665	CTA	2	6	23132	23137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022665	AGC	2	6	23149	23154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022665	TCG	2	6	23163	23168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022665	CGG	2	6	23275	23280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022665	TAT	2	6	23323	23328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022665	GGT	2	6	23381	23386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022665	TAA	2	6	24912	24917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022665	GAG	2	6	24973	24978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022665	AGG	2	6	26339	26344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022665	CTT	2	6	27341	27346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022665	TAT	2	6	27369	27374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022665	AAC	2	6	30628	30633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022665	TGT	2	6	30642	30647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022665	CTT	2	6	45558	45563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022665	ATT	2	6	45594	45599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022665	GAA	2	6	45803	45808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022665	GAT	2	6	45810	45815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022665	TGG	2	6	45844	45849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022665	GAT	2	6	47658	47663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022665	ATT	2	6	47726	47731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022665	AAC	2	6	49812	49817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022665	ATC	3	9	50466	50474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022665	TAA	2	6	53150	53155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022665	AAG	2	6	53179	53184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022665	GAA	2	6	54171	54176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022665	GTC	2	6	54252	54257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022665	GAA	2	6	54284	54289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022665	ATT	2	6	54294	54299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022665	AGG	2	6	54369	54374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022665	CAA	2	6	55658	55663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022665	GTT	2	6	55677	55682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022665	AGT	2	6	55819	55824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022665	ACT	2	6	55917	55922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022665	AGC	2	6	55994	55999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022665	TGA	2	6	56027	56032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022665	TAT	2	6	56099	56104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022665	AAT	2	6	56173	56178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022665	AGG	2	6	57168	57173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022665	ATA	2	6	58557	58562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022665	GAA	2	6	58582	58587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022665	ATG	2	6	62919	62924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022665	ATA	2	6	63143	63148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022665	TGT	2	6	63166	63171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022665	AAG	2	6	64035	64040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022665	GGA	2	6	64049	64054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022665	CCT	2	6	65128	65133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022665	TCT	2	6	65157	65162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022665	AGG	2	6	65244	65249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022665	TAA	2	6	67745	67750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022665	ATA	2	6	67822	67827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022665	TAA	2	6	67842	67847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022665	AAT	2	6	68316	68321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022665	AAG	2	6	68354	68359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022665	AGT	2	6	69515	69520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022665	GAA	2	6	69867	69872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022665	TAT	2	6	70055	70060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022665	AGG	2	6	72186	72191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022665	ATC	2	6	73060	73065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022665	AGG	2	6	73419	73424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022665	TTG	2	6	75792	75797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022665	CTT	2	6	76997	77002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022665	TCG	2	6	77033	77038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022665	CTT	2	6	77045	77050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022665	CAT	2	6	77142	77147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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