MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiribacter sp. UAH-SP71

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022664	CGTCG	2	10	12	21	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_022664	TGGAC	2	10	3965	3974	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022664	GCCAC	2	10	10648	10657	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_022664	CGCGA	2	10	54434	54443	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_022664	CTCTG	2	10	92467	92476	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022664	GACGG	2	10	110309	110318	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022664	GATGG	2	10	112541	112550	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022664	AAGGA	2	10	132977	132986	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022664	GTGGC	2	10	156124	156133	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022664	CCGCC	2	10	159578	159587	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_022664	AAAGT	2	10	171254	171263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022664	CGGGG	2	10	174268	174277	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022664	CAACC	2	10	215096	215105	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_022664	GGTCA	2	10	243959	243968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022664	CGGAG	2	10	245678	245687	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022664	GACTG	2	10	252400	252409	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022664	GCGAA	2	10	259110	259119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022664	CGGGA	2	10	297173	297182	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022664	CGCAA	2	10	379112	379121	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022664	GACGA	2	10	391538	391547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022664	TGCGG	2	10	432362	432371	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022664	GAGAA	2	10	527906	527915	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022664	CTGTC	2	10	531160	531169	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_022664	CACCC	2	10	579045	579054	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_022664	TGCCT	2	10	579196	579205	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_022664	TCCGC	2	10	590340	590349	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_022664	GGGGC	2	10	600738	600747	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022664	GTTGG	2	10	664940	664949	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022664	CCTGA	2	10	667015	667024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_022664	GTCTT	2	10	667067	667076	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022664	GTCCG	2	10	671827	671836	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_022664	GCGCC	2	10	721883	721892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_022664	CCGGT	2	10	760302	760311	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022664	TCGCT	2	10	760322	760331	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_022664	GTGCG	2	10	816488	816497	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022664	GGCGT	2	10	825675	825684	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022664	CTGCT	2	10	828287	828296	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_022664	ATTGG	2	10	842121	842130	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022664	CATTT	2	10	868658	868667	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022664	GGAGC	2	10	873044	873053	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022664	GGGTG	2	10	893391	893400	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022664	GTCAG	2	10	957203	957212	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022664	ACCCA	2	10	1041950	1041959	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_022664	GGCAA	2	10	1069201	1069210	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022664	CGGCT	2	10	1099883	1099892	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_022664	ATTGC	2	10	1116546	1116555	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022664	TCGAC	2	10	1123147	1123156	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_022664	TTGCG	2	10	1212345	1212354	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022664	TGCGC	2	10	1231130	1231139	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_022664	TTGCT	2	10	1248203	1248212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022664	TCGAT	2	10	1275626	1275635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022664	CATGC	2	10	1281933	1281942	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_022664	CCCGT	2	10	1295089	1295098	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_022664	GATAG	2	10	1362316	1362325	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022664	CTCGA	2	10	1413512	1413521	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022664	TTGGG	2	10	1495110	1495119	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022664	ATCAG	2	10	1497186	1497195	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022664	TGGAT	2	10	1508430	1508439	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022664	ATGAG	2	10	1509919	1509928	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022664	TTTCA	2	10	1514357	1514366	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022664	ATCGA	2	10	1516103	1516112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022664	CCACC	2	10	1566678	1566687	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
63	NC_022664	GATGC	2	10	1586785	1586794	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022664	CGCCC	2	10	1609983	1609992	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
65	NC_022664	TCAAA	2	10	1665564	1665573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022664	CTTCT	2	10	1668168	1668177	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_022664	CCTGT	2	10	1678272	1678281	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_022664	GGTTG	2	10	1690213	1690222	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022664	ATCTT	2	10	1690277	1690286	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022664	CGATT	2	10	1721649	1721658	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022664	TGCTC	2	10	1727015	1727024	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_022664	GGAAT	2	10	1738576	1738585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022664	ATCTT	2	10	1738836	1738845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022664	CACGA	2	10	1742480	1742489	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_022664	CTGGT	2	10	1779659	1779668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022664	TGACC	2	10	1825036	1825045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_022664	CCGCG	2	10	1825568	1825577	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_022664	GCGGT	2	10	1829424	1829433	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022664	GCGCG	2	10	1829927	1829936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_022664	GCGCC	2	10	1834756	1834765	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_022664	CGCCC	2	10	1837936	1837945	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
82	NC_022664	CGCGC	3	15	1837946	1837960	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_022664	GATGC	2	10	1859461	1859470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022664	AGGAG	2	10	1880264	1880273	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022664	CGGTG	2	10	1881672	1881681	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022664	GCCGC	2	10	1892482	1892491	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_022664	TCAAT	2	10	1893326	1893335	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022664	TGTCG	2	10	1917054	1917063	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.