MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_3

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022662	CTC	2	6	735	740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556579592
2	NC_022662	AAC	2	6	826	831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579592
3	NC_022662	AAT	2	6	841	846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556579592
4	NC_022662	ACA	2	6	866	871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579592
5	NC_022662	AAT	2	6	963	968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556579592
6	NC_022662	TGA	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556579592
7	NC_022662	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556579592
8	NC_022662	TAA	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556579592
9	NC_022662	AAC	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579592
10	NC_022662	TGC	2	6	1113	1118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556579592
11	NC_022662	CAA	3	9	1133	1141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579592
12	NC_022662	CAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579592
13	NC_022662	TAT	2	6	1157	1162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556579592
14	NC_022662	CAA	2	6	1205	1210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579592
15	NC_022662	ACA	2	6	1277	1282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579592
16	NC_022662	CTG	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556579592
17	NC_022662	TTC	2	6	1515	1520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556579592
18	NC_022662	GCT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556579592
19	NC_022662	ATC	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556579592
20	NC_022662	CAT	2	6	1674	1679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556579593
21	NC_022662	ATA	2	6	1705	1710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556579593
22	NC_022662	ATC	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556579593
23	NC_022662	TAA	2	6	1862	1867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556579593
24	NC_022662	TGT	2	6	1927	1932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556579593
25	NC_022662	TTC	2	6	2097	2102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556579593
26	NC_022662	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556579593
27	NC_022662	CAT	3	9	2406	2414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556579593
28	NC_022662	GAT	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556579593
29	NC_022662	GTT	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556579593
30	NC_022662	GCA	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556579594
31	NC_022662	CAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579594
32	NC_022662	ACC	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556579594
33	NC_022662	TGC	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556579595
34	NC_022662	CTG	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556579595
35	NC_022662	CAG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556579595
36	NC_022662	CAG	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556579595
37	NC_022662	TGT	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556579595
38	NC_022662	TTC	2	6	3799	3804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556579595
39	NC_022662	TCG	2	6	3818	3823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556579595
40	NC_022662	TCC	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556579595
41	NC_022662	CGG	2	6	4128	4133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556579595
42	NC_022662	GTA	2	6	4220	4225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556579595
43	NC_022662	GGC	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556579595
44	NC_022662	TTC	2	6	4437	4442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556579595
45	NC_022662	CAG	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556579595
46	NC_022662	CCA	2	6	4554	4559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556579595
47	NC_022662	ATC	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556579595
48	NC_022662	CCA	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556579596
49	NC_022662	GGC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556579596
50	NC_022662	CGG	2	6	4761	4766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556579596
51	NC_022662	CGC	2	6	4819	4824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556579596
52	NC_022662	GTT	2	6	4838	4843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556579596
53	NC_022662	TCA	3	9	4876	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556579596
54	NC_022662	TCA	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556579597
55	NC_022662	GCT	2	6	5031	5036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556579597

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.