MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter coli 15-537360

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022660	TTTAAA	2	12	7604	7615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022660	AATTTA	2	12	21644	21655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022660	TATTTT	2	12	25030	25041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022660	CATTTT	2	12	26070	26081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022660	TCTTAT	2	12	42700	42711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022660	TATGTT	2	12	42865	42876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022660	ATTTAT	2	12	72933	72944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022660	ATTTTT	2	12	79208	79219	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022660	ATATAA	2	12	89066	89077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022660	ATTTTT	2	12	97964	97975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022660	AAAAAT	2	12	111066	111077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022660	AGTAAA	2	12	132476	132487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022660	TAAAAA	2	12	134221	134232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022660	TTATAG	2	12	134244	134255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022660	ATATTA	2	12	135221	135232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022660	TGCTAA	2	12	135588	135599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022660	AATTTA	2	12	136207	136218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022660	TATCAA	2	12	136494	136505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022660	AAATTT	2	12	136794	136805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022660	CAATAT	2	12	137004	137015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022660	AATAAA	2	12	142099	142110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022660	TAAAAA	2	12	175969	175980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022660	ATTTTT	2	12	176044	176055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022660	TCTTTT	2	12	182793	182804	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022660	TGCATT	2	12	183044	183055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022660	AAATTC	2	12	183963	183974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022660	ATTTTT	2	12	212535	212546	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022660	TAAAAA	2	12	243066	243077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022660	AAATAA	2	12	261753	261764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022660	AAAATT	2	12	279247	279258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022660	TTTATT	2	12	285440	285451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022660	AAAATT	2	12	303018	303029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022660	AGTTTA	2	12	362520	362531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022660	TCTTAT	2	12	435142	435153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022660	TATGTT	2	12	435307	435318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022660	ATTTTC	2	12	484720	484731	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022660	TAAAAC	2	12	522980	522991	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022660	TGATTT	2	12	551335	551346	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022660	AAATTT	2	12	568319	568330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022660	TTTATA	2	12	577906	577917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022660	TTATTT	2	12	592548	592559	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022660	AAAATA	2	12	592636	592647	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022660	ATTAAA	2	12	597079	597090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022660	ATATTT	2	12	597918	597929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022660	AAAATA	2	12	641173	641184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022660	TAAATT	2	12	643238	643249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022660	TATTTT	2	12	643274	643285	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022660	AAATTT	2	12	661037	661048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022660	TTTTTA	2	12	669778	669789	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022660	TCTTAT	2	12	697386	697397	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022660	TATGTT	2	12	697551	697562	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022660	GTTTGG	2	12	698317	698328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022660	TAAAAA	2	12	699578	699589	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022660	AATTAA	2	12	699629	699640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022660	TTAGCT	2	12	700111	700122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022660	CTTCTA	2	12	700129	700140	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022660	TTAATC	2	12	719169	719180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022660	ATCTTT	2	12	743917	743928	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022660	AATTAT	2	12	759570	759581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022660	TTAAAA	2	12	766994	767005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022660	ATTATA	2	12	804584	804595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022660	ACTTCA	2	12	804611	804622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022660	AAGAAA	2	12	805655	805666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022660	ATTTTA	2	12	810250	810261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022660	TATAAA	2	12	855759	855770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022660	AATTTA	2	12	855883	855894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022660	AGTAAA	2	12	891631	891642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022660	CAAAAT	2	12	895779	895790	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022660	TTAAAA	2	12	909643	909654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022660	AAATTT	2	12	910984	910995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022660	TTAAAA	2	12	912106	912117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022660	ATGCAA	2	12	912132	912143	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022660	AATATC	2	12	918370	918381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022660	AAAACT	2	12	943576	943587	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022660	TACCTA	2	12	944176	944187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022660	CTTTTT	2	12	989946	989957	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022660	TTAAGA	2	12	989972	989983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022660	GTGGGA	2	12	990045	990056	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022660	CTCTAA	2	12	993753	993764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022660	ATTTTT	2	12	993948	993959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022660	TGTTTT	2	12	1013068	1013079	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022660	ATTTTA	2	12	1040356	1040367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022660	TTCATA	2	12	1042625	1042636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022660	TTAAAA	2	12	1076496	1076507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022660	TAAAAA	2	12	1083114	1083125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022660	GTTAAA	2	12	1103212	1103223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022660	TTTAAT	2	12	1135220	1135231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022660	TGAAGT	2	12	1193982	1193993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022660	TATAAT	2	12	1194009	1194020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022660	AAATAA	2	12	1215432	1215443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022660	ATAAAA	2	12	1243756	1243767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022660	TTAAAA	2	12	1243809	1243820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022660	TATTTT	2	12	1263187	1263198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022660	CATTAT	2	12	1263708	1263719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022660	CTTTTA	2	12	1309121	1309132	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022660	ATCCAA	2	12	1319116	1319127	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022660	TAAAAA	2	12	1320183	1320194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022660	TTTAAT	2	12	1328045	1328056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022660	TTAAAA	2	12	1352633	1352644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022660	TAATTT	2	12	1354314	1354325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022660	GTTATG	2	12	1419567	1419578	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022660	ATACAC	2	12	1419726	1419737	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022660	TTTTTA	2	12	1432637	1432648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022660	TTTTAA	2	12	1452368	1452379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022660	AAATGA	2	12	1457499	1457510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022660	CTTAAA	2	12	1460919	1460930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022660	AAATTT	2	12	1460963	1460974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022660	TTTAAA	2	12	1464518	1464529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022660	AAAATA	2	12	1475699	1475710	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022660	TCAAAA	2	12	1475793	1475804	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022660	TATTTT	2	12	1484299	1484310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022660	CATAAA	2	12	1512566	1512577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022660	ATAAAA	2	12	1517130	1517141	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022660	AATATT	2	12	1540578	1540589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022660	TAATAT	2	12	1540719	1540730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022660	TAAAAA	2	12	1547535	1547546	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022660	TTTTAA	2	12	1554912	1554923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022660	TCTTTA	2	12	1569605	1569616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022660	TTTAAT	2	12	1572318	1572329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022660	AAAAAT	2	12	1608535	1608546	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022660	AGAAAA	2	12	1609970	1609981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022660	AAAATG	2	12	1640923	1640934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022660	AATTCT	2	12	1641841	1641852	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.