MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter coli 15-537360

Total Repeats: 929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022660	TGCAAA	2	12	1694	1705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556577983
2	NC_022660	TATAGA	2	12	2757	2768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556577984
3	NC_022660	TGCTAG	2	12	3474	3485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556577984
4	NC_022660	AGTGAA	2	12	3820	3831	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556577984
5	NC_022660	AATGAA	2	12	4489	4500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556577984
6	NC_022660	CTATAG	2	12	8066	8077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556577986
7	NC_022660	TGGATT	2	12	9128	9139	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556577986
8	NC_022660	AGAAAT	2	12	10530	10541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556577988
9	NC_022660	ATTTAA	2	12	13413	13424	50 %	50 %	0 %	0 %	556577989
10	NC_022660	TTTTCA	2	12	18271	18282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556577992
11	NC_022660	AAGAAA	2	12	21824	21835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	556577995
12	NC_022660	AAGATA	2	12	22748	22759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556577996
13	NC_022660	AGCAAA	2	12	23522	23533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	556577996
14	NC_022660	TTTTCT	2	12	24032	24043	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556577997
15	NC_022660	GCAAGG	2	12	25570	25581	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	556577999
16	NC_022660	CGAGCT	2	12	27560	27571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556578001
17	NC_022660	CGCCAC	2	12	33503	33514	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556578004
18	NC_022660	TAAAAA	2	12	35087	35098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578005
19	NC_022660	TTAAAT	2	12	45284	45295	50 %	50 %	0 %	0 %	556578009
20	NC_022660	TAAATT	2	12	49505	49516	50 %	50 %	0 %	0 %	556578010
21	NC_022660	GAAAAT	2	12	49938	49949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578011
22	NC_022660	GAAAGA	2	12	51047	51058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556578011
23	NC_022660	TAAAAA	2	12	51077	51088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578011
24	NC_022660	TGTTAA	2	12	51647	51658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556578011
25	NC_022660	TGAAAA	2	12	54756	54767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578014
26	NC_022660	TAAACT	2	12	55209	55220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578014
27	NC_022660	TCTTCA	2	12	55879	55890	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578015
28	NC_022660	TTCTTT	2	12	56362	56373	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556578016
29	NC_022660	CGCCTT	2	12	56767	56778	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	556578016
30	NC_022660	TTAATT	2	12	60339	60350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578018
31	NC_022660	CAAAAT	2	12	60467	60478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578018
32	NC_022660	ACAAAT	2	12	60665	60676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578019
33	NC_022660	TAATTT	2	12	63175	63186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578021
34	NC_022660	ATTTTA	2	12	63427	63438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578021
35	NC_022660	AAATAT	2	12	63784	63795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556578021
36	NC_022660	GTTGGA	2	12	64724	64735	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	556578021
37	NC_022660	ATTTTA	2	12	65279	65290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578022
38	NC_022660	GCTATT	2	12	66347	66358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	556578023
39	NC_022660	TTGCTT	2	12	67376	67387	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556578023
40	NC_022660	ACGCAC	2	12	73182	73193	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556578028
41	NC_022660	GCTTTA	2	12	73848	73859	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	556578029
42	NC_022660	AATATC	2	12	75256	75267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578030
43	NC_022660	TCATTT	2	12	76204	76215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578032
44	NC_022660	CATCTT	2	12	77919	77930	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578033
45	NC_022660	TTCTTT	2	12	78369	78380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556578034
46	NC_022660	TTTAAA	2	12	80356	80367	50 %	50 %	0 %	0 %	556578036
47	NC_022660	GATGCT	2	12	82233	82244	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556578038
48	NC_022660	TTGGAT	2	12	83561	83572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556578040
49	NC_022660	TTTTTG	2	12	89439	89450	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	556578045
50	NC_022660	TGGTTA	2	12	90645	90656	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556578046
51	NC_022660	CGAGTT	2	12	92068	92079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556578047
52	NC_022660	CAGGAA	2	12	96894	96905	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	556578053
53	NC_022660	GATTAT	2	12	98645	98656	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556578054
54	NC_022660	TTTTGA	2	12	98965	98976	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	556578054
55	NC_022660	TTTTTA	2	12	100003	100014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	556578056
56	NC_022660	AGCTTA	2	12	102272	102283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578059
57	NC_022660	AAAAAT	2	12	103841	103852	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578061
58	NC_022660	TATCAA	2	12	105487	105498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578063
59	NC_022660	AAAAAC	2	12	109119	109130	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	556578067
60	NC_022660	TCCAAG	2	12	109233	109244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556578067
61	NC_022660	AGCCGC	2	12	110400	110411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556578067
62	NC_022660	GCTTCT	2	12	110521	110532	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	556578067
63	NC_022660	CTTTAT	2	12	110702	110713	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578067
64	NC_022660	TCTAGC	2	12	111318	111329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556578068
65	NC_022660	TAAAAA	2	12	112195	112206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578069
66	NC_022660	TTTGCT	2	12	113428	113439	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556578070
67	NC_022660	TAAAGA	2	12	114387	114398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578072
68	NC_022660	ATAAAA	2	12	114581	114592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578072
69	NC_022660	CTATAG	2	12	115343	115354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578073
70	NC_022660	GCGCAA	2	12	115577	115588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556578073
71	NC_022660	CTAAAA	2	12	116261	116272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578074
72	NC_022660	TTCAAA	2	12	116286	116297	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578074
73	NC_022660	ATTTTC	2	12	116847	116858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578075
74	NC_022660	CAAAAA	2	12	118102	118113	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	556578076
75	NC_022660	TAGCAA	2	12	118419	118430	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556578077
76	NC_022660	AGCATT	2	12	118721	118732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578077
77	NC_022660	ATCTTT	2	12	120050	120061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578079
78	NC_022660	AAATTT	2	12	121050	121061	50 %	50 %	0 %	0 %	556578079
79	NC_022660	TAAATT	2	12	122372	122383	50 %	50 %	0 %	0 %	556578080
80	NC_022660	TTTTGG	2	12	123040	123051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556578081
81	NC_022660	TATCTC	2	12	124445	124456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578083
82	NC_022660	AAAGAT	2	12	129647	129658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578089
83	NC_022660	CAAGTT	2	12	139345	139356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578091
84	NC_022660	GCCATA	2	12	139646	139657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556578091
85	NC_022660	CTTTTG	2	12	140014	140025	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556578092
86	NC_022660	GAAGAT	2	12	140214	140225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556578093
87	NC_022660	ATACAA	2	12	140521	140532	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578093
88	NC_022660	TAATTT	2	12	142438	142449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578096
89	NC_022660	AAATTA	2	12	143032	143043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556578097
90	NC_022660	TACAAA	2	12	146313	146324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578099
91	NC_022660	TAAAAA	2	12	146639	146650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578100
92	NC_022660	TCTCAT	2	12	147524	147535	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556578101
93	NC_022660	GTTTGT	2	12	148026	148037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556578102
94	NC_022660	ATAACT	2	12	148186	148197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556578102
95	NC_022660	AGCATT	2	12	156402	156413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556578108
96	NC_022660	CAAAAT	2	12	158248	158259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556578110
97	NC_022660	TATAAT	2	12	158938	158949	50 %	50 %	0 %	0 %	556578111
98	NC_022660	ATAATT	2	12	160190	160201	50 %	50 %	0 %	0 %	556578111
99	NC_022660	TTATAT	2	12	161499	161510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578112
100	NC_022660	GAAAAT	2	12	161812	161823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578112
101	NC_022660	AGTTTT	2	12	165443	165454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	556578117
102	NC_022660	TTTAAA	2	12	168694	168705	50 %	50 %	0 %	0 %	556578120
103	NC_022660	ATCTTT	2	12	170127	170138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578122
104	NC_022660	GATATT	2	12	171182	171193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556578123
105	NC_022660	AAAATA	2	12	172287	172298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	556578125
106	NC_022660	CTAAAG	2	12	173047	173058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556578126
107	NC_022660	ATTTTC	2	12	173459	173470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578126
108	NC_022660	GTTTTT	2	12	174999	175010	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	556578127
109	NC_022660	TAACTT	2	12	175387	175398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	556578128
110	NC_022660	TACTTT	2	12	179312	179323	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556578135
111	NC_022660	TGCAAC	2	12	184036	184047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556578139
112	NC_022660	CTAAAG	2	12	184424	184435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556578139
113	NC_022660	TACTTA	2	12	185325	185336	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	556578141
114	NC_022660	TAAATT	2	12	186362	186373	50 %	50 %	0 %	0 %	556578142
115	NC_022660	GAAAAA	2	12	186983	186994	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	556578142
116	NC_022660	AATTTG	2	12	188867	188878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556578144
117	NC_022660	TGGCTT	2	12	194302	194313	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	556578147
118	NC_022660	ATATTT	2	12	199874	199885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578156
119	NC_022660	TTTTGC	2	12	201296	201307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556578157
120	NC_022660	GTGCAA	2	12	202690	202701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556578157
121	NC_022660	TTTAAT	2	12	203871	203882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556578158
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235	NC_022660	TTTGAT	2	12	406972	406983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	556578360
236	NC_022660	TAAAAG	2	12	407138	407149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556578360
237	NC_022660	ATTTGA	2	12	407398	407409	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556578361
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240	NC_022660	AATATT	2	12	415082	415093	50 %	50 %	0 %	0 %	556578367
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