MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter coli 15-537360

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022660	GAAAA	2	10	1336	1345	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022660	AAAAT	2	10	6374	6383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022660	TTTTA	2	10	9714	9723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022660	TTTTA	2	10	25075	25084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022660	GGTAA	2	10	37209	37218	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022660	TCGTG	2	10	38005	38014	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022660	TCTTT	2	10	38943	38952	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022660	TTAAA	2	10	39018	39027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022660	CCGTA	2	10	40948	40957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022660	TAAAA	2	10	42363	42372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022660	AAGAT	2	10	42415	42424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022660	AGCTT	2	10	52312	52321	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022660	AAATT	2	10	65805	65814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022660	TTAAA	2	10	66127	66136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022660	TTTAT	2	10	69714	69723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022660	GAGCA	2	10	72141	72150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022660	TAAGT	2	10	72390	72399	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022660	ATCAA	2	10	72622	72631	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022660	TTTTG	2	10	82559	82568	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022660	AAAAT	2	10	87146	87155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022660	TTTTA	2	10	88931	88940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022660	AATTT	2	10	93057	93066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022660	ATTAA	2	10	95131	95140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022660	TAAAA	2	10	108336	108345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022660	TAATT	2	10	132021	132030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022660	GGTAG	2	10	132142	132151	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022660	CAAAA	2	10	132331	132340	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022660	GCAAA	2	10	132672	132681	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022660	AAATC	2	10	134527	134536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022660	AAAAT	2	10	135326	135335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022660	CGATT	2	10	135564	135573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022660	GATCT	2	10	135707	135716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022660	AAACG	2	10	136452	136461	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022660	GAAAT	2	10	136766	136775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022660	TAAAA	2	10	137121	137130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022660	TTTAA	2	10	138454	138463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022660	TTGGA	2	10	138704	138713	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022660	CAAAG	2	10	141138	141147	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022660	TGATT	2	10	142068	142077	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022660	TTCAC	2	10	142968	142977	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_022660	ATCAA	2	10	150121	150130	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022660	TGGAT	2	10	151765	151774	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022660	TGTAT	2	10	152853	152862	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022660	TAAAA	2	10	179493	179502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022660	TAGCA	2	10	182220	182229	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022660	TTCTT	2	10	182829	182838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022660	CATTG	2	10	183308	183317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022660	TTAAA	2	10	184892	184901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022660	ATTTT	2	10	196626	196635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022660	TTTTG	2	10	212474	212483	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022660	AAGTG	2	10	212764	212773	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022660	ACCTA	2	10	212877	212886	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_022660	AAGTG	2	10	224192	224201	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022660	ATTTG	2	10	224236	224245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022660	TTGCT	2	10	233267	233276	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022660	AGATA	2	10	233505	233514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022660	TTTAT	2	10	233876	233885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022660	CTTTT	2	10	255229	255238	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022660	GAAAG	2	10	255262	255271	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022660	TTTAT	2	10	257068	257077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022660	AAAAT	2	10	259015	259024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022660	TTTTA	2	10	263993	264002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022660	AAAAT	2	10	271894	271903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022660	ATTTT	2	10	279327	279336	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022660	TGCTT	2	10	285497	285506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022660	TTAAA	2	10	285798	285807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022660	AAAAG	2	10	299409	299418	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022660	TAAAA	2	10	299922	299931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022660	CAGCC	2	10	301660	301669	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_022660	AAGTA	2	10	301952	301961	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022660	GCACA	2	10	302290	302299	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_022660	ATAAA	2	10	302971	302980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022660	ACTAA	2	10	322510	322519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022660	TATAA	3	15	339444	339458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022660	TTATC	2	10	351632	351641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022660	ATTTT	2	10	351942	351951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022660	TTTTA	2	10	357322	357331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022660	ATATA	2	10	367280	367289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022660	TTTTA	2	10	375894	375903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022660	TAAGA	2	10	408258	408267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022660	TTATT	2	10	421079	421088	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022660	TCTTA	2	10	421262	421271	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022660	ATTTT	2	10	421926	421935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022660	TTTTA	2	10	425173	425182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022660	GGTAA	2	10	429651	429660	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022660	TCGTG	2	10	430447	430456	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022660	TCTTT	2	10	431385	431394	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022660	TTAAA	2	10	431460	431469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022660	CCGTA	2	10	433390	433399	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_022660	TAAAA	2	10	434805	434814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022660	AAGAT	2	10	434857	434866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022660	TTTAT	2	10	435866	435875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022660	CTTAA	2	10	451342	451351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022660	TTAAA	2	10	453474	453483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022660	AAAAG	2	10	461006	461015	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022660	GATTT	2	10	485283	485292	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022660	TTTAG	2	10	492861	492870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022660	TTTTA	2	10	492879	492888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022660	ATTTT	2	10	495297	495306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022660	AAAAT	2	10	523046	523055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022660	AAAAT	2	10	539075	539084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022660	GTTTT	2	10	542167	542176	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022660	TTATT	2	10	542467	542476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022660	AAAAT	2	10	551121	551130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022660	AAGTA	2	10	551532	551541	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022660	TAAAA	2	10	552880	552889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022660	TTTAA	2	10	583917	583926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022660	ATTTT	2	10	592695	592704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022660	GATAA	2	10	597984	597993	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022660	CTTTA	2	10	610157	610166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022660	GAAAA	2	10	614489	614498	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022660	TAAAA	2	10	647194	647203	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022660	GAAAG	2	10	649560	649569	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022660	AATTT	2	10	650783	650792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022660	TATTT	2	10	657511	657520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022660	GCTTT	2	10	659479	659488	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022660	ATTTT	2	10	674184	674193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022660	TATCA	2	10	679901	679910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022660	GGTAA	2	10	691895	691904	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022660	TCGTG	2	10	692691	692700	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022660	TCTTT	2	10	693629	693638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022660	TTAAA	2	10	693704	693713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022660	CCGTA	2	10	695634	695643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_022660	TAAAA	2	10	697049	697058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022660	AAGAT	2	10	697101	697110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022660	TTTAT	2	10	698110	698119	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022660	TAAAT	2	10	698374	698383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022660	AATTA	2	10	698398	698407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022660	TTTTA	2	10	698502	698511	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022660	GCAAA	2	10	699190	699199	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022660	AATCA	2	10	699328	699337	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022660	AAAGC	2	10	699856	699865	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022660	ATTTT	2	10	700892	700901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022660	ATTAA	2	10	701136	701145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022660	ATTTT	2	10	707679	707688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022660	ATTTG	2	10	707707	707716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022660	TAAAA	2	10	707750	707759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022660	TTAAA	2	10	719302	719311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022660	AAATA	2	10	724827	724836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022660	ATTAG	2	10	728468	728477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022660	ATTTT	2	10	728596	728605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022660	TAAGA	2	10	743887	743896	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022660	TTTAA	2	10	749839	749848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022660	AATTT	2	10	758519	758528	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022660	TAAAT	2	10	779056	779065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022660	AATAA	2	10	780255	780264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022660	TAAAA	2	10	787771	787780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022660	TTTGC	2	10	791501	791510	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.