MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 3178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022658	GCGTC	2	10	1329	1338	0 %	20 %	40 %	40 %	556574297
2	NC_022658	CCGGC	2	10	2325	2334	0 %	0 %	40 %	60 %	556574297
3	NC_022658	GCGCG	2	10	3039	3048	0 %	0 %	60 %	40 %	556573384
4	NC_022658	CGGCC	2	10	5002	5011	0 %	0 %	40 %	60 %	556574384
5	NC_022658	CGCGC	2	10	7562	7571	0 %	0 %	40 %	60 %	556572417
6	NC_022658	GGCAC	2	10	9014	9023	20 %	0 %	40 %	40 %	556572139
7	NC_022658	GCGTC	2	10	9726	9735	0 %	20 %	40 %	40 %	556572139
8	NC_022658	GCGCC	2	10	10939	10948	0 %	0 %	40 %	60 %	556572373
9	NC_022658	GGCGC	2	10	11569	11578	0 %	0 %	60 %	40 %	556572373
10	NC_022658	GGCAA	2	10	13815	13824	40 %	0 %	40 %	20 %	556573401
11	NC_022658	CGGTG	2	10	14058	14067	0 %	20 %	60 %	20 %	556573401
12	NC_022658	GCCGC	2	10	14200	14209	0 %	0 %	40 %	60 %	556572976
13	NC_022658	TGCGC	2	10	15654	15663	0 %	20 %	40 %	40 %	556572856
14	NC_022658	GCGTC	2	10	15672	15681	0 %	20 %	40 %	40 %	556572856
15	NC_022658	CGAGC	2	10	15691	15700	20 %	0 %	40 %	40 %	556572856
16	NC_022658	GCGCG	2	10	16924	16933	0 %	0 %	60 %	40 %	556571843
17	NC_022658	CGCGA	2	10	17960	17969	20 %	0 %	40 %	40 %	556571843
18	NC_022658	GTCGC	2	10	18041	18050	0 %	20 %	40 %	40 %	556571843
19	NC_022658	GCGCG	2	10	18813	18822	0 %	0 %	60 %	40 %	556574339
20	NC_022658	GCATC	2	10	19137	19146	20 %	20 %	20 %	40 %	556574339
21	NC_022658	CAGAT	2	10	20613	20622	40 %	20 %	20 %	20 %	556573075
22	NC_022658	GCCGT	2	10	21252	21261	0 %	20 %	40 %	40 %	556573075
23	NC_022658	CGTGG	2	10	23914	23923	0 %	20 %	60 %	20 %	556574424
24	NC_022658	CCGGG	2	10	25954	25963	0 %	0 %	60 %	40 %	556573186
25	NC_022658	ACGTC	2	10	26399	26408	20 %	20 %	20 %	40 %	556572311
26	NC_022658	TTGCC	2	10	26413	26422	0 %	40 %	20 %	40 %	556572311
27	NC_022658	GCGCC	2	10	26648	26657	0 %	0 %	40 %	60 %	556572311
28	NC_022658	CGCGC	2	10	28698	28707	0 %	0 %	40 %	60 %	556572311
29	NC_022658	CGTCG	2	10	29037	29046	0 %	20 %	40 %	40 %	556572311
30	NC_022658	CTTCC	2	10	30821	30830	0 %	40 %	0 %	60 %	556573095
31	NC_022658	TGTAA	2	10	31576	31585	40 %	40 %	20 %	0 %	556572828
32	NC_022658	CGCGC	2	10	31741	31750	0 %	0 %	40 %	60 %	556572828
33	NC_022658	TCGCC	2	10	32260	32269	0 %	20 %	20 %	60 %	556572828
34	NC_022658	CGCGC	3	15	32478	32492	0 %	0 %	40 %	60 %	556572828
35	NC_022658	CGGCC	2	10	32797	32806	0 %	0 %	40 %	60 %	556572828
36	NC_022658	CGGTC	2	10	32960	32969	0 %	20 %	40 %	40 %	556572828
37	NC_022658	AGCGC	2	10	34018	34027	20 %	0 %	40 %	40 %	556572828
38	NC_022658	GAAAT	2	10	34085	34094	60 %	20 %	20 %	0 %	556572828
39	NC_022658	GGCCG	2	10	34514	34523	0 %	0 %	60 %	40 %	556572828
40	NC_022658	GCCGC	2	10	35184	35193	0 %	0 %	40 %	60 %	556572828
41	NC_022658	CGGAA	2	10	37081	37090	40 %	0 %	40 %	20 %	556572274
42	NC_022658	CGGCG	2	10	39021	39030	0 %	0 %	60 %	40 %	556572974
43	NC_022658	TGCCT	2	10	40106	40115	0 %	40 %	20 %	40 %	556573462
44	NC_022658	CGGCG	2	10	40195	40204	0 %	0 %	60 %	40 %	556573462
45	NC_022658	ATCGC	2	10	41105	41114	20 %	20 %	20 %	40 %	556573988
46	NC_022658	CGGGC	2	10	45560	45569	0 %	0 %	60 %	40 %	556573476
47	NC_022658	CGCGG	2	10	45671	45680	0 %	0 %	60 %	40 %	556573476
48	NC_022658	CGGCG	2	10	45905	45914	0 %	0 %	60 %	40 %	556573476
49	NC_022658	TCGCG	2	10	46695	46704	0 %	20 %	40 %	40 %	556573207
50	NC_022658	GCGCG	2	10	46736	46745	0 %	0 %	60 %	40 %	556573207
51	NC_022658	GCGCG	2	10	46949	46958	0 %	0 %	60 %	40 %	556572862
52	NC_022658	CCGGG	2	10	49354	49363	0 %	0 %	60 %	40 %	556574387
53	NC_022658	ACGCC	2	10	50657	50666	20 %	0 %	20 %	60 %	556572626
54	NC_022658	CGTCG	2	10	50928	50937	0 %	20 %	40 %	40 %	556572626
55	NC_022658	CGGCG	2	10	55679	55688	0 %	0 %	60 %	40 %	556573650
56	NC_022658	CTTGC	2	10	60040	60049	0 %	40 %	20 %	40 %	556574288
57	NC_022658	CGCGG	2	10	60589	60598	0 %	0 %	60 %	40 %	556573657
58	NC_022658	CGCGG	2	10	61158	61167	0 %	0 %	60 %	40 %	556573657
59	NC_022658	CGCGC	2	10	63214	63223	0 %	0 %	40 %	60 %	556573100
60	NC_022658	CGCGC	2	10	63481	63490	0 %	0 %	40 %	60 %	556573100
61	NC_022658	CGCGG	2	10	63619	63628	0 %	0 %	60 %	40 %	556573100
62	NC_022658	CGCGC	2	10	64807	64816	0 %	0 %	40 %	60 %	556574157
63	NC_022658	GCGCG	2	10	65620	65629	0 %	0 %	60 %	40 %	556573933
64	NC_022658	GCCGC	2	10	65770	65779	0 %	0 %	40 %	60 %	556573933
65	NC_022658	CGACG	2	10	67136	67145	20 %	0 %	40 %	40 %	556574435
66	NC_022658	GCTGC	2	10	68503	68512	0 %	20 %	40 %	40 %	556574034
67	NC_022658	GCGCG	2	10	68909	68918	0 %	0 %	60 %	40 %	556574034
68	NC_022658	CGGCG	2	10	70102	70111	0 %	0 %	60 %	40 %	556573682
69	NC_022658	TGTGC	2	10	70354	70363	0 %	40 %	40 %	20 %	556573682
70	NC_022658	GCGTC	2	10	72701	72710	0 %	20 %	40 %	40 %	556572215
71	NC_022658	GGCCG	2	10	74386	74395	0 %	0 %	60 %	40 %	556572755
72	NC_022658	GCGCC	2	10	75124	75133	0 %	0 %	40 %	60 %	556572755
73	NC_022658	CGGCG	2	10	75585	75594	0 %	0 %	60 %	40 %	556571832
74	NC_022658	CGCGC	2	10	76907	76916	0 %	0 %	40 %	60 %	556573175
75	NC_022658	CCGCG	2	10	78116	78125	0 %	0 %	40 %	60 %	556572803
76	NC_022658	CGCCC	2	10	79839	79848	0 %	0 %	20 %	80 %	556573873
77	NC_022658	GCGCG	2	10	79944	79953	0 %	0 %	60 %	40 %	556573873
78	NC_022658	GACGT	2	10	80029	80038	20 %	20 %	40 %	20 %	556573873
79	NC_022658	CGACA	2	10	81607	81616	40 %	0 %	20 %	40 %	556572175
80	NC_022658	ATCGA	2	10	82843	82852	40 %	20 %	20 %	20 %	556572393
81	NC_022658	GTCGC	2	10	82886	82895	0 %	20 %	40 %	40 %	556572393
82	NC_022658	CGCAC	2	10	83200	83209	20 %	0 %	20 %	60 %	556572393
83	NC_022658	ACGCG	2	10	83909	83918	20 %	0 %	40 %	40 %	556572393
84	NC_022658	CGAAT	2	10	83946	83955	40 %	20 %	20 %	20 %	556572393
85	NC_022658	CCTGC	2	10	86472	86481	0 %	20 %	20 %	60 %	556574029
86	NC_022658	ATCGC	2	10	86539	86548	20 %	20 %	20 %	40 %	556574029
87	NC_022658	GCGCC	2	10	88508	88517	0 %	0 %	40 %	60 %	556573342
88	NC_022658	CGTGC	2	10	88761	88770	0 %	20 %	40 %	40 %	556573342
89	NC_022658	TCGGC	2	10	89147	89156	0 %	20 %	40 %	40 %	556573342
90	NC_022658	CCTGC	2	10	89818	89827	0 %	20 %	20 %	60 %	556572147
91	NC_022658	GCGCC	2	10	89953	89962	0 %	0 %	40 %	60 %	556572147
92	NC_022658	TGCGC	2	10	91352	91361	0 %	20 %	40 %	40 %	556574444
93	NC_022658	GCGCC	2	10	91666	91675	0 %	0 %	40 %	60 %	556574444
94	NC_022658	CGGCG	2	10	93289	93298	0 %	0 %	60 %	40 %	556572059
95	NC_022658	CCGCG	2	10	93943	93952	0 %	0 %	40 %	60 %	556572059
96	NC_022658	CGAGC	2	10	94159	94168	20 %	0 %	40 %	40 %	556572059
97	NC_022658	GATCG	2	10	97316	97325	20 %	20 %	40 %	20 %	556573119
98	NC_022658	CGAGC	2	10	98252	98261	20 %	0 %	40 %	40 %	556573119
99	NC_022658	CGCGC	2	10	104828	104837	0 %	0 %	40 %	60 %	556572157
100	NC_022658	GCGCC	2	10	105920	105929	0 %	0 %	40 %	60 %	556572966
101	NC_022658	GCCGC	2	10	108217	108226	0 %	0 %	40 %	60 %	556573734
102	NC_022658	GCGCC	2	10	109688	109697	0 %	0 %	40 %	60 %	556573945
103	NC_022658	CGAGC	2	10	109807	109816	20 %	0 %	40 %	40 %	556572917
104	NC_022658	CGCGC	2	10	110652	110661	0 %	0 %	40 %	60 %	556572366
105	NC_022658	ACGCG	2	10	111895	111904	20 %	0 %	40 %	40 %	556572262
106	NC_022658	TCGGC	2	10	112352	112361	0 %	20 %	40 %	40 %	556574285
107	NC_022658	GCCGG	2	10	113910	113919	0 %	0 %	60 %	40 %	556574433
108	NC_022658	GCCGC	2	10	114740	114749	0 %	0 %	40 %	60 %	556572204
109	NC_022658	TCGCG	2	10	115011	115020	0 %	20 %	40 %	40 %	556572204
110	NC_022658	CTCGC	2	10	117182	117191	0 %	20 %	20 %	60 %	556572275
111	NC_022658	CAGCA	2	10	119958	119967	40 %	0 %	20 %	40 %	556572892
112	NC_022658	AGCCG	2	10	120415	120424	20 %	0 %	40 %	40 %	556572892
113	NC_022658	CGGCG	2	10	120785	120794	0 %	0 %	60 %	40 %	556572537
114	NC_022658	AACTG	2	10	120952	120961	40 %	20 %	20 %	20 %	556572537
115	NC_022658	ACCGC	2	10	122343	122352	20 %	0 %	20 %	60 %	556574215
116	NC_022658	GCCGC	2	10	122720	122729	0 %	0 %	40 %	60 %	556574215
117	NC_022658	TCGAT	2	10	124230	124239	20 %	40 %	20 %	20 %	556573230
118	NC_022658	GACGC	2	10	125433	125442	20 %	0 %	40 %	40 %	556572822
119	NC_022658	GCGCG	2	10	129179	129188	0 %	0 %	60 %	40 %	556571817
120	NC_022658	CGCGC	2	10	129204	129213	0 %	0 %	40 %	60 %	556571817
121	NC_022658	GCCGC	2	10	129477	129486	0 %	0 %	40 %	60 %	556571817
122	NC_022658	GATCC	2	10	129954	129963	20 %	20 %	20 %	40 %	556573897
123	NC_022658	GCCCG	2	10	130429	130438	0 %	0 %	40 %	60 %	556574002
124	NC_022658	TCGCC	2	10	132075	132084	0 %	20 %	20 %	60 %	556572235
125	NC_022658	GCAGC	2	10	133340	133349	20 %	0 %	40 %	40 %	556572297
126	NC_022658	TCGCG	2	10	133504	133513	0 %	20 %	40 %	40 %	556572297
127	NC_022658	TGCGC	2	10	133555	133564	0 %	20 %	40 %	40 %	556572297
128	NC_022658	GCGCC	2	10	133597	133606	0 %	0 %	40 %	60 %	556572297
129	NC_022658	TCGGC	2	10	137142	137151	0 %	20 %	40 %	40 %	556572645
130	NC_022658	CATTG	2	10	137794	137803	20 %	40 %	20 %	20 %	556572645
131	NC_022658	CGACG	2	10	138344	138353	20 %	0 %	40 %	40 %	556572218
132	NC_022658	CGGCG	2	10	139227	139236	0 %	0 %	60 %	40 %	556572218
133	NC_022658	GCGCG	2	10	139240	139249	0 %	0 %	60 %	40 %	556572218
134	NC_022658	CGGCG	2	10	140259	140268	0 %	0 %	60 %	40 %	556573394
135	NC_022658	ACGCG	2	10	141076	141085	20 %	0 %	40 %	40 %	556572604
136	NC_022658	GCGCC	2	10	141490	141499	0 %	0 %	40 %	60 %	556572604
137	NC_022658	CCGGG	2	10	142135	142144	0 %	0 %	60 %	40 %	556572672
138	NC_022658	CAGCG	2	10	142277	142286	20 %	0 %	40 %	40 %	556572672
139	NC_022658	CGTCG	2	10	147378	147387	0 %	20 %	40 %	40 %	556573640
140	NC_022658	GTTCC	2	10	148778	148787	0 %	40 %	20 %	40 %	556574147
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143	NC_022658	GCGCC	2	10	149435	149444	0 %	0 %	40 %	60 %	556574147
144	NC_022658	TCAGC	2	10	149956	149965	20 %	20 %	20 %	40 %	556573596
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149	NC_022658	GCGCG	3	15	152636	152650	0 %	0 %	60 %	40 %	556573233
150	NC_022658	CGCCC	2	10	154248	154257	0 %	0 %	20 %	80 %	556572453
151	NC_022658	CGCCC	2	10	156374	156383	0 %	0 %	20 %	80 %	556572562
152	NC_022658	GCCGC	2	10	156648	156657	0 %	0 %	40 %	60 %	556572562
153	NC_022658	GCCGC	2	10	157700	157709	0 %	0 %	40 %	60 %	556573724
154	NC_022658	GCCGT	2	10	158935	158944	0 %	20 %	40 %	40 %	556573437
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167	NC_022658	TACGC	2	10	169634	169643	20 %	20 %	20 %	40 %	556574353
168	NC_022658	GCGCC	2	10	171200	171209	0 %	0 %	40 %	60 %	556574041
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171	NC_022658	CGGCG	2	10	174724	174733	0 %	0 %	60 %	40 %	556571975
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191	NC_022658	GCCGC	2	10	193608	193617	0 %	0 %	40 %	60 %	556573062
192	NC_022658	CGCGC	2	10	195145	195154	0 %	0 %	40 %	60 %	556571951
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194	NC_022658	CGGCG	2	10	195446	195455	0 %	0 %	60 %	40 %	556571951
195	NC_022658	GCGCG	2	10	197499	197508	0 %	0 %	60 %	40 %	556572185
196	NC_022658	GCAAG	2	10	198513	198522	40 %	0 %	40 %	20 %	556573446
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231	NC_022658	GGCGC	2	10	241550	241559	0 %	0 %	60 %	40 %	556573303
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234	NC_022658	CGCGC	2	10	247674	247683	0 %	0 %	40 %	60 %	556573453
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243	NC_022658	CGGCG	2	10	258313	258322	0 %	0 %	60 %	40 %	556573153
244	NC_022658	CGATG	2	10	258463	258472	20 %	20 %	40 %	20 %	556573153
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249	NC_022658	CGAAT	2	10	268824	268833	40 %	20 %	20 %	20 %	556573146
250	NC_022658	TGCGC	2	10	269497	269506	0 %	20 %	40 %	40 %	556573146
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253	NC_022658	CGAGC	2	10	271262	271271	20 %	0 %	40 %	40 %	556573060
254	NC_022658	GCGAC	2	10	272041	272050	20 %	0 %	40 %	40 %	556573060
255	NC_022658	CGCGG	2	10	272981	272990	0 %	0 %	60 %	40 %	556572133
256	NC_022658	GCGCG	2	10	273214	273223	0 %	0 %	60 %	40 %	556572133
257	NC_022658	TCGGA	2	10	273576	273585	20 %	20 %	40 %	20 %	556572520
258	NC_022658	GCGTC	2	10	275764	275773	0 %	20 %	40 %	40 %	556572545
259	NC_022658	AGCGC	2	10	275839	275848	20 %	0 %	40 %	40 %	556572545
260	NC_022658	CGCAG	2	10	275956	275965	20 %	0 %	40 %	40 %	556572545
261	NC_022658	GCGCG	2	10	276173	276182	0 %	0 %	60 %	40 %	556572545
262	NC_022658	CGAGC	2	10	276230	276239	20 %	0 %	40 %	40 %	556572545
263	NC_022658	GCAGC	2	10	276506	276515	20 %	0 %	40 %	40 %	556572545
264	NC_022658	CCGCG	2	10	278271	278280	0 %	0 %	40 %	60 %	556573852
265	NC_022658	GGCGC	2	10	278312	278321	0 %	0 %	60 %	40 %	556573852
266	NC_022658	GCGCT	2	10	278870	278879	0 %	20 %	40 %	40 %	556573852
267	NC_022658	CCCAC	2	10	279689	279698	20 %	0 %	0 %	80 %	556572148
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382	NC_022658	TCGCC	2	10	431471	431480	0 %	20 %	20 %	60 %	556573775
383	NC_022658	GCTGC	2	10	432121	432130	0 %	20 %	40 %	40 %	556573674
384	NC_022658	CGCGC	2	10	436311	436320	0 %	0 %	40 %	60 %	556572233
385	NC_022658	TGGTC	2	10	436637	436646	0 %	40 %	40 %	20 %	556572233
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389	NC_022658	TTCGG	2	10	447545	447554	0 %	40 %	40 %	20 %	556573302
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391	NC_022658	CGTGC	2	10	448615	448624	0 %	20 %	40 %	40 %	556572931
392	NC_022658	AATTT	2	10	450168	450177	40 %	60 %	0 %	0 %	556572749
393	NC_022658	CCCGT	2	10	454511	454520	0 %	20 %	20 %	60 %	556572954
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