MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 10889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022658	CGGG	2	8	99	106	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022658	GGCG	2	8	973	980	0 %	0 %	75 %	25 %	556574370
3	NC_022658	CGGA	2	8	1464	1471	25 %	0 %	50 %	25 %	556574297
4	NC_022658	AGCG	2	8	2317	2324	25 %	0 %	50 %	25 %	556574297
5	NC_022658	GCTC	2	8	3066	3073	0 %	25 %	25 %	50 %	556573384
6	NC_022658	CGGC	2	8	3396	3403	0 %	0 %	50 %	50 %	556573384
7	NC_022658	ACGT	2	8	3461	3468	25 %	25 %	25 %	25 %	556573384
8	NC_022658	CCTT	2	8	3821	3828	0 %	50 %	0 %	50 %	556573384
9	NC_022658	GGCG	2	8	4297	4304	0 %	0 %	75 %	25 %	556573384
10	NC_022658	CGTT	2	8	4378	4385	0 %	50 %	25 %	25 %	556573384
11	NC_022658	GTCG	2	8	4737	4744	0 %	25 %	50 %	25 %	556574384
12	NC_022658	TCGC	2	8	5020	5027	0 %	25 %	25 %	50 %	556574384
13	NC_022658	CGCC	2	8	5288	5295	0 %	0 %	25 %	75 %	556574384
14	NC_022658	CGGC	2	8	5382	5389	0 %	0 %	50 %	50 %	556574384
15	NC_022658	ACGG	2	8	5396	5403	25 %	0 %	50 %	25 %	556574384
16	NC_022658	AGCG	2	8	6423	6430	25 %	0 %	50 %	25 %	556571935
17	NC_022658	TCGA	2	8	6480	6487	25 %	25 %	25 %	25 %	556571935
18	NC_022658	ATCG	2	8	6849	6856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022658	CGCC	2	8	6862	6869	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_022658	TTCG	2	8	7111	7118	0 %	50 %	25 %	25 %	556572417
21	NC_022658	CCCG	2	8	7377	7384	0 %	0 %	25 %	75 %	556572417
22	NC_022658	GAAT	2	8	7496	7503	50 %	25 %	25 %	0 %	556572417
23	NC_022658	GCCG	2	8	7523	7530	0 %	0 %	50 %	50 %	556572417
24	NC_022658	GCCG	2	8	7689	7696	0 %	0 %	50 %	50 %	556572417
25	NC_022658	GTCC	2	8	8109	8116	0 %	25 %	25 %	50 %	556572139
26	NC_022658	CGAC	2	8	8696	8703	25 %	0 %	25 %	50 %	556572139
27	NC_022658	CGAC	2	8	8921	8928	25 %	0 %	25 %	50 %	556572139
28	NC_022658	CGGC	2	8	9314	9321	0 %	0 %	50 %	50 %	556572139
29	NC_022658	TCGG	2	8	9376	9383	0 %	25 %	50 %	25 %	556572139
30	NC_022658	CGAC	2	8	9386	9393	25 %	0 %	25 %	50 %	556572139
31	NC_022658	GCAC	2	8	9515	9522	25 %	0 %	25 %	50 %	556572139
32	NC_022658	GGCG	2	8	9552	9559	0 %	0 %	75 %	25 %	556572139
33	NC_022658	TCTT	2	8	9776	9783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022658	CGTG	2	8	10142	10149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022658	GCGA	2	8	10343	10350	25 %	0 %	50 %	25 %	556573124
36	NC_022658	CGAG	2	8	10608	10615	25 %	0 %	50 %	25 %	556572373
37	NC_022658	CGAA	2	8	10665	10672	50 %	0 %	25 %	25 %	556572373
38	NC_022658	CGCT	2	8	10880	10887	0 %	25 %	25 %	50 %	556572373
39	NC_022658	GCTG	2	8	11391	11398	0 %	25 %	50 %	25 %	556572373
40	NC_022658	GGCT	2	8	11732	11739	0 %	25 %	50 %	25 %	556572373
41	NC_022658	GTCG	2	8	11881	11888	0 %	25 %	50 %	25 %	556572373
42	NC_022658	TGGG	2	8	12842	12849	0 %	25 %	75 %	0 %	556572373
43	NC_022658	CGGC	2	8	12939	12946	0 %	0 %	50 %	50 %	556572373
44	NC_022658	CGCA	2	8	13016	13023	25 %	0 %	25 %	50 %	556572373
45	NC_022658	CGGC	2	8	13278	13285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022658	GCCG	2	8	13297	13304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022658	CGCC	2	8	13371	13378	0 %	0 %	25 %	75 %	556573401
48	NC_022658	GCCG	2	8	14168	14175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022658	CGCC	2	8	14297	14304	0 %	0 %	25 %	75 %	556572976
50	NC_022658	GCAT	2	8	14559	14566	25 %	25 %	25 %	25 %	556572976
51	NC_022658	GAAA	2	8	14862	14869	75 %	0 %	25 %	0 %	556572856
52	NC_022658	CGCA	2	8	15376	15383	25 %	0 %	25 %	50 %	556572856
53	NC_022658	CGGC	2	8	15847	15854	0 %	0 %	50 %	50 %	556572856
54	NC_022658	CCGG	2	8	15960	15967	0 %	0 %	50 %	50 %	556572856
55	NC_022658	GCCC	2	8	16028	16035	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_022658	TTTC	2	8	16109	16116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022658	CCCG	2	8	16131	16138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_022658	GACC	2	8	16546	16553	25 %	0 %	25 %	50 %	556571843
59	NC_022658	CGAC	2	8	16572	16579	25 %	0 %	25 %	50 %	556571843
60	NC_022658	CGGC	2	8	17175	17182	0 %	0 %	50 %	50 %	556571843
61	NC_022658	GATC	2	8	17761	17768	25 %	25 %	25 %	25 %	556571843
62	NC_022658	GGCG	2	8	18295	18302	0 %	0 %	75 %	25 %	556571843
63	NC_022658	GCGG	2	8	19029	19036	0 %	0 %	75 %	25 %	556574339
64	NC_022658	GGCC	2	8	19039	19046	0 %	0 %	50 %	50 %	556574339
65	NC_022658	GGCC	2	8	19393	19400	0 %	0 %	50 %	50 %	556574339
66	NC_022658	TCCA	2	8	19721	19728	25 %	25 %	0 %	50 %	556572629
67	NC_022658	GCCG	2	8	20395	20402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022658	CGAG	2	8	20513	20520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022658	CGGC	2	8	21763	21770	0 %	0 %	50 %	50 %	556573075
70	NC_022658	GCCG	2	8	21973	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022658	CCGG	2	8	22042	22049	0 %	0 %	50 %	50 %	556574083
72	NC_022658	ACGG	2	8	22815	22822	25 %	0 %	50 %	25 %	556574083
73	NC_022658	CGAA	2	8	23188	23195	50 %	0 %	25 %	25 %	556574083
74	NC_022658	CGGG	2	8	23454	23461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022658	GCCG	2	8	23956	23963	0 %	0 %	50 %	50 %	556574424
76	NC_022658	TCGA	2	8	24038	24045	25 %	25 %	25 %	25 %	556574424
77	NC_022658	GACC	2	8	24046	24053	25 %	0 %	25 %	50 %	556574424
78	NC_022658	ATCG	2	8	24103	24110	25 %	25 %	25 %	25 %	556574424
79	NC_022658	CGAA	2	8	24219	24226	50 %	0 %	25 %	25 %	556574424
80	NC_022658	GGCC	2	8	24649	24656	0 %	0 %	50 %	50 %	556574424
81	NC_022658	TCGC	2	8	25252	25259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022658	ACGC	2	8	25316	25323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022658	TCCA	2	8	25992	25999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022658	CGAG	2	8	26141	26148	25 %	0 %	50 %	25 %	556572311
85	NC_022658	CGTC	2	8	26297	26304	0 %	25 %	25 %	50 %	556572311
86	NC_022658	CGAT	2	8	27172	27179	25 %	25 %	25 %	25 %	556572311
87	NC_022658	CGGC	2	8	27253	27260	0 %	0 %	50 %	50 %	556572311
88	NC_022658	ACCG	2	8	27486	27493	25 %	0 %	25 %	50 %	556572311
89	NC_022658	TCGA	2	8	27772	27779	25 %	25 %	25 %	25 %	556572311
90	NC_022658	TCGC	2	8	28066	28073	0 %	25 %	25 %	50 %	556572311
91	NC_022658	GCAG	2	8	28210	28217	25 %	0 %	50 %	25 %	556572311
92	NC_022658	CCGG	2	8	28367	28374	0 %	0 %	50 %	50 %	556572311
93	NC_022658	GCTC	2	8	28427	28434	0 %	25 %	25 %	50 %	556572311
94	NC_022658	CCGG	2	8	28800	28807	0 %	0 %	50 %	50 %	556572311
95	NC_022658	GTCG	2	8	29007	29014	0 %	25 %	50 %	25 %	556572311
96	NC_022658	GCCG	2	8	29250	29257	0 %	0 %	50 %	50 %	556572311
97	NC_022658	GGGC	2	8	29380	29387	0 %	0 %	75 %	25 %	556572311
98	NC_022658	TATT	2	8	29542	29549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022658	TACG	2	8	30476	30483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022658	CAGG	2	8	30522	30529	25 %	0 %	50 %	25 %	556573095
101	NC_022658	CACC	2	8	30929	30936	25 %	0 %	0 %	75 %	556573095
102	NC_022658	CCAC	2	8	31462	31469	25 %	0 %	0 %	75 %	556572828
103	NC_022658	AGCG	2	8	31811	31818	25 %	0 %	50 %	25 %	556572828
104	NC_022658	GCCG	3	12	32001	32012	0 %	0 %	50 %	50 %	556572828
105	NC_022658	GCTT	2	8	32520	32527	0 %	50 %	25 %	25 %	556572828
106	NC_022658	CCGT	2	8	32540	32547	0 %	25 %	25 %	50 %	556572828
107	NC_022658	CCCG	2	8	33715	33722	0 %	0 %	25 %	75 %	556572828
108	NC_022658	GCGG	2	8	33742	33749	0 %	0 %	75 %	25 %	556572828
109	NC_022658	CAGC	2	8	34061	34068	25 %	0 %	25 %	50 %	556572828
110	NC_022658	GCCG	2	8	34258	34265	0 %	0 %	50 %	50 %	556572828
111	NC_022658	TCCG	2	8	34656	34663	0 %	25 %	25 %	50 %	556572828
112	NC_022658	GCCG	2	8	35159	35166	0 %	0 %	50 %	50 %	556572828
113	NC_022658	CGGC	2	8	35338	35345	0 %	0 %	50 %	50 %	556572828
114	NC_022658	GCCG	2	8	35468	35475	0 %	0 %	50 %	50 %	556572828
115	NC_022658	GCCG	2	8	35489	35496	0 %	0 %	50 %	50 %	556572828
116	NC_022658	CACG	2	8	35749	35756	25 %	0 %	25 %	50 %	556572113
117	NC_022658	CCGG	2	8	35768	35775	0 %	0 %	50 %	50 %	556572113
118	NC_022658	CCGG	2	8	36208	36215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022658	TGCG	2	8	36508	36515	0 %	25 %	50 %	25 %	556572274
120	NC_022658	CGCC	2	8	36752	36759	0 %	0 %	25 %	75 %	556572274
121	NC_022658	TGGC	2	8	36903	36910	0 %	25 %	50 %	25 %	556572274
122	NC_022658	GCGA	2	8	37306	37313	25 %	0 %	50 %	25 %	556572274
123	NC_022658	CGGT	2	8	37345	37352	0 %	25 %	50 %	25 %	556572274
124	NC_022658	GTCC	2	8	37628	37635	0 %	25 %	25 %	50 %	556572274
125	NC_022658	CGGC	2	8	37744	37751	0 %	0 %	50 %	50 %	556572274
126	NC_022658	AGCG	2	8	37767	37774	25 %	0 %	50 %	25 %	556572274
127	NC_022658	CCGA	2	8	38312	38319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022658	CTCG	2	8	39318	39325	0 %	25 %	25 %	50 %	556572974
129	NC_022658	CGGC	2	8	39392	39399	0 %	0 %	50 %	50 %	556572974
130	NC_022658	GCTG	2	8	39423	39430	0 %	25 %	50 %	25 %	556572974
131	NC_022658	CCCG	2	8	39516	39523	0 %	0 %	25 %	75 %	556572974
132	NC_022658	GCCG	2	8	39723	39730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022658	CGAT	2	8	40055	40062	25 %	25 %	25 %	25 %	556573462
134	NC_022658	CCAG	2	8	40261	40268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022658	TAGA	2	8	40636	40643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022658	CAGC	2	8	40665	40672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022658	TCGG	2	8	40840	40847	0 %	25 %	50 %	25 %	556573988
138	NC_022658	ACCG	2	8	40933	40940	25 %	0 %	25 %	50 %	556573988
139	NC_022658	TCGC	2	8	41446	41453	0 %	25 %	25 %	50 %	556573988
140	NC_022658	CTGC	2	8	41716	41723	0 %	25 %	25 %	50 %	556574052
141	NC_022658	GCCG	2	8	41731	41738	0 %	0 %	50 %	50 %	556574052
142	NC_022658	CGAG	2	8	42078	42085	25 %	0 %	50 %	25 %	556574052
143	NC_022658	GCGG	2	8	42140	42147	0 %	0 %	75 %	25 %	556574052
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159	NC_022658	CCGC	2	8	48271	48278	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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181	NC_022658	GCCG	2	8	53345	53352	0 %	0 %	50 %	50 %	556573599
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187	NC_022658	GCCG	2	8	54493	54500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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262	NC_022658	CGCC	2	8	80465	80472	0 %	0 %	25 %	75 %	556573873
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266	NC_022658	ATCG	2	8	80951	80958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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268	NC_022658	CGGC	2	8	81027	81034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
269	NC_022658	TCGC	2	8	81255	81262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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271	NC_022658	CCGA	2	8	82508	82515	25 %	0 %	25 %	50 %	556572175
272	NC_022658	ATCG	2	8	82581	82588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
273	NC_022658	TCGG	2	8	83110	83117	0 %	25 %	50 %	25 %	556572393
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281	NC_022658	CGCC	2	8	85581	85588	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
282	NC_022658	GCCG	2	8	85770	85777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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401	NC_022658	CGAT	2	8	113411	113418	25 %	25 %	25 %	25 %	556574433
402	NC_022658	GCCG	2	8	114150	114157	0 %	0 %	50 %	50 %	556574433
403	NC_022658	CGAT	2	8	114630	114637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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413	NC_022658	GCCG	2	8	118870	118877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
414	NC_022658	CGGC	2	8	119128	119135	0 %	0 %	50 %	50 %	556574173
415	NC_022658	CGAG	2	8	119581	119588	25 %	0 %	50 %	25 %	556574173
416	NC_022658	GAAG	2	8	119732	119739	50 %	0 %	50 %	0 %	556574173
417	NC_022658	CGGT	2	8	120108	120115	0 %	25 %	50 %	25 %	556572892
418	NC_022658	TCGC	2	8	120225	120232	0 %	25 %	25 %	50 %	556572892
419	NC_022658	TCCA	2	8	120324	120331	25 %	25 %	0 %	50 %	556572892
420	NC_022658	GCGA	2	8	120726	120733	25 %	0 %	50 %	25 %	556572537
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497	NC_022658	CGAA	2	8	146555	146562	50 %	0 %	25 %	25 %	556573640
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