MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022656	TTTGTA	2	12	36	47	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022656	AAAAAT	2	12	581	592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022656	AGTAGA	2	12	1750	1761	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556561980
4	NC_022656	TGGAGC	2	12	4092	4103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556561984
5	NC_022656	TTAAGC	2	12	6342	6353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556561986
6	NC_022656	AATTTT	2	12	8254	8265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022656	TGCAAA	2	12	9040	9051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556561989
8	NC_022656	TTAGGT	2	12	9710	9721	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556561990
9	NC_022656	CAAAAG	2	12	11158	11169	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	556561992
10	NC_022656	AATACA	2	12	11867	11878	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556561993
11	NC_022656	GAAAAT	2	12	15232	15243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022656	CAAAAA	2	12	16702	16713	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	556561999
13	NC_022656	GATAAA	2	12	18402	18413	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556562000
14	NC_022656	ATTTAA	2	12	21438	21449	50 %	50 %	0 %	0 %	556562003
15	NC_022656	ATCATT	2	12	22922	22933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	556562006
16	NC_022656	GCTTAA	2	12	23477	23488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556562007
17	NC_022656	TTCTTT	2	12	24280	24291	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556562009
18	NC_022656	ATTTTC	2	12	24712	24723	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556562009
19	NC_022656	TTTTCT	2	12	25091	25102	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556562009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.